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基于图能量的蛋白质图形表示及应用研究

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 绪论第12-19页
    1.1 生物信息学的研究背景和意义第12-13页
    1.2 蛋白质序列的图形表示第13-15页
    1.3 生物序列的相似性分析第15-16页
    1.4 蛋白质序列的亚细胞定位预测第16-17页
    1.5 论文的主要工作及结构第17-19页
        1.5.1 论文的主要工作第17-18页
        1.5.2 论文的结构第18-19页
第二章 20种氨基酸的图形表示第19-27页
    2.1 引言第19页
    2.2 20种氨基酸的图形表示第19-22页
        2.2.1 一种新的DNA的图形表示第20-21页
        2.2.2 氨基酸的图形表示第21-22页
    2.3 20种氨基酸的图能量和拉普拉斯能量第22-26页
        2.3.1 图的能量和拉普拉斯能量第22-24页
        2.3.2 计算20种氨基酸的图能量和拉普拉斯能量第24-26页
    2.4 本章小结第26-27页
第三章 基于图能量的蛋白质序列的二维图形表示第27-35页
    3.1 引言第27-30页
    3.2 一种新颖的蛋白质的图形表示第30-34页
        3.2.1 20种氨基酸的分类第30-32页
        3.2.2 蛋白质序列的图形表示第32-34页
    3.3 本章小结第34-35页
第四章 基于二维图形表示的蛋白质相似性分析第35-47页
    4.1 引言第35-36页
    4.2 相似性模型的建立第36-42页
        4.2.1 9种物种ND5蛋白质序列的相似性分析第37-39页
        4.2.2 36条蛋白质序列的相似性分析第39-41页
        4.2.3 相似性分析模型的建立第41-42页
    4.3 相似性模型的应用第42-46页
        4.3.1 24条转铁蛋白序列的数据集上的相似性分析第42-44页
        4.3.2 27条抗冻蛋白的相似性分析第44-46页
    4.4 本章小结第46-47页
第五章 基于二维图形表示的蛋白质亚细胞定位预测第47-58页
    5.1 引言第47页
    5.2 数据集第47-49页
    5.3 特征提取和分类方法以及模型评价第49-52页
        5.3.1 基于小波分析的特征提取第49-50页
        5.3.2 支持向量机分类预测第50-52页
        5.3.3 模型评价第52页
    5.4 蛋白质亚细胞定位预测实验与讨论第52-56页
        5.4.1 凋亡蛋白CL317和ZD98的预测第53-55页
        5.4.2 凋亡蛋白ZW225以及iLoc8897的预测第55-56页
    5.5 本章小结第56-58页
第六章 总结与展望第58-61页
    6.1 总结第58-59页
    6.2 展望第59-61页
参考文献第61-68页
致谢第68-69页
攻读学位期间发表的学术论文第69-70页
附件第70页

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