| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-11页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第7页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第7-9页 |
| 1.2.1 蛋白质相互作用的研究现状 | 第7-8页 |
| 1.2.2 蚁群聚类算法 | 第8-9页 |
| 1.3 本文的主要工作及结构安排 | 第9-11页 |
| 1.3.1 本文主要工作 | 第9页 |
| 1.3.2 本文结构安排 | 第9-11页 |
| 第二章 蚁群算法和蛋白质相互作用网络描述 | 第11-21页 |
| 2.1 蛋白质相互作用网络 | 第11-16页 |
| 2.1.1 PPI网络概述 | 第11-12页 |
| 2.1.2 PPI网络特点 | 第12-13页 |
| 2.1.3 PPI网络数据库 | 第13-14页 |
| 2.1.4 PPI网络聚类过程 | 第14-15页 |
| 2.1.5 PPI网络聚类方法 | 第15-16页 |
| 2.2 蚁群聚类算法 | 第16-20页 |
| 2.2.1 蚁群算法提出 | 第16-17页 |
| 2.2.2 基于蚁堆形成原理的聚类算法 | 第17-19页 |
| 2.2.3 算法优缺点 | 第19-20页 |
| 2.3 本章小节 | 第20-21页 |
| 第三章 一种改进的基于蚁堆形成原理的PPI网络聚类算法 | 第21-42页 |
| 3.1 引言 | 第21页 |
| 3.2 改进的初始节点选取策略 | 第21-24页 |
| 3.2.1 节点度和聚类系数 | 第21-22页 |
| 3.2.2 初始节点的选择 | 第22-24页 |
| 3.3 改进的拾起放下策略 | 第24-27页 |
| 3.3.1 拾起放下模型 | 第24-25页 |
| 3.3.2 边关联强度 | 第25-26页 |
| 3.3.3 拾起放下策略 | 第26-27页 |
| 3.4 聚类的后处理操作 | 第27-28页 |
| 3.5 算法步骤 | 第28-30页 |
| 3.6 算法时间复杂度分析 | 第30页 |
| 3.7 实验分析 | 第30-41页 |
| 3.7.1 实验环境与数据 | 第30页 |
| 3.7.2 评价准则 | 第30-33页 |
| 3.7.3 参数分析 | 第33-38页 |
| 3.7.4 实验结果及分析 | 第38-41页 |
| 3.8 本章小节 | 第41-42页 |
| 第四章 系统应用 | 第42-46页 |
| 4.1 系统实现 | 第42页 |
| 4.2 主要功能模块 | 第42-45页 |
| 4.3 本章小节 | 第45-46页 |
| 第五章 总结与展望 | 第46-47页 |
| 5.1 工作总结 | 第46页 |
| 5.2 未来研究工作与展望 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 个人简介 | 第50-51页 |
| 在读期间发表的学术论文、成果及科研工作情况 | 第51-52页 |
| 附录A 图索引 | 第52-53页 |
| 附录B 表索引 | 第53页 |