| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第1章 引言 | 第11-25页 |
| 1.1 兰科植物总论 | 第11-16页 |
| 1.1.1 兰科植物概述 | 第11页 |
| 1.1.2 兰科植物遗传多样性及遗传结构研究 | 第11-14页 |
| 1.1.3 兰科植物亲缘地理学研究 | 第14-16页 |
| 1.2 建兰概述 | 第16-17页 |
| 1.2.1 建兰的生物学特性 | 第16页 |
| 1.2.2 建兰的研究历史与现状 | 第16-17页 |
| 1.3 核rDNA ITS分子标记在兰科植物中的应用研究 | 第17-23页 |
| 1.3.1 核rDNA | 第17-18页 |
| 1.3.2 内转录间隔区(ITS) | 第18-19页 |
| 1.3.3 ITS序列的特点 | 第19页 |
| 1.3.4 协同进化 | 第19-20页 |
| 1.3.5 核rDNA ITS在兰科植物中的应用 | 第20-23页 |
| 1.3.5.1 在近缘种亲缘关系中的应用 | 第21页 |
| 1.3.5.2 在系统进化中的应用 | 第21-22页 |
| 1.3.5.3 在分子系统地理学中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4 叶绿体DNA分子标记在兰科植物中的应用研究 | 第23页 |
| 1.4.1 叶绿体DNA | 第23页 |
| 1.4.2 叶绿体DNA在兰科植物中的应用 | 第23页 |
| 1.5 本实验的研究目的和意义 | 第23-25页 |
| 第2章 材料与方法 | 第25-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-28页 |
| 2.1.1 材料来源 | 第25-26页 |
| 2.1.2 实验主要仪器设备、试剂及其来源 | 第26-28页 |
| 2.1.2.1 实验仪器 | 第26-27页 |
| 2.1.2.2 实验试剂 | 第27页 |
| 2.1.2.3 主要试剂的配制 | 第27-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-32页 |
| 2.2.1 建兰基因组DNA的提取 | 第28页 |
| 2.2.2 建兰基因组DNA的浓度检测 | 第28页 |
| 2.2.3 建兰PCR扩增 | 第28-32页 |
| 2.2.3.1 引物筛选 | 第28-31页 |
| 2.2.3.2 ITS-PCR扩增体系的建立 | 第31页 |
| 2.2.3.3 cpDNA-PCR扩增体系的建立 | 第31-32页 |
| 2.2.3.4 PCR产物的检测及测序 | 第32页 |
| 2.3 数据分析 | 第32-36页 |
| 2.3.1 测序结果的处理 | 第32页 |
| 2.3.2 序列比对 | 第32-33页 |
| 2.3.3 系统发育树的构建 | 第33-34页 |
| 2.3.3.1 最大简约法(MP)系统发育分析 | 第33-34页 |
| 2.3.3.2 邻接法(NJ)系统发育分析 | 第34页 |
| 2.3.4 单倍型分布及遗传多样性分析 | 第34页 |
| 2.3.5 单倍型网络图分析 | 第34页 |
| 2.3.6 群体遗传结构及谱系地理学分析 | 第34-35页 |
| 2.3.7 遗传距离与地理距离相关性分析 | 第35-36页 |
| 第3章 结果与分析 | 第36-57页 |
| 3.1 ITS序列结果与分析 | 第36-45页 |
| 3.1.1 ITS序列特征 | 第36-39页 |
| 3.1.2 ITS类型分布与群体内遗传多样性分析 | 第39-43页 |
| 3.1.2.1 ITS类型分布 | 第39-42页 |
| 3.1.2.2 遗传多样性分析 | 第42-43页 |
| 3.1.3 系统发育分析 | 第43-45页 |
| 3.1.4 群体遗传结构 | 第45页 |
| 3.2 cpDNA序列结果与分析 | 第45-57页 |
| 3.2.1 cpDNA基因间隔区petB-petD序列特征 | 第45-47页 |
| 3.2.2 cpDNA单倍型分布与群体内遗传多样性分析 | 第47-50页 |
| 3.2.2.1 cpDNA单倍型分布 | 第47-49页 |
| 3.2.2.2 遗传多样性分析 | 第49-50页 |
| 3.2.3 TCS单倍型网络图分析 | 第50-51页 |
| 3.2.4 系统发育分析 | 第51-53页 |
| 3.2.5 群体遗传结构及谱系地理学分析 | 第53页 |
| 3.2.6 遗传距离与地理距离相关性分析 | 第53-55页 |
| 3.2.7 群体动态历史分析 | 第55-57页 |
| 第4章 讨论 | 第57-61页 |
| 4.1 建兰的序列特征 | 第57-58页 |
| 4.2 建兰野生居群遗传多样性及遗传结构 | 第58-59页 |
| 4.3 建兰种质资源的保护 | 第59-61页 |
| 第5章 结论与展望 | 第61-63页 |
| 5.1 结论 | 第61-62页 |
| 5.2 展望 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 附表 | 第71-72页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第72页 |
