| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第10-14页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 第1章 研究背景 | 第16-24页 |
| ·阿尔兹海默病概述 | 第16-20页 |
| ·阿尔兹海默病的病理特征 | 第16-18页 |
| ·阿尔兹海默病的发病机理假说 | 第18-19页 |
| ·阿尔兹海默病的分子诊断研究 | 第19-20页 |
| ·阿尔兹海默病的转录组研究 | 第20页 |
| ·阿尔兹海默病的基因组研究 | 第20-21页 |
| ·阿尔兹海默病的整合数据库进展 | 第21-22页 |
| ·阿尔兹海默病的小鼠模型及药物处理等研究 | 第22-24页 |
| 第2章 数据和方法 | 第24-32页 |
| ·实验数据 | 第24-26页 |
| ·实验材料的采集和数据的获取 | 第24页 |
| ·芯片实验 | 第24页 |
| ·二代测序 | 第24-25页 |
| ·公共数据库开放下载研究数据 | 第25-26页 |
| ·分析方法 | 第26-30页 |
| ·原始数据的预处理 | 第26页 |
| ·基因差异表达分析 | 第26-27页 |
| ·基因功能富集和调控路径分析 | 第27页 |
| ·队列研究的分类器 | 第27页 |
| ·基因共表达分析 | 第27-28页 |
| ·基因调控共模式分析 | 第28页 |
| ·衰老基因的选择与聚类 | 第28页 |
| ·全基因组关联分析(GWAS) | 第28-29页 |
| ·基因的功能网络(network)分析 | 第29页 |
| ·基因与表型相关性分析 | 第29-30页 |
| ·数据库的构建 | 第30-32页 |
| ·数据库中数据信息的搜集与处理 | 第30-31页 |
| ·数据库的构建 | 第31-32页 |
| 第3章 结果和讨论 | 第32-68页 |
| ·排除WMH因素的AD相关血液差异RNA表达谱 | 第32-37页 |
| ·AD病人血液中差异RNA表达谱 | 第32-33页 |
| ·AD组与对照组的判别分类 | 第33-34页 |
| ·表达水平上改变最显著的基因 | 第34页 |
| ·差异基因的功能和路径 | 第34-35页 |
| ·联合其他研究AD血液与脑转录组之比较 | 第35-36页 |
| ·44个重叠基因的细胞功能 | 第36-37页 |
| ·在AD血液和脑研究中都差异表达的基因 | 第37页 |
| ·阿尔兹海默病人脑组织中稳健差异表达的基因 | 第37-45页 |
| ·基因失调的频数与它的重现性高度相关 | 第37-38页 |
| ·AD中高频数失调的基因的功能 | 第38-39页 |
| ·100个最高频数失调表达的基因及其独立数据集验证 | 第39-41页 |
| ·这一百个基因与脑的发育和衰老高度相关 | 第41页 |
| ·与AD疾病严重程度高度相关的基因 | 第41-43页 |
| ·较小受损脑区存在转录“缓冲垫” | 第43-45页 |
| ·AD中基因表达的关键调控因子 | 第45页 |
| ·阿尔兹海默病基因失调整合数据库AlzBase | 第45-55页 |
| ·AlzBase基因数据整合 | 第45-47页 |
| ·AlzBase基因的查询 | 第47-48页 |
| ·AlzBase数据库中的推荐候选基因 | 第48-49页 |
| ·AD遗传学研究的推荐候选基因 | 第49-50页 |
| ·脑衰老和AD | 第50-51页 |
| ·脑基因共表达网络和AD | 第51-53页 |
| ·基因PLD3和MEF2C的重要作用和证据 | 第53页 |
| ·可能用于组别鉴定的报告基因 | 第53-55页 |
| ·AD的全基因组关联分析 | 第55-62页 |
| ·AD和MCI单位点SNP关联结果及比较 | 第55-56页 |
| ·AD的全基因组关联SNPs和相关表型的权重网络 | 第56-57页 |
| ·AD和MCI生物途径集合的SNPs关联结果及比较 | 第57-58页 |
| ·AD和MCI新发现SNV关联位点的分析 | 第58-62页 |
| ·早发型AD与晚发型AD转录组之比较 | 第62-68页 |
| ·EOAD和LOAD差异表达基因的情况 | 第62-63页 |
| ·EOAD和LOAD的DEGs基因富集情况之比较 | 第63-66页 |
| ·EOAD和LOAD排名靠前的差异表达基因 | 第66-68页 |
| 第4章 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-82页 |
| 附录 | 第82-130页 |
| 附图 | 第82-88页 |
| 附表 | 第88-130页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第130-131页 |