| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略语及专有词汇检索表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-22页 |
| 1 群体感应系统 | 第14-17页 |
| 1.1 群体感应系统的概念及作用机制 | 第14页 |
| 1.2 群体感应信号分子 | 第14-17页 |
| 1.2.1 AI-2信号分子及生理功能 | 第14-15页 |
| 1.2.2 AI-2群感信号的分子调控机制 | 第15-17页 |
| 2 根际有益芽孢杆菌的生物膜形成与根际定殖 | 第17-19页 |
| 2.1 细菌生物膜简介 | 第17-18页 |
| 2.1.1 细菌生物膜的形成过程 | 第17-18页 |
| 2.1.2 细菌生物膜的形成机制 | 第18页 |
| 2.2 细菌生物膜检测方法 | 第18页 |
| 2.2.1 试管法 | 第18页 |
| 2.2.2 96孔微量板法 | 第18页 |
| 2.3 有益菌的根际定殖 | 第18-19页 |
| 2.4 生物膜形成能力是影响细菌根际定殖的重要因素 | 第19页 |
| 3 群感信号影响细菌定殖能力 | 第19-20页 |
| 3.1 群感信号分子AI-2对生物膜形成的影响 | 第19页 |
| 3.2 群感信号分子AI-2对细菌运动性的影响 | 第19-20页 |
| 4 菌株SQR9中AI-2群感信号及其功能 | 第20页 |
| 5 本研究的立题依据和意义 | 第20-21页 |
| 6 技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 LUXS-AI-2型密度感应系统对解淀粉芽孢杆菌SQR9菌株生物膜形成及根际定殖的影响 | 第22-44页 |
| 1 材料与方法 | 第22-33页 |
| 1.1 材料 | 第22-24页 |
| 1.2 方法 | 第24-33页 |
| 1.2.1 细菌基因组提取 | 第24页 |
| 1.2.2 质粒提取 | 第24-25页 |
| 1.2.3 luxS基因的敲除 | 第25-27页 |
| 1.2.4 SQR9以及突变体SQR9-ΔluxS的生物膜形成和定量分析 | 第27-28页 |
| 1.2.5 SQR9以及突变体SQR9-ΔluxS的运动性的测定 | 第28页 |
| 1.2.6 SQR9以及突变体SQR9-ΔluxS的细胞外多糖(EPS)的测定 | 第28页 |
| 1.2.7 SQR9以及突变体SQR9-ΔluxS的生长曲线的测定 | 第28页 |
| 1.2.8 群感信号分子AI-2在SQR9不同培养时期的测定 | 第28-29页 |
| 1.2.8.1 AI-2获取,活性测定 | 第28-29页 |
| 1.2.8.1.1 AI-2获取 | 第28页 |
| 1.2.8.1.2 AI-2活性测定 | 第28-29页 |
| 1.2.8.2 AI-2浓度定量测定 | 第29页 |
| 1.2.8.3 不同培养时间的SQR9菌体上清的AI-2的浓度定量 | 第29页 |
| 1.2.9 突变体SQR9-ΔluxS的互补 | 第29-32页 |
| 1.2.9.1 表达载体pNW33N-luxS的构建 | 第29-31页 |
| 1.2.9.2 表达载体pNW33N-luxS转入突变体SQR9-ΔluxS | 第31-32页 |
| 1.2.10 SQR9菌株和突变体SQR9-ΔluxS在黄瓜和番茄根际原位定殖的影响 | 第32-33页 |
| 1.2.10.1 SQR9及突变体SQR9-ΔluxS的绿色荧光蛋白(GFP)标记 | 第32页 |
| 1.2.10.2 SQR9以及突变体SQR9-ΔluxS的根际定殖分析 | 第32-33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-42页 |
| 2.1 luxS基因的敲除 | 第33-34页 |
| 2.2 AI-2信号分子减弱SQR9菌株生物膜的形成 | 第34-35页 |
| 2.3 AI-2号降低SQR9菌株细胞的swimming和swarming运动性 | 第35-36页 |
| 2.4 AI-2信号抑制SQR9菌株产细胞外多糖(EPS) | 第36-37页 |
| 2.5 SQR9与突变体SQR9-ΔluxS的生长曲线差异 | 第37-38页 |
| 2.6 群感信号分子AI-2在菌株中的测定 | 第38-39页 |
| 2.6.1 AI-2活性的测定 | 第38页 |
| 2.6.2 AI-2浓度的测定 | 第38-39页 |
| 2.7 突变体SQR9-ΔluxS的互补和SQR9-ΔluxS-gfp的互补 | 第39-40页 |
| 2.8 AI-2对SQR9菌株在黄瓜和番茄根际成膜定殖的影响 | 第40-42页 |
| 3 讨论 | 第42-43页 |
| 4 小结 | 第43-44页 |
| 第三章 LUXS-AI-2型密度感应系统对解淀粉芽孢杆菌SQR9基因转录影响的分析 | 第44-50页 |
| 1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 1.1 材料 | 第44页 |
| 1.2 方法 | 第44-45页 |
| 1.2.1 生物膜及运动性相关基因的定量 | 第44-45页 |
| 1.2.2 转录组样品准备 | 第45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-48页 |
| 2.1 生物膜与运动性相关基因定量 | 第45-47页 |
| 2.2 转录组数据分析 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-49页 |
| 4 小结 | 第49-50页 |
| 第四章 LUXS-AI-2型信号在解淀粉芽孢杆菌SQR9中的可能受体蛋白分析 | 第50-58页 |
| 1 材料及方法 | 第51-52页 |
| 1.1 基因组序列 | 第51页 |
| 1.2 计算工具 | 第51页 |
| 1.3 远距离同源蛋白序列搜索 | 第51-52页 |
| 1.4 已知AI-2受体蛋白分析 | 第52页 |
| 2 结果与分析 | 第52-55页 |
| 2.1 解淀粉芽孢杆菌SQR9中的rbs操纵子搜索 | 第52-54页 |
| 2.2 解淀粉芽孢杆菌SQR9中的lsr操纵子搜索 | 第54-55页 |
| 3 讨论 | 第55-56页 |
| 4 小结 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 全文结论 | 第64-66页 |
| 创新点 | 第66-68页 |
| 展望 | 第68-70页 |
| 附录 | 第70-72页 |
| 硕士期间已(待)发表的论文 | 第72-74页 |
| 致谢 | 第74页 |
