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基于转录组测序的辣木内参基因筛选和三个代谢途径相关基因的表达分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
英文缩略词及英汉对照第7-11页
1 前言第11-24页
    1.1 辣木第11-19页
        1.1.1 辣木生物学特征第11-12页
        1.1.2 辣木的营养价值第12页
        1.1.3 辣木的药用价值第12页
        1.1.4 辣木油脂肪酸组分第12-13页
        1.1.5 辣木黄酮类、萜类化合物和脂肪酸的合成途径第13-18页
        1.1.6 动物饲料添加剂第18-19页
    1.2 转录组测序第19-20页
        1.2.1 高通量测序的特点第19页
        1.2.2 高通量测序平台第19-20页
        1.2.3 高通量测序在林木研究中的应用第20页
    1.3 RT-qPCR技术和内参基因稳定性第20-21页
    1.4 研究内容第21-24页
2 材料与方法第24-36页
    2.1 植物材料第24-25页
    2.2 实验试剂第25页
    2.3 仪器设备第25页
    2.4 实验方法第25-36页
        2.4.1 植物组织总RNA提取和DNA去除第25-27页
        2.4.2 RNA样品质量检测第27页
        2.4.3 RNA反转录成cDNA第27-28页
        2.4.4 转录组测序第28-30页
        2.4.5 基因筛选和比对第30页
        2.4.6 引物的设计,合成和特异性检测第30-31页
        2.4.7 内参基因引物标准曲线的建立第31页
        2.4.8 PCR扩增第31-33页
        2.4.9 内参基因稳定性分析第33-34页
        2.4.10 内参基因筛选结果验证第34页
        2.4.11 目的基因表达模式分析第34-36页
3 结果与分析第36-60页
    3.1 辣木转录组测序第36-48页
        3.1.1 转录组组装结果第36页
        3.1.2 基因功能注释第36-39页
        3.1.3 物种分布统计第39-40页
        3.1.4 功能分类第40-43页
        3.1.5 预测编码蛋白框第43-46页
        3.1.6 串联重复单元(SSR)第46-48页
        3.1.7 结构域分析(Pfam)第48页
    3.2 辣木内参基因筛选第48-58页
        3.2.1 内参基因的筛选和扩增第48-51页
        3.2.2 候选内参基因的表达范围第51页
        3.2.3 geNorm分析候选内参基因稳定性第51-54页
        3.2.4 geNorm分析内参基因组合第54页
        3.2.5 内参基因适用性验证第54-55页
        3.2.6 其他软件分析候选内参基因稳定性第55-58页
    3.3 黄酮类、萜类化合物和脂肪酸合成相关基因的筛选和表达分析第58-60页
        3.3.1 黄酮类化合物合成关键基因的筛选和表达第58页
        3.3.2 萜类化合物合成关键基因的筛选和表达第58-59页
        3.3.3 脂肪酸合成关键基因的筛选和表达第59-60页
4 结论与讨论第60-67页
    4.1 讨论第60-65页
        4.1.1 转录组测序第60页
        4.1.2 内参基因筛选第60-63页
        4.1.3 黄酮类化合物的合成第63-64页
        4.1.4 萜类化合物的合成第64页
        4.1.5 脂肪酸的合成第64-65页
    4.2 结论第65-67页
致谢第67-68页
参考文献第68-77页
附录第77-84页

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