| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第10页 |
| 1.2 必需基因的识别 | 第10-12页 |
| 1.3 本论文的结构安排 | 第12-14页 |
| 第二章 基于蛋白质结构域的必需基因预测算法 | 第14-25页 |
| 2.1 引言 | 第14页 |
| 2.2 蛋白质结构域知识 | 第14-15页 |
| 2.3 基于蛋白质结构域的必需基因预测算法 | 第15-20页 |
| 2.3.1 实验数据的选择 | 第16-17页 |
| 2.3.2 实验方法 | 第17-18页 |
| 2.3.3 实验结果及分析 | 第18-20页 |
| 2.4 基于物种亲缘性及蛋白质结构域的必需基因预测算法 | 第20-25页 |
| 2.4.1 Cvtree理论 | 第21页 |
| 2.4.2 算法的实现 | 第21-23页 |
| 2.4.3 实验结果 | 第23-25页 |
| 第三章 对Geptop软件的改进 | 第25-38页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 Geptop的改进 | 第25-34页 |
| 3.2.1 参考集的筛选 | 第26-30页 |
| 3.2.2 评分公式的改进 | 第30-31页 |
| 3.2.3 对程序运行效率的改进 | 第31-34页 |
| 3.3 阈值的选择 | 第34-37页 |
| 3.4 小结 | 第37-38页 |
| 第四章 Geptop与蛋白质结构域的结合预测方法 | 第38-48页 |
| 4.1 引言 | 第38页 |
| 4.2 Geptop与蛋白质结构域结合预测算法 | 第38-47页 |
| 4.2.1 参考集的选择 | 第38页 |
| 4.2.2 结合方法 | 第38-47页 |
| 4.3 小结 | 第47-48页 |
| 第五章 全文总结及展望 | 第48-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 攻读硕士学位期间取得的成果 | 第55-56页 |