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杨树溃疡病发生的水分生理效应及转录组分析

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 前言第11-16页
    1.1 研究目的及意义第11-12页
    1.2 国内外研究进展及分析第12-16页
        1.2.1 杨树溃疡病的发生发展与干旱胁迫密切相关第12页
        1.2.2 木质部导管栓塞及其与植物病害发生的关系第12-13页
        1.2.3 水通道蛋白在木质部栓塞修复、抗逆境胁迫及植物病害发生中的作用 3 1.2.4 可溶性糖在木质部栓塞修复中的作用第13-14页
        1.2.4 可溶性糖在木质部栓塞修复中的作用第14页
        1.2.5 杨树转录组高通量测序第14-16页
2 实验材料与研究方法第16-22页
    2.1 植物材料第16页
    2.2 真菌材料第16-17页
        2.2.1 菌株来源与菌株培养第16页
        2.2.2 粗毒素毒性试验第16-17页
    2.3 实验处理及实验材料取样第17-18页
        2.3.1 溃疡病菌处理及实验材料取样第17页
        2.3.2 干旱-毒素处理及实验取样第17-18页
    2.4 研究方法第18-22页
        2.4.1 溃疡病菌侵染过程中北京杨枝干水力学特性的变化的测定第18-19页
        2.4.2 可溶性糖含量和淀粉含量的测定第19-20页
        2.4.3 杨树枝干总RNA的提取、cDNA的合成及Real-time qPCR反应第20页
        2.4.4 北京杨转录组测序第20-21页
        2.4.5 数据分析方法第21-22页
3 结果分析第22-54页
    3.1 溃疡病菌侵染过程中北京杨枝干水力学特性的变化第22-25页
        3.1.1 枝条导水率第22-23页
        3.1.2 叶片水势和顶端水势第23-24页
        3.1.3 枝条木质部、韧皮部及根部渗透势第24-25页
    3.2 溃疡病菌侵染对北京杨枝干可溶性糖\淀粉含量的影响第25-29页
        3.2.1 可溶性糖含量变化第25-28页
        3.2.2 淀粉含量变化第28-29页
    3.3 溃疡病菌侵染过程中北京杨水通道蛋白基因表达分析第29-33页
        3.3.1 提取的RNA质量检测第29-30页
        3.3.2 反转录合成cDNA第一条链结果第30-31页
        3.3.3 杨树质膜内在水通道蛋白(PIPs)表达量的变化第31-33页
    3.4 溃疡病菌毒素作用下,北京杨水通道蛋白基因表达特征分析第33-38页
        3.4.1Cq value的可变性分析结果第33-35页
        3.4.2 北京杨管家基因的表达稳定性分析第35-36页
        3.4.3 荧光实时定量PCR实验中最适内参基因数目分析第36-37页
        3.4.4 韧皮部薄壁细胞质膜内在蛋白基因表达量分析第37-38页
    3.5 溃疡病菌侵染过程中北京杨转录组测序及生物信息学分析第38-54页
        3.5.1 RNA的提取及检测第38-39页
        3.5.2 测序数据处理第39-40页
        3.5.3 产量统计第40页
        3.5.4 转录组数据与参考基因组序列比对第40-41页
        3.5.5 基因结构分析第41-44页
        3.5.6 新基因分析第44页
        3.5.7 差异表达分析第44-46页
        3.5.8 差异表达基因功能注释和富集分析第46-54页
4 讨论第54-57页
5 结论第57-59页
参考文献第59-65页
在读期间发表论文第65-66页
作者简介第66-67页
致谢第67-68页

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