| 论文摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| 第一节 大鼠是科学研究的一种重要模型 | 第12页 |
| 第二节 测序技术的发展和RNA-seq技术 | 第12-16页 |
| 1. 测序技术的发展 | 第12-14页 |
| 2. RNA-seq技术原理和流程 | 第14-16页 |
| 3. 链特异性RNA-seq测序的提出 | 第16页 |
| 第三节 本课题研究背景与意义 | 第16-18页 |
| 1. 研究背景 | 第16-17页 |
| 2. 研究意义 | 第17-18页 |
| 第四节 RNA编辑及其研究进展 | 第18-23页 |
| 1. RNA编辑的发现 | 第18-19页 |
| 2. RNA编辑的类型 | 第19页 |
| 3. RNA编辑的机制和特征 | 第19-21页 |
| 4. RNA编辑的研究进展 | 第21-23页 |
| 第五节 论文的主要目标和结构安排 | 第23-24页 |
| 第二章 数据和方法 | 第24-36页 |
| 第一节 研究数据的来源及数据的预处理 | 第24-28页 |
| 1. 实验数据的来源 | 第24-25页 |
| 2. 实验数据的预处理 | 第25-28页 |
| 第二节 本文分析的方法 | 第28-36页 |
| 1. 基因表达水平的定量方法 | 第28-29页 |
| 2. RNA编辑位点筛选的方法 | 第29-33页 |
| 3. RNA编辑类型的确定方法 | 第33-35页 |
| 4. RNA编辑事件的注释方法 | 第35-36页 |
| 第三章 大鼠多组织多时期RNA编辑事件的全面探究 | 第36-52页 |
| 第一节 RNA编辑事件在染色体上的分布 | 第36-37页 |
| 第二节 RNA编辑事件在基因组上的分布 | 第37-40页 |
| 第三节 RNA编辑事件与基因表达水平的相关性分析 | 第40-42页 |
| 第四节 RNA编辑事件的编辑类型以及其上下游序列的特征分析 | 第42-44页 |
| 第五节 RNA编辑事件对氨基酸变化的潜在影响 | 第44-46页 |
| 第六节 RNA编辑事件对miRNA靶标的影响 | 第46页 |
| 第七节 RNA编辑事件对翻译过程的影响 | 第46-48页 |
| 第八节 RNA编辑事件对RNA二级结构和蛋白三维结构的影响 | 第48-51页 |
| 第九节 RNA编辑事件的组织特异性分析 | 第51-52页 |
| 第四章 结论与展望 | 第52-55页 |
| 附录 | 第55-60页 |
| 附录一 microRNA靶标作用区域的RNA编辑位点列表 | 第55-59页 |
| 附录二 组织特异性的RNA编辑位点的富集分析 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表的文章 | 第69-70页 |
| 后记 | 第70页 |
