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葡萄WRKY和VQ基因家族的全基因组鉴定、表达分析及蛋白互作预测

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词(Abbreviations)第13-14页
第一章 文献综述第14-24页
 1 植物转录因子的研究进展第14-16页
   ·转录因子第14页
   ·转录因子的数量及基因家族第14-15页
   ·转录因子的作用第15-16页
 2 WRKY转录因子研究进展第16-19页
   ·WRKY转录因子起源与进化第16-17页
   ·WRKY转录因子DNA结合位点第17页
   ·WRKY转录因子参与多种代谢途径第17-19页
 3 WRKY蛋白与其它蛋白的互作第19-23页
   ·WRKY蛋白与WRKY蛋白互作第20页
   ·WRKY蛋白与VQ蛋白的互作第20-21页
   ·WRKY蛋白和MAPK蛋白互作第21-22页
   ·WRKY蛋白与钙调蛋白的互作第22页
   ·WRKY蛋白与其它蛋白的互作第22-23页
 4 本研究的目的和意义第23-24页
第二章 葡萄WRKY基因家族的基因组和转录组分析第24-52页
 1 材料与方法第27-31页
   ·葡萄WRKY蛋白的识别第27-28页
   ·葡萄WRKY基因家族的系统进化树构建和基因的分类第28页
   ·葡萄WRKY基因染色体的位置和基因复制第28页
   ·保守基序的分布和基因外显子-内含子结构的分析第28-29页
   ·芯片数据分析第29页
   ·植物材料和处理方法第29页
   ·实时荧光定量PCR第29-30页
   ·统计分析第30-31页
 2 结果与分析第31-49页
   ·葡萄WRKY基因的识别和注释第31-33页
   ·葡萄WRKY基因的染色体分布和外显子-内含子结构第33-36页
   ·葡萄WRKY基因家族的分类、系统进化树构建和基序分析第36-42页
   ·葡萄WRKY基因在不同器官,组织和发育阶段的表达水平第42-44页
   ·WRKY基因响应生物胁迫和非生物胁迫的表达模式第44-49页
 3 讨论第49-52页
   ·葡萄WRKY基因家族的结构第49-50页
   ·WRKY基因参与葡萄生长和发育第50页
   ·胁迫处理诱导葡萄WRKY基因的表达第50-52页
第三章 葡萄WRKY基因互作蛋白VQ基因家族的进化分析第52-70页
 1 材料和方法第54-56页
   ·序列和数据库的搜索第54页
   ·序列比对和系统进化树分析第54页
   ·外显子-内含子结构和基序分析第54页
   ·染色体定位和基因复制第54-55页
   ·启动子分析第55页
   ·基于公共芯片的葡萄VQ基因表达第55页
   ·植物材料和处理方法第55页
   ·荧光定量PCR第55-56页
 2 结果与分析第56-68页
   ·葡萄VQ基因的识别和注释第56-57页
   ·蛋白质序列聚类和结构分析第57-60页
   ·染色体定位和基因复制第60-63页
   ·葡萄VQ基因启动子顺式作用元件的识别第63-64页
   ·VQ转录因子在葡萄不同器官,组织和发育阶段的表达分析第64-65页
   ·葡萄VQ基因在各种胁迫和外源激素处理下的表达模式第65-68页
 3 讨论第68-70页
第四章 葡萄WRKY蛋白与VQ蛋白互作预测第70-82页
 1 方法第72-73页
   ·WRKY基因和VQ基因的识别第72页
   ·构建进化树第72页
   ·预测葡萄中WRKY-VQ互作蛋白第72页
   ·相关性分析第72-73页
 2 结果与分析第73-79页
   ·葡萄中假定的WRKY-VQ互作蛋白第73-77页
   ·假定互作蛋白对在各种组织、器官中的表达趋势第77-78页
   ·相关性分析第78-79页
 3 讨论第79-82页
第五章 葡萄VvWRKY21基因和VvWRKY30基因的克隆及功能分析第82-104页
 1 材料与方法第83-91页
   ·材料第83-85页
   ·方法第85-91页
 2 结果与分析第91-102页
   ·基因的克隆和序列分析第91-94页
   ·VvWRKY21和VvWRKY30基因超表达载体的构建第94-95页
   ·VvWRKY21转基因拟南芥的鉴定第95-96页
   ·T3代VvWRKY21转基因拟南芥在ABA和NaCL胁迫条件下萌发率测定第96-97页
   ·T3代VvWRKY21基因拟南芥对干旱处理的抗性分析第97-99页
   ·转VvWRKY21基因拟南芥对盐胁迫处理的抗性分析第99页
   ·VvWRKY30转基因拟南芥的鉴定第99-100页
   ·VvWRKY30转基因拟南芥在ABA和NaCl胁迫条件下的根长比较第100-101页
   ·VvWRKY30转基因拟南芥在盐胁·迫下的抗性第101-102页
 3 讨论第102-104页
全文结论第104-106页
主要创新点第106-108页
参考文献第108-124页
附录第124-132页
大肠杆菌感受态的制备和转化第132-134页
根癌农杆菌感受态的制备及其转化第134-136页
博士期间发表的研究论文第136-138页
致谢第138页

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