| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-24页 |
| ·氮素循环 | 第11页 |
| ·硝化作用 | 第11页 |
| ·氨氧化细菌及其分类 | 第11-15页 |
| ·基于16S rRNA 基因序列同源性对于氨氧化细菌的分类 | 第12-13页 |
| ·基于氨氧化细菌的功能基因氨单加氧酶基因（amoA）对氨氧化细菌的分类 | 第13-14页 |
| ·基于16S rRNA 基因序列分析与amoA 基因序列分析相比较 | 第14-15页 |
| ·氨氧化细菌的分子生物学研究方法 | 第15-19页 |
| ·变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis，DGGE）和温度梯度凝胶电泳（Temperature Gradient Gel Electrophoresis，TGGE） | 第16-17页 |
| ·限制性片段长度多态性分析（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP） | 第17-18页 |
| ·末端限制性片段长度多态性分析（Terminal Restriction Fragment Polymorphism，T-RFLP） | 第18页 |
| ·单链构象多态性分析（Single-strand-conformation polymorphism | 第18-19页 |
| ·克隆文库构建和序列分析 | 第19页 |
| ·土壤中氨氧化细菌多样性及其群落结构的影响因素 | 第19-22页 |
| ·土壤的pH 值 | 第19-20页 |
| ·氮素水平 | 第20-21页 |
| ·土壤的温度 | 第21页 |
| ·盐度 | 第21-22页 |
| ·土壤氧气含量 | 第22页 |
| ·土壤污染物 | 第22页 |
| ·本文的研究内容与技术路线 | 第22-24页 |
| ·研究内容 | 第22-23页 |
| ·技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 材料与方法 | 第24-30页 |
| ·材料 | 第24-26页 |
| ·供试土壤 | 第24页 |
| ·试剂 | 第24-26页 |
| ·试验方法 | 第26-30页 |
| ·土样的采集 | 第26页 |
| ·土壤理化性质的测定 | 第26-27页 |
| ·土壤氨氧化细菌的RFLP 分型分析 | 第27-30页 |
| 第三章 结果与分析 | 第30-49页 |
| ·土壤中总DNA 的提取 | 第30页 |
| ·氨氧化细菌的amoA 基因片段PCR 扩增 | 第30-31页 |
| ·amoA 基因克隆文库的菌落PCR | 第31页 |
| ·氨氧化细菌克隆文库amoA 的酶切聚类分析 | 第31-43页 |
| ·不同处理土壤样品中氨氧化细菌多样性指数比较 | 第43-44页 |
| ·不同施肥处理土样中amoA 基因不同酶切类型的聚类分析 | 第44-47页 |
| ·序列测定和系统发育分析 | 第47-49页 |
| 第四章 讨论 | 第49-52页 |
| ·土壤总DNA 的提取与纯化 | 第49页 |
| ·关于amoA 基因在氨氧化细菌多样性研究中的作用 | 第49-50页 |
| ·关于amoA 基因克隆文库的构建 | 第50页 |
| ·不同施肥处理对土壤氨氧化细菌的多样性影响 | 第50页 |
| ·不同施肥处理对土壤氨氧化细菌的群落结构影响 | 第50-52页 |
| 第五章 结论与展望 | 第52-54页 |
| ·结论 | 第52页 |
| ·研究展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 附录 | 第59-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简介 | 第70页 |
