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下丘脑转录组分析揭示GK大鼠致糖尿病过程中的基因调控网络

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第12-42页
    1.1 研究背景第12-36页
        1.1.1 2型糖尿病第12-19页
        1.1.2 常用的T2D动物模型第19-30页
        1.1.3 下丘脑的作用与影响第30-36页
    1.2 技术与工具第36-40页
        1.2.1 RNA-seq技术概述第36-38页
        1.2.2 常用生物信息分析工具第38-40页
    1.3 本研究的目的与主要内容第40-42页
第二章 下丘脑差异表达基因第42-66页
    2.1 前言第42页
    2.2 材料与方法第42-45页
        2.2.1 实验动物与组织器官的收集第42页
        2.2.2 生理指标的测定第42-43页
        2.2.3 RNA-seq第43-44页
        2.2.4 下丘脑转录组以及差异表达基因第44页
        2.2.5 RT-qPCR验证第44-45页
    2.3 结果第45-62页
        2.3.1 GK大鼠的体重与摄食变化第45-46页
        2.3.2 GK大鼠生理指标第46-47页
        2.3.3 转录组测序质量检测及筛选比对结果第47-51页
        2.3.4 下丘脑的基因表达谱与差异表达基因第51-62页
    2.4 讨论第62-64页
    2.5 本章小结第64-66页
第三章 下丘脑的基因突变第66-78页
    3.1 前言第66页
    3.2 材料与方法第66-68页
        3.2.1 SNP的获取第66-67页
        3.2.2 Wistar与GK大鼠特异性突变的筛选第67页
        3.2.3 编码区的SNP的筛选及其分型第67页
        3.2.4 Wistar与GK大鼠特异性基因的筛选第67-68页
        3.2.5 GK大鼠差异表达的突变基因与正选择第68页
    3.3 结果第68-73页
        3.3.1 Wistar与GK大鼠的基因突变第68-69页
        3.3.2 Wistar与GK大鼠在CDS上的突变数目及其类型第69-70页
        3.3.3 Wistar与GK大鼠特异性基因第70-72页
        3.3.4 GK大鼠差异表达的突变基因正选择分析结果第72-73页
    3.4 讨论第73-76页
    3.5 本章小结第76-78页
第四章 GK大鼠特异基因网络对下丘脑调控的影响第78-96页
    4.1 前言第78页
    4.2 材料与方法第78-82页
        4.2.1 下丘脑转录组共表达网络第78页
        4.2.2 蛋白与蛋白相互作用网络第78-79页
        4.2.3 Wistar与GK大鼠的基因突变第79页
        4.2.4 MAGI整合第79-80页
        4.2.5 模块基因的聚类分析以及模块图形化第80-82页
    4.3 结果第82-90页
        4.3.1 种子途径第82-83页
        4.3.2 模块M1第83-86页
        4.3.3 模块M2第86-89页
        4.3.4 时间进程中子模块M1与M2基因所涉及的信号通路及下丘脑调控第89-90页
    4.4 讨论第90-93页
    4.5 本章小结第93-96页
结论第96-100页
    创新性成果第97页
    局限与展望第97-100页
参考文献第100-118页
攻读博士学位期间取得的研究成果第118-119页
致谢第119-120页
附表第120页

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