| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究背景和意义 | 第9-10页 |
| ·研究现状 | 第10-12页 |
| ·本论文的主要工作 | 第12-13页 |
| ·论文安排 | 第13-14页 |
| 第二章 研究背景介绍 | 第14-19页 |
| ·生物学背景知识 | 第14-16页 |
| ·基因表达谱数据矩阵 | 第14-15页 |
| ·基因表达调控及基因表达调控网络 | 第15-16页 |
| ·聚类思想 | 第16-18页 |
| ·聚类过程 | 第16-17页 |
| ·基因表达谱数据聚类概述 | 第17页 |
| ·常用聚类方法 | 第17-18页 |
| ·从局部到整体的研究方法 | 第18页 |
| ·本章小结 | 第18-19页 |
| 第三章 基于BIRCH的基因表达谱数据聚类分析 | 第19-33页 |
| ·BIRCH算法 | 第19-22页 |
| ·聚类特征 | 第19-20页 |
| ·聚类特征树 | 第20-21页 |
| ·BIRCH算法特性 | 第21页 |
| ·BIRCH算法描述 | 第21-22页 |
| ·建立聚类特征树 | 第22-24页 |
| ·构建聚类特征树的算法CFtree_insert() | 第23页 |
| ·非叶子节点分裂算法CFtree_split_child() | 第23-24页 |
| ·叶节点分裂算法CFtree_split_leaf() | 第24页 |
| ·参数选择对聚类效果的影响 | 第24-27页 |
| ·平衡系数B及分支系数L | 第24-26页 |
| ·阈值T | 第26-27页 |
| ·实验结果与分析 | 第27-32页 |
| ·实验数据 | 第27页 |
| ·结果分析 | 第27-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 基因表达谱趋势匹配搜索算法研究 | 第33-55页 |
| ·基因表达谱趋势匹配搜索算法简介 | 第33-36页 |
| ·基因表达谱聚类分析的问题 | 第33页 |
| ·从局部到整体的研究思想 | 第33-34页 |
| ·基因表达谱趋势匹配搜索算法的提出 | 第34-36页 |
| ·手绘基因表达谱数据的拟合分析 | 第36-41页 |
| ·B样条曲线分析 | 第36-37页 |
| ·B样条曲线逆推分析 | 第37页 |
| ·逆推得出 B 样条曲线 | 第37-41页 |
| ·基因表达谱趋势匹配搜索算法 | 第41-44页 |
| ·基因表达谱数据间的距离 | 第41页 |
| ·基因表达谱数据的相似系数 | 第41-43页 |
| ·基于趋势匹配搜索算法的Gesture实现 | 第43-44页 |
| ·Gesture软件的实验与结果分析 | 第44-54页 |
| ·四种可以选择的模式 | 第45-49页 |
| ·Gesture效用的验证与分析 | 第49-53页 |
| ·绘制基因调控网络 | 第53-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 第五章 总结与展望 | 第55-58页 |
| ·特色与创新 | 第55-57页 |
| ·研究工作展望 | 第57-58页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
