| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 文献综述 | 第13-25页 |
| 1.1 放线菌 | 第13-17页 |
| 1.1.1 放线菌概述 | 第13-14页 |
| 1.1.2 放线菌结构和形态 | 第14-15页 |
| 1.1.3 放线菌分类学研究意义 | 第15-16页 |
| 1.1.4 放线菌的分类学发展 | 第16页 |
| 1.1.5 16S rDNA基因序列分析 | 第16-17页 |
| 1.1.6 放线菌的代表属 | 第17页 |
| 1.2 红树林放线菌 | 第17-18页 |
| 1.3 功能基因研究现状 | 第18-21页 |
| 1.3.1 聚酮合成酶 | 第19页 |
| 1.3.2 PKS-Ⅰ | 第19-20页 |
| 1.3.3 PKS-Ⅱ | 第20页 |
| 1.3.4 非核糖体多肽合成酶 | 第20-21页 |
| 1.4 糖基转移酶基因研究进展 | 第21-23页 |
| 1.5 本研究的目的及意义 | 第23-25页 |
| 2 微波法提取放线菌基因组的研究 | 第25-45页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 样品 | 第26页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第26-28页 |
| 2.1.2.1 试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.2.2 仪器 | 第27页 |
| 2.1.2.3 培养基 | 第27-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-32页 |
| 2.2.1 实验菌株的筛选 | 第28页 |
| 2.2.2 微波法提取基因组DNA | 第28-29页 |
| 2.2.3 DNA纯度及浓度的测定 | 第29页 |
| 2.2.4 16S rDNA的PCR扩增 | 第29-30页 |
| 2.2.5 PCR产物回收 | 第30页 |
| 2.2.6 PCR产物与T载体连接 | 第30-31页 |
| 2.2.7 转化 | 第31页 |
| 2.2.8 菌落PCR验证 | 第31-32页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第32-43页 |
| 2.3.1 实验菌株的筛选 | 第32页 |
| 2.3.2 微波法、溶菌酶法处理提取基因组DNA | 第32-33页 |
| 2.3.3 DNA纯度及浓度的测定结果与分析 | 第33-36页 |
| 2.3.3.1 DNA样品纯度的测定结果与分析 | 第33-34页 |
| 2.3.3.2 DNA浓度计算结果与分析 | 第34-36页 |
| 2.3.4 16S rDNA PCR扩增 | 第36页 |
| 2.3.5 红树林放线菌的16S rDNA序列测序结果及分析 | 第36-43页 |
| 2.3.5.1 Z8菌株16S rDNA序列测序处理结果及分析 | 第36-38页 |
| 2.3.5.2 Z9菌株16S rDNA序列测序处理结果及分析 | 第38-39页 |
| 2.3.5.3 Z10菌株16S rDNA序列测序处理结果及分析 | 第39-40页 |
| 2.3.5.4 Z11菌株16S rDNA序列测序处理结果及分析 | 第40-41页 |
| 2.3.5.5 Z14菌株16S rDNA序列测序处理结果及分析 | 第41-43页 |
| 2.4 本章小结 | 第43-45页 |
| 3 红树林放线菌的分离与多样性分析 | 第45-61页 |
| 3.1 材料和方法 | 第45-47页 |
| 3.1.1 样品 | 第45页 |
| 3.1.2 主要试剂和仪器 | 第45-47页 |
| 3.1.2.1 试剂 | 第45-47页 |
| 3.1.2.2 仪器 | 第47页 |
| 3.1.2.3 培养基 | 第47页 |
| 3.2 实验方法 | 第47-49页 |
| 3.2.1 放线菌的分离培养 | 第47-48页 |
| 3.2.2 放线菌的纯化及保藏 | 第48页 |
| 3.2.3 红树林放线菌基因组DNA提取 | 第48页 |
| 3.2.4 红树林放线菌16S rDNA的PCR扩增 | 第48-49页 |
| 3.2.5 RFLP酶切分型 | 第49页 |
| 3.2.6 PCR产物回收 | 第49页 |
| 3.2.7 PCR产物与T载体连接 | 第49页 |
| 3.2.8 转化 | 第49页 |
| 3.2.9 菌落PCR验证 | 第49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-60页 |
| 3.3.1 红树林放线菌的分离 | 第49-51页 |
| 3.3.2 红树林放线菌的表观排重 | 第51-53页 |
| 3.3.3 红树林放线菌菌株的基因组DNA的提取 | 第53页 |
| 3.3.4 红树林放线菌菌株16S rDNA的PCR结果 | 第53页 |
| 3.3.5 RFLP分型结果 | 第53-54页 |
| 3.3.6 红树林放线菌的16S rDNA序列分析 | 第54-58页 |
| 3.3.7 红树林放线菌16S rDNA系统发育分析 | 第58-60页 |
| 3.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 4 红树林放线菌糖苷类活性物质合成潜力的发掘 | 第61-73页 |
| 4.1 材料和方法 | 第61-63页 |
| 4.1.1 样品 | 第61页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第61-63页 |
| 4.1.2.1 试剂 | 第61-62页 |
| 4.1.2.2 仪器 | 第62页 |
| 4.1.2.3 培养基 | 第62-63页 |
| 4.2 实验方法 | 第63-64页 |
| 4.2.1 红树林放线菌糖基转移酶基因筛选 | 第63页 |
| 4.2.2 其他功能基因序列的获得 | 第63-64页 |
| 4.2.2.1 功能基因的PCR扩增 | 第63-64页 |
| 4.2.2.2 PCR产物回收 | 第64页 |
| 4.2.2.3 PCR产物与载体连接 | 第64页 |
| 4.2.2.4 转化 | 第64页 |
| 4.2.2.5 菌落PCR鉴定 | 第64页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第64-72页 |
| 4.3.1 糖基转移酶基因筛选和功能基因扩增 | 第64-65页 |
| 4.3.1.1 糖基转移酶基因筛选 | 第64-65页 |
| 4.3.1.2 PKS-I、NRPS基因PCR扩增 | 第65页 |
| 4.3.2 糖基转移酶基因多样性分析及糖基转移酶氨基酸序列的系统发育分析 | 第65-70页 |
| 4.3.3 Ⅰ型聚酮合酶(PKS-I)功能基因片段多样性分析 | 第70-71页 |
| 4.3.4 非核糖体肽合成酶(NRPS)功能基因片段多样性分析 | 第71-72页 |
| 4.4 本章小结 | 第72-73页 |
| 论文总结 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-79页 |
| 附录 | 第79-87页 |
| 个人简历 | 第87页 |
| 发表的学术论文 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
