摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
第一章 绪论 | 第12-42页 |
1.1 研究背景 | 第12-36页 |
1.1.1 2型糖尿病 | 第12-19页 |
1.1.2 常用的T2D动物模型 | 第19-30页 |
1.1.3 下丘脑的作用与影响 | 第30-36页 |
1.2 技术与工具 | 第36-40页 |
1.2.1 RNA-seq技术概述 | 第36-38页 |
1.2.2 常用生物信息分析工具 | 第38-40页 |
1.3 本研究的目的与主要内容 | 第40-42页 |
第二章 下丘脑差异表达基因 | 第42-66页 |
2.1 前言 | 第42页 |
2.2 材料与方法 | 第42-45页 |
2.2.1 实验动物与组织器官的收集 | 第42页 |
2.2.2 生理指标的测定 | 第42-43页 |
2.2.3 RNA-seq | 第43-44页 |
2.2.4 下丘脑转录组以及差异表达基因 | 第44页 |
2.2.5 RT-qPCR验证 | 第44-45页 |
2.3 结果 | 第45-62页 |
2.3.1 GK大鼠的体重与摄食变化 | 第45-46页 |
2.3.2 GK大鼠生理指标 | 第46-47页 |
2.3.3 转录组测序质量检测及筛选比对结果 | 第47-51页 |
2.3.4 下丘脑的基因表达谱与差异表达基因 | 第51-62页 |
2.4 讨论 | 第62-64页 |
2.5 本章小结 | 第64-66页 |
第三章 下丘脑的基因突变 | 第66-78页 |
3.1 前言 | 第66页 |
3.2 材料与方法 | 第66-68页 |
3.2.1 SNP的获取 | 第66-67页 |
3.2.2 Wistar与GK大鼠特异性突变的筛选 | 第67页 |
3.2.3 编码区的SNP的筛选及其分型 | 第67页 |
3.2.4 Wistar与GK大鼠特异性基因的筛选 | 第67-68页 |
3.2.5 GK大鼠差异表达的突变基因与正选择 | 第68页 |
3.3 结果 | 第68-73页 |
3.3.1 Wistar与GK大鼠的基因突变 | 第68-69页 |
3.3.2 Wistar与GK大鼠在CDS上的突变数目及其类型 | 第69-70页 |
3.3.3 Wistar与GK大鼠特异性基因 | 第70-72页 |
3.3.4 GK大鼠差异表达的突变基因正选择分析结果 | 第72-73页 |
3.4 讨论 | 第73-76页 |
3.5 本章小结 | 第76-78页 |
第四章 GK大鼠特异基因网络对下丘脑调控的影响 | 第78-96页 |
4.1 前言 | 第78页 |
4.2 材料与方法 | 第78-82页 |
4.2.1 下丘脑转录组共表达网络 | 第78页 |
4.2.2 蛋白与蛋白相互作用网络 | 第78-79页 |
4.2.3 Wistar与GK大鼠的基因突变 | 第79页 |
4.2.4 MAGI整合 | 第79-80页 |
4.2.5 模块基因的聚类分析以及模块图形化 | 第80-82页 |
4.3 结果 | 第82-90页 |
4.3.1 种子途径 | 第82-83页 |
4.3.2 模块M1 | 第83-86页 |
4.3.3 模块M2 | 第86-89页 |
4.3.4 时间进程中子模块M1与M2基因所涉及的信号通路及下丘脑调控 | 第89-90页 |
4.4 讨论 | 第90-93页 |
4.5 本章小结 | 第93-96页 |
结论 | 第96-100页 |
创新性成果 | 第97页 |
局限与展望 | 第97-100页 |
参考文献 | 第100-118页 |
攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第118-119页 |
致谢 | 第119-120页 |
附表 | 第120页 |