芝麻枯萎病抗性关联分析
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表及其英汉对照 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-30页 |
| ·芝麻与我国芝麻生产 | 第12页 |
| ·芝麻枯萎病 | 第12-16页 |
| ·芝麻枯萎病病原学特征 | 第12-13页 |
| ·芝麻枯萎病病菌致病机制 | 第13-14页 |
| ·芝麻枯萎病发病症状及等级划分标准 | 第14-16页 |
| ·芝麻苗期枯萎病发生等级划分标准 | 第14页 |
| ·芝麻成株期枯萎病发生等级划分标准 | 第14-16页 |
| ·芝麻枯萎病的接种方法 | 第16页 |
| ·芝麻枯萎病抗性遗传研究进展 | 第16-17页 |
| ·芝麻枯萎病的防治 | 第17-18页 |
| ·分子标记的研究进展 | 第18-24页 |
| ·分子标记的类型 | 第18-19页 |
| ·SNP标记 | 第19-21页 |
| ·SNP标记的特点 | 第19-20页 |
| ·SNP位点的识别和检测方法 | 第20页 |
| ·SNP标记的设计方法 | 第20-21页 |
| ·IDNEL标记的特点 | 第21-22页 |
| ·INDEL标记的设计方法 | 第22页 |
| ·芝麻分子标记开发研究进展 | 第22-24页 |
| ·关联分析应用研究进展 | 第24-28页 |
| ·连锁不平衡 | 第24-26页 |
| ·连锁不平衡的度量 | 第25页 |
| ·影响LD的因素和LD衰减 | 第25-26页 |
| ·关联分析的策略 | 第26页 |
| ·关联分析的基本方法 | 第26-27页 |
| ·基因型分析 | 第26页 |
| ·表型鉴定 | 第26-27页 |
| ·统计分析方法 | 第27页 |
| ·芝麻全基因组关联分析研究进展 | 第27-28页 |
| ·本研究目的与意义 | 第28-30页 |
| 第二章 芝麻种质枯萎病抗性关联分析 | 第30-60页 |
| ·材料与方法 | 第30-35页 |
| ·供试材料 | 第30页 |
| ·实验病菌 | 第30页 |
| ·枯萎病抗性鉴定 | 第30页 |
| ·基因型鉴定 | 第30-32页 |
| ·分子标记分析 | 第32-34页 |
| ·SNP和INDEL位点挖掘 | 第32页 |
| ·SNP和INDE引物设计及PCR分析 | 第32-34页 |
| ·PCR扩增产物检测 | 第34页 |
| ·数据统计与分析 | 第34-35页 |
| ·遗传多样性分析和聚类分析 | 第34页 |
| ·连锁不平衡(LD)的估算 | 第34-35页 |
| ·群体结构和主成分分析 | 第35页 |
| ·Kinship分析 | 第35页 |
| ·关联分析 | 第35页 |
| ·结果与分析 | 第35-55页 |
| ·SNP和INDEL标记分析 | 第35-37页 |
| ·SNP和INDEL标记开发及多态性分析 | 第35-37页 |
| ·SNP和INDEL标记的聚类分析 | 第37-38页 |
| ·SNP和INDEL位点间的连锁不平衡 | 第38页 |
| ·群体结构与主成分分析 | 第38-40页 |
| ·群体Kinship分析 | 第40-41页 |
| ·芝麻种质对枯萎病的抗性评价 | 第41-50页 |
| ·124份芝麻自然群体的全基因组关联分析 | 第50-55页 |
| ·GLM-PCA模型的性状关联分析 | 第50-53页 |
| ·MLM-PCA+K模型的性状关联分析 | 第53-55页 |
| ·讨论 | 第55-58页 |
| ·芝麻枯萎病抗源鉴定 | 第55页 |
| ·芝麻枯萎病抗性评价 | 第55-56页 |
| ·SNP和INDEL标记分析 | 第56页 |
| ·最适关联模型比较分析 | 第56-57页 |
| ·芝麻枯萎病及相关性状的全基因组关联分析 | 第57-58页 |
| ·结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 附录 | 第68-74页 |
| 攻读硕士期间所发表论文 | 第74-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
