| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| 缩略语表 (Abbreviation) | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-18页 |
| 1.1 鲤春病毒血症病毒简介 | 第10-13页 |
| 1.1.1 引言 | 第10页 |
| 1.1.2 SVC流行特点 | 第10-11页 |
| 1.1.3 SVCV的病原学特性 | 第11页 |
| 1.1.4 SVCV的结构蛋白 | 第11-13页 |
| 1.1.5 SVCV的致病机理 | 第13页 |
| 1.2 miRNA研究进展 | 第13-18页 |
| 1.2.1 miRNA的产生机制 | 第13-14页 |
| 1.2.2 miRNA的功能和作用方式 | 第14-15页 |
| 1.2.3 miRNA参与宿主-病毒相互作用过程 | 第15-16页 |
| 1.2.4 病毒编码的miRNA | 第16页 |
| 1.2.5 miRNA测序技术 | 第16-18页 |
| 2 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 3 材料与方法 | 第19-30页 |
| 3.1 实验材料 | 第19-21页 |
| 3.1.1 毒株和细胞系 | 第19页 |
| 3.1.2 主要药品及试剂 | 第19-20页 |
| 3.1.3 主要培养基及其配制 | 第20页 |
| 3.1.4 主要缓冲液（溶液）及其配制 | 第20-21页 |
| 3.1.5 主要实验仪器及设备 | 第21页 |
| 3.2 实验方法 | 第21-30页 |
| 3.2.1 EPC细胞传代培养 | 第21-22页 |
| 3.2.2 病毒感染 | 第22页 |
| 3.2.3 细胞总RNA的提取 | 第22页 |
| 3.2.4 RNA质量鉴定 | 第22页 |
| 3.2.5 solexa高通量测序 | 第22-23页 |
| 3.2.6 小RNA的生物信息学分析 | 第23-24页 |
| 3.2.7 预测新的mi RNAs和miRNA靶基因 | 第24-25页 |
| 3.2.8 qRT-PCR对miRNA表达谱进行验证 | 第25-26页 |
| 3.2.9 RT-PCR对novel mi RNAs进行验证 | 第26-27页 |
| 3.2.10 mi RNA mimics或inhibitor转染 | 第27页 |
| 3.2.11 病毒基因的qRT-PCR检测 | 第27-29页 |
| 3.2.12 TCID50实验 | 第29页 |
| 3.2.13 统计学方法 | 第29-30页 |
| 4 结果与分析 | 第30-49页 |
| 4.1 RNA的分离和质量鉴定 | 第30-31页 |
| 4.2 高通量测序结果 | 第31-41页 |
| 4.2.1 数据统计 | 第31-32页 |
| 4.2.2 小RNA的长度分布 | 第32页 |
| 4.2.3 样品间小RNA公共及特有序列分析 | 第32-33页 |
| 4.2.4 与斑马鱼基因组比对 | 第33页 |
| 4.2.5 对小RNA进行分类注释 | 第33-34页 |
| 4.2.6 保守性mi RNA的鉴定 | 第34-35页 |
| 4.2.7 保守性mi RNAs首位碱基偏好性分析 | 第35-36页 |
| 4.2.8 保守性mi RNAs进化分析 | 第36-37页 |
| 4.2.9 新的mi RNAs的预测及验证 | 第37-39页 |
| 4.2.10 miRNAs差异表达分析 | 第39-41页 |
| 4.3 miRNA的qRT-PCR验证 | 第41-43页 |
| 4.4 miRNA靶标预测 | 第43-44页 |
| 4.4.1 预测显著性差异表达mi RNA的靶基因 | 第43页 |
| 4.4.2 预测靶向SVCV基因组的miRNA | 第43-44页 |
| 4.5 miR-15a-5p对SVCV复制影响的初步研究 | 第44-49页 |
| 4.5.1 转染miR-15a-5p inhibitor对SVCV复制的影响 | 第44-46页 |
| 4.5.2 转染miR-15a-5p mimics对SVCV复制的影响 | 第46-49页 |
| 5 讨论和结论 | 第49-53页 |
| 5.1 病毒感染EPC细胞后收样点的确定 | 第49页 |
| 5.2 小RNA的生物信息学分析 | 第49-50页 |
| 5.3 miRNA定量检测中内参基因的选择 | 第50-51页 |
| 5.4 SVCV自身编码的miRNA | 第51页 |
| 5.5 显著性差异表达miRNA对病毒复制的影响 | 第51-52页 |
| 5.6 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-64页 |
| 附录 | 第64-73页 |
| 附件 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74页 |
