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转PRL基因小鼠模型的构建与Stat5a的乳腺发育调控机理研究

摘要第4-9页
ABSTRACT第9-15页
缩略词第19-20页
第一章 综述第20-40页
    1.1 催乳素的研究现状第20-31页
        1.1.1 催乳素的结构第20-21页
        1.1.2 PRL的信号通路第21-28页
            1.1.2.1 PRL诱导PRLR二聚化第22-23页
            1.1.2.2 JAK2酪氨酸磷酸化第23-24页
            1.1.2.3 JAK2的活化第24页
            1.1.2.4 PRLR的磷酸化第24-26页
            1.1.2.5 Stat二聚化诱导靶基因第26-28页
        1.1.3 催乳素的功能第28-29页
        1.1.4 催乳素与乳腺癌的关系第29-31页
    1.2 染色质免疫共沉淀(ChIP)第31-40页
        1.2.1 ChIP的基本原理与步骤第32-34页
            1.2.1.1 交联第32-33页
            1.2.1.2 染色质片段化第33页
            1.2.1.3 杂交第33-34页
        1.2.2 ChIP结果的检测第34页
        1.2.3 ChIP-seq数据分析第34-38页
            1.2.3.1 获得Clean Reads第34-35页
            1.2.3.2 Peaks扫描第35-38页
            1.2.3.3 生物信息学分析第38页
        1.2.4 ChIP-seq和RNA-seq联合分析第38-40页
第二章 乳腺特异性转PRL基因载体的构建与检测第40-59页
    摘要第40-41页
    2.1 材料与试剂第41-42页
        2.1.1 材料第41页
        2.1.2 分子克隆试剂第41-42页
        2.1.3 细胞转染与检测试剂第42页
    2.2 仪器与设备第42-43页
    2.3 实验方法第43-45页
        2.3.1 PRL基因的克隆第43-44页
        2.3.2 乳腺特异表达载体的构建第44页
        2.3.3 Bcap-37细胞转染与检测第44-45页
    2.4 结果第45-56页
        2.4.1 PRL基因的克隆第45-46页
        2.4.2 乳腺特异表达水牛PRL基因载体的构建第46-53页
            2.4.2.1 PRL片段插入第47页
            2.4.2.2 BCN启动子的插入第47页
            2.4.2.3 标记基因表达元件的插入第47-53页
        2.4.3 PRL转基因载体转染Bcap-37细胞与检测第53-56页
    2.5 讨论第56-58页
    2.6 结论第58-59页
第三章 乳腺特异性表达PRL基因小鼠模型的建立与分析第59-82页
    摘要第59-60页
    3.1 材料与试剂第60-61页
    3.2 仪器与设备第61页
    3.3 实验方法第61-68页
        3.3.1 转基因载体的纯化与转基因小鼠的制备第61-62页
        3.3.2 转基因小鼠PCR鉴定第62页
        3.3.3 Southern Blot分析第62-63页
        3.3.4 EGFP表达荧光检测第63页
        3.3.5 转基因小鼠的扩繁第63-64页
        3.3.6 外源基因拷贝数分析第64-65页
        3.3.7 外源基因整合位点检测第65-66页
        3.3.8 Western Blot检测外源PRL基因的表达第66页
        3.3.9 ELISA检测外源PRL基因的表达第66-67页
        3.3.10 QRT-PCR检测外源PRL表达对乳汁分泌相关基因的影响第67页
        3.3.11 外源PRL基因的表达对转基因小鼠生殖情况的影响第67-68页
    3.4 结果第68-79页
        3.4.1 转PRL基因小鼠的制备第68页
        3.4.2 转基因小鼠的鉴定第68-74页
            3.4.2.1 F0代小鼠鉴定第68-69页
            3.4.2.2 F0代小鼠荧光检测第69-70页
            3.4.2.3 子代转基因小鼠的检测第70-71页
            3.4.2.4 转基因小鼠外源基因拷贝数分析第71-72页
            3.4.2.5 转基因小鼠外源基因整合位点分析第72-74页
        3.4.3 转基因小鼠的分析第74-76页
            3.4.3.1 转基因小鼠组织中PRL基因的表达第74页
            3.4.3.2 转基因小鼠乳汁中PRL蛋白表达分析第74-75页
            3.4.3.3 转基因小鼠乳汁中PRL蛋白含量测定第75-76页
        3.4.4 外源PRL蛋白表达对乳汁生成相关基因表达的影响第76-77页
        3.4.5 转基因小鼠的安全性检测第77-79页
            3.4.5.1 外源PRL蛋白表达对转基因小鼠血清中PRL含量的影响第77-78页
            3.4.5.2 外源PRL蛋白表达对转基因小鼠产仔数的影响第78-79页
    3.5 讨论第79-81页
    3.6 结论第81-82页
第四章 转录因子Stat5a靶基因的筛选与分析第82-113页
    摘要第82-83页
    4.1 材料与试剂第83-84页
    4.2 仪器与设备第84页
    4.3 实验方法第84-90页
        4.3.1 QRT-PCR检测Stats基因的表达情况第84-85页
        4.3.2 乳腺组织样本的准备第85页
        4.3.3 小鼠乳腺组织ChP第85-87页
        4.3.4 小鼠RNA-seq样本的制备与测序第87页
        4.3.5 数据分析第87-89页
        4.3.6 QRT-PCR验证RNA-seq数据准确性第89-90页
    4.4 结果与分析第90-109页
        4.4.1 乳腺不同发育阶段Stats的表达分析第90-91页
        4.4.2 ChIP-seq数据分析第91-97页
            4.4.2.1 Reads数据统计第91页
            4.4.2.2 Reads覆盖深度第91-92页
            4.4.2.3 Peaks数据统计第92-93页
            4.4.2.4 Peaks在基因组中的分布第93-94页
            4.4.2.5 样本间Peaks差异分析第94页
            4.4.2.6 Peaks相关基因差异分析第94-95页
            4.4.2.7 Peaks相关基因GO聚类分析第95-97页
        4.4.3 RNA-seq数据分析第97-101页
            4.4.3.1 Reads数据的统计第97页
            4.4.3.2 测序结果可靠性分析第97-98页
            4.4.3.3 基因覆盖度分析第98-100页
            4.4.3.4 基因表达差异分析第100页
            4.4.3.5 RNA-seq数据分析中表达差异基因的验证第100-101页
            4.4.3.6 表达差异基因的GO聚类分析第101页
        4.4.4 ChIP-seq联合RNA-seq数据分析第101-109页
            4.4.4.1 Stat5a在靶位点的结合对靶基因表达的影响第101-106页
            4.4.4.2 转录因子Stat5a在乳腺细胞分化中的作用分析第106-109页
            4.4.4.3 外源PRL基因表达对Stat5a靶基因的影响第109页
    4.5 讨论第109-113页
    4.6 结论第113页
参考文献第113-131页
致谢第131-132页
攻读学位期间发表论文情况第132页

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