生物代谢网络的混合Petri网建模与分析
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 1 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第8-10页 |
| 1.2 研究意义 | 第10页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第10-13页 |
| 1.3.1 Petri网建模发展历程 | 第10-11页 |
| 1.3.2 生物代谢网络Petri网建模研究现状 | 第11-13页 |
| 1.4 论文结构 | 第13-14页 |
| 2 研究相关基础知识 | 第14-26页 |
| 2.1 Petri网 | 第14-21页 |
| 2.1.1 Petri网基本定义 | 第14-15页 |
| 2.1.2 Petri网系统定义 | 第15-16页 |
| 2.1.3 Petri网性质 | 第16-21页 |
| 2.2 Petri网建模可行性分析 | 第21-24页 |
| 2.2.1 Petri网生物建模分析与对比 | 第21-22页 |
| 2.2.2 建模常用扩展Petri网类型 | 第22-24页 |
| 2.3 建模工具SNOOPY | 第24-25页 |
| 2.4 本章小结 | 第25-26页 |
| 3 基于混合Petri网的生物代谢网络建模 | 第26-41页 |
| 3.1 三羧酸循环 | 第26-29页 |
| 3.2 混合Petri网 | 第29-31页 |
| 3.3 混合Petri网生物代谢网络建模方法 | 第31-35页 |
| 3.3.1 米曼氏方程 | 第31-33页 |
| 3.3.2 建模步骤 | 第33-35页 |
| 3.4 三羧酸循环建模 | 第35-39页 |
| 3.4.1 三羧酸循环HPN模型 | 第35-38页 |
| 3.4.2 模拟结果 | 第38-39页 |
| 3.4.3 结论 | 第39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-41页 |
| 4 基于混合函数Petri网的三羧酸循环建模 | 第41-49页 |
| 4.1 三羧酸循环HPN模型的改进 | 第41-42页 |
| 4.1.1 模型改进需求 | 第41页 |
| 4.1.2 改进方向概述 | 第41-42页 |
| 4.2 三羧酸循环混合函数Petri网模型 | 第42-44页 |
| 4.2.1 网系统改进 | 第42-43页 |
| 4.2.2 系统模型改进 | 第43页 |
| 4.2.3 系统变迁发生机制 | 第43-44页 |
| 4.3 HFPN系统状态输出算法 | 第44-48页 |
| 4.3.1 状态输出算法 | 第44-45页 |
| 4.3.2 算法运行机制 | 第45-46页 |
| 4.3.3 算法应用简例 | 第46-48页 |
| 4.4 结论 | 第48页 |
| 4.5 本章小结 | 第48-49页 |
| 5 总结 | 第49-51页 |
| 6 展望 | 第51-52页 |
| 7 参考文献 | 第52-58页 |
| 8 攻读硕士学位期间论文发表情况 | 第58-59页 |
| 9 致谢 | 第59页 |
