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少孢节丛孢中5个生物合成基因与真菌形态和次生代谢产物组学关联的初步探究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 真菌生物合成基因的研究进展第13-27页
    前言第13页
    1 真菌生物合成基因的主要类型第13-22页
        1.1 聚酮合酶基因第13-15页
        1.2 萜类合成酶基因第15-17页
        1.3 非核糖体多肽合成酶基因第17-20页
        1.4 细胞色素P450基因第20-22页
        1.5 其他一些修饰酶基因第22页
    2 真菌生物合成基因对其自身的影响第22-24页
    3 本论文的研究意义、内容和方法第24-27页
第二章 少孢节丛孢中5个生物合成基因的筛选、敲除和验证第27-64页
    1 实验材料与方法第27-44页
        1.1 实验材料第27-30页
            1.1.1 供试菌株及质粒第27页
            1.1.2 主要试剂及试剂盒第27页
            1.1.3 供试培养基第27-28页
            1.1.4 溶液的配制第28-29页
            1.1.5 仪器与设备第29-30页
        1.2 研究方法第30-44页
            1.2.1 基因功能分析第30页
            1.2.2 敲除载体的构建第30-38页
            1.2.3 原生质体的制备及转化第38-42页
            1.2.4 敲除转化子的筛选及PCR验证第42-43页
            1.2.5 敲除株的Southern blot验证第43-44页
    2 实验结果与分析第44-62页
        2.1 基因功能分析第44-52页
            2.1.1 聚酮合酶基因第45-46页
            2.1.2 萜类合成酶基因第46-47页
            2.1.3 细胞色素P450基因第47-52页
        2.2 敲除载体的构建第52-59页
            2.2.1 上下游片段扩增第52-53页
            2.2.2 上下游同源片段连接和酶切验证第53-58页
            2.2.3 全长片段扩增第58-59页
        2.3 转化子的PCR验证第59-61页
            2.3.1 基因AOL_s00043g740敲除转化子的验证第59页
            2.3.2 基因AOL_s00079g224敲除转化子的验证第59-60页
            2.3.3 基因AOL_s00079g225敲除转化子的验证第60页
            2.3.4 基因AOL_s00079g496-KS敲除转化子的验证第60页
            2.3.5 基因AOL_s00079g496-KR敲除转化子的验证第60-61页
            2.3.6 基因AOL_s00210g57敲除转化子的验证第61页
        2.4 敲除突变株的Southern blot验证第61-62页
            2.4.1 探针片段的扩增第61-62页
            2.4.2 Southern blot验证第62页
    3 小结与讨论第62-64页
第三章 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株表型特征的比较和分析第64-80页
    1 实验材料与方法第64-65页
        1.1 实验材料第64页
            1.1.1 供试菌株及线虫第64页
            1.1.2 供试培养基第64页
            1.1.3 仪器与设备第64页
        1.2 研究方法第64-65页
            1.2.1 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株生长速率的比较第64页
            1.2.2 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株产孢量及孢子萌发率的比较第64-65页
            1.2.3 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株捕食能力的比较第65页
    2 实验结果与分析第65-78页
        2.1 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株生长速率和形态的比较第65-70页
            2.1.1 聚酮合酶基因AOL_s00079g496不同结构域敲除后对少孢节丛孢生长速率和形态的影响第65-67页
            2.1.2 萜类合成酶基因AOL_s00079g224敲除后对少孢节丛孢生长速率和形态的影响第67-68页
            2.1.3 三个P450基因分别敲除后对少孢节丛孢生长速率和形态的影响第68-70页
        2.2 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株产孢量及孢子萌发率的比较第70-72页
            2.2.1 野生菌株与突变菌株产孢量的比较第70-71页
            2.2.2 野生菌株与突变菌株孢子萌发率的比较第71-72页
        2.3 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株捕食能力的比较第72-78页
            2.3.1 聚酮合酶基因AOL_s00079g496不同的结构域的敲除对捕食能力的影响第72-73页
            2.3.2 萜类合成酶基因AOL_s00079g224的敲除对捕食能力的影响第73-74页
            2.3.3 三个P450基因分别敲除后对少孢节丛孢捕食能力的影响第74-78页
    3 小结与讨论第78-80页
第四章 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株中次生代谢产物的比较和分析第80-110页
    1 实验材料与方法第80-82页
        1.1 实验材料第80-81页
            1.1.1 供试菌株第80页
            1.1.2 供试培养基第80页
            1.1.3 主要试剂和材料第80页
            1.1.4 仪器与设备第80-81页
        1.2 研究方法第81-82页
            1.2.1 PDB发酵培养及样品处理第81页
            1.2.2 高效液相色谱(HPLC)检测第81-82页
            1.2.3 气相色谱质谱(GC-MS)检测第82页
    2 实验结果与分析第82-98页
        2.1 聚酮合酶基因AOL_s00079g496突变菌株与野生菌株代谢产物的比较与分析第82-89页
            2.1.1 突变菌株△AOL_s00079g496-KS与野生菌株PDB发酵液代谢产物的比较与分析第82-85页
            2.1.2 突变菌株△AOL_s00079g496-KR与野生菌株PDB发酵液代谢产物的比较与分析第85-87页
            2.1.3 突变菌株△AOL_s00079g496-KS与△AOL_s00079g496-KR PDB发酵液代谢产物的比较与分析第87-89页
        2.2 萜类合成酶基因AOL_s00079g224突变菌株与野生菌株代谢产物的比较与分析第89-92页
            2.2.1 突变菌株△AOL_s00079g224与野生菌株PDB发酵液的高效液相色谱(HPLC)检测第89-90页
            2.2.2 萜类合成酶基因AOL_s00079g224突变菌株与野生菌株发酵液的气相色谱质谱(GC-MS)检测第90-92页
        2.3 三个细胞色素P450基因突变菌株与野生菌株代谢产物的比较与分析第92-98页
            2.3.1 P450基因AOL_s00043g740突变菌株与野生菌株发酵液代谢产物的比较与分析第92-94页
            2.3.2 P450基因AOL_s00079g225突变菌株与野生菌株发酵液代谢产物的比较与分析第94-96页
            2.3.3 P450基因AOL_s0021057突变菌株与野生菌株发酵液代谢产物的比较与分析第96-98页
    3 小结与讨论第98-110页
第五章 少孢节丛孢野生菌株及突变菌株基因表达谱差异的初步分析第110-114页
    1 实验材料与方法第110-114页
        1.1 实验材料第110页
            1.1.1 供试菌株第110页
            1.1.2 供试培养基第110页
            1.1.3 仪器与设备第110页
        1.2 研究方法第110页
            1.2.1 样品制备第110页
            1.2.2 基因表达谱测序与数据分析第110页
        2 实验结果与分析第110-112页
        3 小结与讨论第112-114页
全文总结与展望第114-117页
附录第117-138页
    附录1 本文中使用的质粒pAg1-H3图谱第117-118页
    附录2 野生菌株与突变菌株△AOL_s00079g496-KS PDB发酵液的GC-MS检测结果第118-121页
    附录3 野生菌株与突变菌株△AOL_s00079g496-KR PDB发酵液的GC-MS检测结果第121-124页
    附录4 突变菌株△AOL_s00079g496-KS与△AOL_s00079g496-KR PDB发酵液的GC-MS检测结果第124-126页
    附录5 野生菌株与突变菌株△AOL_s00079g224 PDB发酵液的GC-MS检测结果第126-129页
    附录6 野生菌株与突变菌株△AOL_s00043g740 PDB发酵液的GC-MS检测结果第129-132页
    附录7 野生菌株与突变菌株△AOL_s00079g225 PDB发酵液的GC-MS检测结果第132-135页
    附录8 野生菌株与突变菌株△AOL_s00210g57 PDB发酵液的GC-MS检测结果第135-138页
参考文献第138-146页
致谢第146-147页

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