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大白菜BrANT基因克隆及功能分析

摘要第2-4页
Summary第4-6页
前言第11-12页
第一章 文献综述第12-20页
    1.1 植物中AP2/EREB基因家族研究进展第12-17页
        1.1.1 AP2/EREB基因家族结构特点与分类第12-13页
        1.1.2 AP2/EREB基因家族起源与进化第13-14页
        1.1.3 AP2/EREB转录因子的作用第14-17页
    1.2 ANT功能研究进展第17-19页
        1.2.1 ANT结构特点及分类第17-18页
        1.2.2 ANT功能第18-19页
    1.3 试验目的及意义第19-20页
第二章 AP2亚家族生物信息学分析第20-35页
    2.1 方法第20-21页
        2.1.1 生物信息检索第20页
        2.1.2 大白菜AP2亚家族成员鉴定第20页
        2.1.3 序列分析方法第20页
        2.1.4 蛋白质理化性质分析第20页
        2.1.5 系统进化树构建方法第20-21页
        2.1.6 模体(Motif)结构分析第21页
        2.1.7 基因结构分析第21页
        2.1.8 简单重复序列(SSR)分析第21页
        2.1.9 基因染色体分布分析第21页
        2.1.10 大白菜AP2亚家族成员表达模式分析第21页
    2.2 结果与分析第21-33页
        2.2.1 大白菜AP2亚族成员基本信息第21-23页
        2.2.2 大白菜AP2结构域基本信息第23-25页
        2.2.3 大白菜AP2亚家族基因结构第25页
        2.2.4 大白菜AP2亚家族简单重复序列基本信息第25-26页
        2.2.5 大白菜亚家族成员共线性信息第26-27页
        2.2.6 大白菜AP2亚家族染色体定位第27-28页
        2.2.7 大白菜AP2亚家族氨基酸序列比对分析第28-29页
        2.2.8 AP2亚家族系统进化分析第29-30页
        2.2.9 大白菜AP2亚家族进化树及模体分析第30-32页
        2.2.10 大白菜AP2亚家族基因表达模式分析第32-33页
    2.3 小结第33-35页
第三章 大白菜Br ANT基因克隆与功能分析第35-57页
    3.1 材料第35-36页
        3.1.1 试验材料第35页
        3.1.2 大肠杆菌、农杆菌菌株和载体第35-36页
        3.1.3 生化试剂第36页
    3.2 方法第36-45页
        3.2.1 植物组织DNA提取第36页
        3.2.2 RNA提取第36-37页
        3.2.3 反转录第37页
        3.2.4 荧光定量PCR引物设计及反应参数第37-38页
        3.2.5 DNA胶回收第38页
        3.2.6 质粒提取第38-39页
        3.2.7 目的基因克隆第39-40页
        3.2.8 目的基因转化克隆载体第40-41页
        3.2.9 超表达载体构建第41-42页
        3.2.10 农杆菌转化第42页
        3.2.11 农杆菌介导拟南芥转化第42-44页
        3.2.12 转基因拟南芥筛选第44页
        3.2.13 PCR检测转基因植株第44页
        3.2.14 转基因植株表型形状研究第44-45页
    3.3 结果与分析第45-55页
        3.3.1 基因克隆第45页
        3.3.2 大白菜Br ANT基因家族表达模式分析第45-48页
        3.3.3 转基因株系目的基因表达分析第48-49页
        3.3.4 转基因植株幼苗表型分析第49-51页
        3.3.5 转基因(35s:Br ANT2)拟南芥成熟期表型分析第51-53页
        3.3.6 温度胁迫对转基因拟南芥幼苗影响第53-54页
        3.3.7 盐胁迫对转基因拟南芥幼苗影响第54-55页
    3.4 讨论第55-57页
第四章 转基因(35S:Br ANT2)拟南芥转录组分析第57-75页
    4.1 材料第57页
        4.1.1 试验材料第57页
        4.1.2 生化试剂第57页
    4.2 方法第57-62页
        4.2.1 RNA提取及反转录第57页
        4.2.2 转录组测序第57页
        4.2.3 文库构建第57-58页
        4.2.4 文库质量检测及上机测序第58页
        4.2.5 测序数据及其质量控制第58-59页
        4.2.6 测序数据生物信息学分析第59-61页
        4.2.7 差异表达基因的荧光实时定量PCR(RT-qPCR)验证第61页
        4.2.8 差异表达基因的GO功能显著性富集分析第61-62页
    4.3 结果与分析第62-72页
        4.3.1 RNA-Seq测序数据质量分析第62-65页
        4.3.2 RNA-Seq测序数据分析第65-66页
        4.3.3 基因表达模式分析第66-70页
        4.3.4 差异表达基因的RT-q PCR验证第70-72页
    4.4 讨论第72-75页
        4.4.1 参与调控细胞生长的差异表达基因第72-73页
        4.4.2 光形态建成相关差异表达基因第73页
        4.4.3 生长发育相关差异表达基因第73-74页
        4.4.4 编码钙信号传导相关蛋白的差异表达基因第74页
        4.4.5 衰老相关蛋白的差异表达基因第74-75页
第五章 结论第75-76页
附录1:真核克隆载体pMD 18-T图谱第76-77页
附录2:过量表达载体pCAMBIA2300-35S-OCS图谱第77-78页
附录3:DNA、RNA质量检测图片第78-79页
附录4:PMD18-T- Br ANT2和pCAMBIA-35S-OCS空载体的双酶切第79-80页
附录5:pCAMBIA-35S-OCS-Br ANT2菌落PCR及双酶切检测第80-81页
附录6:转基因植株纯合体筛选第81-82页
参考文献第82-96页
致谢第96-97页
导师简介第97-98页
作者简介第98-99页

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