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可检测细菌的RNA剪切脱氧核酸荧光分子探针的研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
主要符号对照表第9-11页
第1章 引言第11-30页
    1.1 细菌检测方法研究的必要性第11-12页
    1.2 常用的细菌检测方法及其特点第12-14页
        1.2.1 基于微生物培养的细菌检测方法第12-13页
        1.2.2 基于PCR的细菌检测方法第13页
        1.2.3 基于抗体的细菌检测方法第13-14页
    1.3 功能核酸及其在生物传感器上的应用第14-24页
        1.3.1 核酸适配体第14-16页
        1.3.2 脱氧核酶第16-17页
        1.3.3 功能核酸作为生物传感器的优势第17-18页
        1.3.4 基于核酸适配体的生物传感器第18-22页
        1.3.5 基于脱氧核酶的生物传感器第22-24页
    1.4 可检测大肠杆菌的荧光标记DNA探针第24-27页
    1.5 本课题的研究内容与意义第27-30页
第2章 利用RFD-EC1检测细菌的抑制第30-45页
    2.1 引言第30-32页
    2.2 实验部分第32-36页
        2.2.1 试剂与材料第32页
        2.2.2 仪器设备第32页
        2.2.3 细菌的准备第32页
        2.2.4 RFD-EC1探针的构建第32-33页
        2.2.5 荧光光谱实验第33页
        2.2.6 RFD-EC1对 大肠杆菌检测限的测定第33-34页
        2.2.7 用RFD-EC1和光密度法(OD)测定大肠杆菌的生长曲线第34页
        2.2.8 用RFD-EC1测定氨苄青霉素对大肠杆菌生长的影响第34-35页
        2.2.9 用RFD-EC1测定化合物破坏细胞膜的能力第35页
        2.2.10 用RFD-EC1监测大肠杆菌和枯草杆菌的生长竞争第35页
        2.2.11 缓冲溶液组成第35-36页
    2.3 结果与讨论第36-43页
        2.3.1 大肠杆菌响应荧光DNA酶(RFD-EC1)的特性第36-37页
        2.3.2 RFD-EC1用于检测氨苄青霉素对大肠杆菌的生长影响第37-39页
        2.3.3 RFD-EC1用于指示靶点为细胞膜的化合物第39-41页
        2.3.4 RFD-EC1用于监测大肠杆菌与枯草杆菌的生长竞争第41-43页
    2.4 本章小结第43-45页
第3章 RFD-EC1靶点的寻找第45-59页
    3.1 引言第45-46页
    3.2 实验部分第46-49页
        3.2.1 实验所用试剂和细胞第46-47页
        3.2.2 用 0.1%SDS处理大肠杆菌CEM第47页
        3.2.3 复制培养Keio Collection细胞库第47-48页
        3.2.4 Keio Collection细胞系的重培养第48页
        3.2.5 靶点筛选反应第48-49页
        3.2.6 反应缓冲溶液第49页
    3.3 结果与讨论第49-57页
        3.3.1 RFD-EC1靶点本质为蛋白质第49-50页
        3.3.2 利用Keio Collection对靶点的筛选第50-53页
        3.3.3 剪切反应活性来源的确认第53-57页
    3.4 本章总结第57-59页
第4章 RFD-EC1碱基序列优化及其结构鉴定第59-73页
    4.1 引言第59-60页
    4.2 实验部分第60-61页
        4.2.1 实验试剂与仪器第60页
        4.2.2 重筛选过程第60页
        4.2.3 实验所用缓冲溶液配制第60-61页
    4.3 结果与讨论第61-72页
        4.3.1 通过碱基敲除验证RFD-EC1中重要碱基第61-66页
        4.3.2 以重筛选为基础研究RFD-EC1的结构第66-72页
    4.4 本章小结第72-73页
第5章 RFD探针对金黄葡萄球菌的检测第73-83页
    5.1 引言第73-74页
    5.2 实验部分第74-77页
        5.2.1 试剂及材料第74页
        5.2.2 金黄葡萄球菌和其他细菌培养外液的提取第74-75页
        5.2.3 随机DNA分子库与荧光底物RS28的连接第75页
        5.2.4 针对金黄葡萄球菌RFD探针的筛选过程第75-76页
        5.2.5 RFD-SA探针的制备合成第76页
        5.2.6 利用dPAGE胶的方法检测金黄葡萄球菌第76页
        5.2.7 96孔板在酶标仪上进行金黄葡萄球菌的检测第76-77页
        5.2.8 缓冲溶液系统第77页
    5.3 结果与讨论第77-82页
        5.3.1 筛选过程及其结果第77页
        5.3.2 RFD-SA的特异性验证第77-78页
        5.3.3 RFD-SA的二价离子选择优化第78-80页
        5.3.4 RFD-SA检测牛奶中的金黄葡萄球菌第80-81页
        5.3.5 RFD-SA在临床样本上的检测第81-82页
    5.4 本章小结第82-83页
第6章 结论与展望第83-85页
参考文献第85-95页
致谢第95-97页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第97页

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