| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-8页 |
| 中英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第1章 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 分子系统学概论 | 第13页 |
| 1.2 常用的系统树构建方法 | 第13-15页 |
| 1.2.1 距离法 | 第13-14页 |
| 1.2.2 最大似然（ML）法 | 第14页 |
| 1.2.3 最大简约（MP）法 | 第14-15页 |
| 1.3 研究地概述 | 第15页 |
| 1.4 乡土植物概述 | 第15-16页 |
| 1.5 本课题的意义与设想 | 第16-18页 |
| 第2章 材料与方法 | 第18-29页 |
| 2.1 材料 | 第18-23页 |
| 2.1.1 材料来源 | 第18-21页 |
| 2.1.2 实验材料介绍 | 第21-23页 |
| 2.1.3 主要实验仪器 | 第23页 |
| 2.1.4 试剂与药品 | 第23页 |
| 2.2 研究方法及内容 | 第23-28页 |
| 2.2.1 植物DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.2 PCR扩增体系及产物测序 | 第24页 |
| 2.2.3 PCR引物 | 第24-25页 |
| 2.2.4 PCR产物纯化 | 第25-26页 |
| 2.2.5 PCR产物测序 | 第26-28页 |
| 2.3 数据处理 | 第28-29页 |
| 第3章 实验结果分析 | 第29-45页 |
| 3.1 序列下载 | 第29页 |
| 3.2 多序列比对 | 第29-30页 |
| 3.3 分子进化分析工具 | 第30-36页 |
| 3.3.1 8 种乡土植物的种内种间变异分析 | 第30-31页 |
| 3.3.2 8 种乡土植物的种内种间遗传距离分析 | 第31-36页 |
| 3.4 8 种乡土植物的邻接树 (NJ树)和最大似然树（ML树）鉴定 | 第36-45页 |
| 第4章 讨论 | 第45-48页 |
| 4.1 DNA提取与PCR扩增 | 第45页 |
| 4.2 应用DNA条形码鉴定物种的稳定性和准确性 | 第45-46页 |
| 4.3 两种建树方法的比较 | 第46页 |
| 4.4 以庐山或牯岭命名的8种乡土植物与其近缘种系统关系探讨 | 第46-48页 |
| 第5章 结论 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 综述 | 第54-63页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |