| 致谢 | 第4-9页 |
| 缩写词表 | 第9-10页 |
| 摘要 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 泡桐丛枝病研究概述 | 第11-14页 |
| 1.1.1 丛枝病寄主的研究 | 第11页 |
| 1.1.2 丛枝病病原的研究 | 第11-13页 |
| 1.1.3 病原-寄主相互作用的研究 | 第13-14页 |
| 1.2 丛枝病发生与分子标记 | 第14-15页 |
| 1.2.1 分子标记的种类 | 第14页 |
| 1.2.2 丛枝病研究与分子标记 | 第14-15页 |
| 1.2.2.1 简单重复序列 (Simple sequence repeat, SSR) | 第14页 |
| 1.2.2.2 扩增片段长度多态性技术 (Amplified fragment length polymorhism，AFLP) | 第14页 |
| 1.2.2.3 甲基化敏感扩增多态性 (Methylation-sensitive amplification polymorphism, MSAP) | 第14-15页 |
| 1.3 植物转录组研究 | 第15-17页 |
| 1.3.1 转录组定义 | 第15页 |
| 1.3.2 转录组研究方法 | 第15-16页 |
| 1.3.3 转录组在植物研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.3.3.1 植物病害研究 | 第16-17页 |
| 1.3.3.2 特异基因筛选 | 第17页 |
| 1.4 表观遗传学研究 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的与技术路线 | 第18-19页 |
| 第二章 DNA甲基剂对泡桐丛枝病形态变化和DNA碱基序列的影响 | 第19-28页 |
| 引言 | 第19页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-21页 |
| 2.1.1 试验材料及处理 | 第19页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第19-21页 |
| 2.1.2.1 MMS处理对泡桐丛枝病幼苗形态变化的影响 | 第19页 |
| 2.1.2.2 DNA提取 | 第19页 |
| 2.1.2.3 MMS处理幼苗植原体Nest-PCR检测 | 第19页 |
| 2.1.2.4 MMS处理对3种泡桐丛枝病幼苗的AFLP分析 | 第19-21页 |
| 2.2 结果与分析 | 第21-27页 |
| 2.2.1 MMS处理对3种泡桐丛枝病幼苗形态变化的影响 | 第21-24页 |
| 2.2.1.1 MMS处理对白花泡桐丛枝病幼苗形态变化的影响 | 第21页 |
| 2.2.1.2 MMS处理对豫杂一号泡桐丛枝病幼苗形态变化的影响 | 第21-22页 |
| 2.2.1.3 MMS处理对毛泡桐丛枝病幼苗的形态变化的影响 | 第22-24页 |
| 2.2.2 MMS处理对3种泡桐丛枝病幼苗植原体的影响 | 第24-26页 |
| 2.2.2.1 MMS处理对白花泡桐丛枝病幼苗植原体的影响 | 第24-25页 |
| 2.2.2.2 MMS处理对豫杂一号泡桐丛枝病幼苗植原体的影响 | 第25页 |
| 2.2.2.3 MMS处理对毛泡桐丛枝病幼苗植原体的影响 | 第25-26页 |
| 2.2.3 MMS处理3种泡桐丛枝病幼苗DNA碱基序列的AFLP分析 | 第26-27页 |
| 2.2.3.1 MMS处理对白花泡桐丛枝病幼苗DNA碱基序列的AFLP分析 | 第26页 |
| 2.2.3.2 MMS处理对豫杂一号泡桐丛枝病幼苗DNA碱基序列的AFLP分析 | 第26-27页 |
| 2.2.3.3 MMS处理对毛泡桐丛枝病幼苗DNA碱基序列的AFLP分析 | 第27页 |
| 2.3 讨论 | 第27-28页 |
| 第三章 泡桐丛枝病发生与DNA甲基化变化的关系 | 第28-47页 |
| 引言 | 第28页 |
| 3.1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第28页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第28-31页 |
| 3.1.2.1 DNA提取 | 第28页 |
| 3.1.2.2 RNA提取 | 第28-29页 |
| 3.1.2.3 MSAP分析3个种泡桐丛枝病幼苗处理后DNA甲基化的变化 | 第29页 |
| 3.1.2.4 电泳凝胶谱带分析 | 第29-30页 |
| 3.1.2.5 与丛枝病相关的DNA甲基化模式的比对方案 | 第30页 |
| 3.1.2.6 DNA甲基化特异性片段的克隆与序列分析 | 第30-31页 |
| 3.1.2.7 差异片段qRT-PCR验证 | 第31页 |
| 3.2 结果与分析 | 第31-44页 |
| 3.2.1 MMS处理对3种泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化水平的作用 | 第31-33页 |
| 3.2.1.1 MMS处理对白花泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化水平的作用 | 第31-32页 |
| 3.2.1.2 MMS处理对豫杂一号泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化水平的作用 | 第32-33页 |
| 3.2.1.3 MMS处理对毛泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化水平的作用 | 第33页 |
| 3.2.2 MMS处理对3种泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化模式的作用 | 第33-38页 |
| 3.2.2.1 MMS处理对白花泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化模式的作用 | 第33-35页 |
| 3.2.2.2 MMS处理对豫杂一号泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化模式的作用 | 第35-37页 |
| 3.2.2.3 MMS处理对毛泡桐丛枝病幼苗DNA甲基化模式的作用 | 第37-38页 |
| 3.2.3 DNA甲基化特异片段的同源性分析 | 第38-42页 |
| 3.2.3.1 白花泡桐DNA甲基化特异片段的同源性分析 | 第38页 |
| 3.2.3.2 豫杂一号泡桐DNA甲基化特异片段的同源性分析 | 第38-41页 |
| 3.2.3.3 毛泡桐DNA甲基化特异片段的同源性分析 | 第41-42页 |
| 3.2.4 差异片段的qRT-PCR分析 | 第42-44页 |
| 3.2.4.1 白花泡桐差异基因的q RT-PCR分析 | 第42页 |
| 3.2.4.2 豫杂一号泡桐差异基因的qRT-PCR分析 | 第42-44页 |
| 3.3 讨论 | 第44-47页 |
| 第四章 丛枝病发生与泡桐基因表达变化的关系 | 第47-90页 |
| 引言 | 第47页 |
| 4.1 材料与方法 | 第47-50页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第47页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第47-50页 |
| 4.1.2.1 RNA提取 | 第47页 |
| 4.1.2.2 cDNA文库构建 | 第47-48页 |
| 4.1.2.3 转录组信息分析 | 第48-49页 |
| 4.1.2.4 差异表达转录本的qRT-PCR分析 | 第49-50页 |
| 4.2 结果与分析 | 第50-81页 |
| 4.2.1 2个种泡桐丛枝病幼苗转录组数据产出及统计 | 第50-52页 |
| 4.2.1.1 豫杂一号泡桐丛枝病幼苗转录组数据产出及统计 | 第50-51页 |
| 4.2.1.2 毛泡桐丛枝病幼苗转录组数据产出及统计 | 第51-52页 |
| 4.2.2 2个种泡桐丛枝病幼苗转录本ORF预测与分析 | 第52-54页 |
| 4.2.2.1 豫杂一号泡桐丛枝病幼苗转录本ORF预测与分析 | 第52-53页 |
| 4.2.2.2 毛泡桐丛枝病幼苗转录本ORF预测与分析 | 第53-54页 |
| 4.2.3 2个种泡桐丛枝病幼苗转录组功能注释 | 第54-69页 |
| 4.2.3.1 豫杂一号泡桐丛枝病幼苗转录本功能注释 | 第54-56页 |
| 4.2.3.2 毛泡桐丛枝病幼苗转录本功能注释 | 第56-69页 |
| 4.2.4 2个种泡桐丛枝病幼苗转录本差异基因及其富集分析 | 第69-78页 |
| 4.2.4.1 豫杂一号泡桐转录本差异基因及其富集分析 | 第69-72页 |
| 4.2.4.2 毛泡桐丛枝病幼苗的转录本差异及其富集分析 | 第72-78页 |
| 4.2.5 2个种泡桐丛枝病幼苗差异表达转录本的qRT-PCR分析 | 第78-81页 |
| 4.2.5.1 豫杂一号泡桐丛枝病转录组差异表达转录本的q RT-PCR分析 | 第78页 |
| 4.2.5.2 毛泡桐丛枝病转录组差异表达转录本的qRT-PCR分析 | 第78-81页 |
| 4.3 讨论 | 第81-90页 |
| 4.3.1 次生代谢相关基因 | 第81-84页 |
| 4.3.1.1 叶酸合成相关基因 | 第82-83页 |
| 4.3.1.2 类黄酮合成相关基因 | 第83-84页 |
| 4.3.2 脂肪酸生物合成相关基因 | 第84页 |
| 4.3.3 糖酵解/糖异生相关基因 | 第84-86页 |
| 4.3.4 表观遗传修饰相关基因 | 第86-87页 |
| 4.3.5 光合作用和碳代谢相关基因 | 第87页 |
| 4.3.6 症状表达相关基因 | 第87-88页 |
| 4.3.7 植物防御相关基因 | 第88-90页 |
| 第五章 主要结论及展望 | 第90-92页 |
| 5.1 结论 | 第90-91页 |
| 5.2 展望 | 第91-92页 |
| 第六章 创新点 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-107页 |
| 读博期间发表论文和获奖情况 | 第107-108页 |
| Abstract | 第108-109页 |
