摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
第一章 绪论 | 第12-19页 |
1.1 生物信息学的研究背景和意义 | 第12-13页 |
1.2 蛋白质序列的图形表示 | 第13-15页 |
1.3 生物序列的相似性分析 | 第15-16页 |
1.4 蛋白质序列的亚细胞定位预测 | 第16-17页 |
1.5 论文的主要工作及结构 | 第17-19页 |
1.5.1 论文的主要工作 | 第17-18页 |
1.5.2 论文的结构 | 第18-19页 |
第二章 20种氨基酸的图形表示 | 第19-27页 |
2.1 引言 | 第19页 |
2.2 20种氨基酸的图形表示 | 第19-22页 |
2.2.1 一种新的DNA的图形表示 | 第20-21页 |
2.2.2 氨基酸的图形表示 | 第21-22页 |
2.3 20种氨基酸的图能量和拉普拉斯能量 | 第22-26页 |
2.3.1 图的能量和拉普拉斯能量 | 第22-24页 |
2.3.2 计算20种氨基酸的图能量和拉普拉斯能量 | 第24-26页 |
2.4 本章小结 | 第26-27页 |
第三章 基于图能量的蛋白质序列的二维图形表示 | 第27-35页 |
3.1 引言 | 第27-30页 |
3.2 一种新颖的蛋白质的图形表示 | 第30-34页 |
3.2.1 20种氨基酸的分类 | 第30-32页 |
3.2.2 蛋白质序列的图形表示 | 第32-34页 |
3.3 本章小结 | 第34-35页 |
第四章 基于二维图形表示的蛋白质相似性分析 | 第35-47页 |
4.1 引言 | 第35-36页 |
4.2 相似性模型的建立 | 第36-42页 |
4.2.1 9种物种ND5蛋白质序列的相似性分析 | 第37-39页 |
4.2.2 36条蛋白质序列的相似性分析 | 第39-41页 |
4.2.3 相似性分析模型的建立 | 第41-42页 |
4.3 相似性模型的应用 | 第42-46页 |
4.3.1 24条转铁蛋白序列的数据集上的相似性分析 | 第42-44页 |
4.3.2 27条抗冻蛋白的相似性分析 | 第44-46页 |
4.4 本章小结 | 第46-47页 |
第五章 基于二维图形表示的蛋白质亚细胞定位预测 | 第47-58页 |
5.1 引言 | 第47页 |
5.2 数据集 | 第47-49页 |
5.3 特征提取和分类方法以及模型评价 | 第49-52页 |
5.3.1 基于小波分析的特征提取 | 第49-50页 |
5.3.2 支持向量机分类预测 | 第50-52页 |
5.3.3 模型评价 | 第52页 |
5.4 蛋白质亚细胞定位预测实验与讨论 | 第52-56页 |
5.4.1 凋亡蛋白CL317和ZD98的预测 | 第53-55页 |
5.4.2 凋亡蛋白ZW225以及iLoc8897的预测 | 第55-56页 |
5.5 本章小结 | 第56-58页 |
第六章 总结与展望 | 第58-61页 |
6.1 总结 | 第58-59页 |
6.2 展望 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第69-70页 |
附件 | 第70页 |