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人Sonic Hedgehog基因远距离增强子ZRS调节基因表达机制的初步研究

中文摘要第1-5页
Abstract第5-10页
缩略词第10-11页
第1章 前言第11-16页
   ·Sonic Hedgehog基因简介第11-13页
   ·shh基因表达调控模式简介第13-15页
   ·本课题的实验目的、意义和研究策略第15-16页
     ·实验目的和意义第15页
     ·研究策略第15-16页
第2章 实验材料和方法第16-29页
   ·实验材料第16-19页
     ·菌种和载体第16页
     ·人血液样本第16页
     ·细胞系和细胞培养基第16页
     ·工具酶,试剂(盒)第16-17页
     ·试剂的配制第17-19页
   ·实验仪器第19页
   ·实验方法第19-29页
     ·提取质粒DNA第20页
     ·切胶回收DNA第20-21页
     ·纯化PCR产物及酶切产物第21-22页
     ·提取血液中的基因组DNA第22-23页
     ·连接反应第23页
     ·质粒DNA及连接产物转化感受态细胞第23-24页
     ·菌落PCR鉴定阳性克隆第24页
     ·SDS-PAGE电泳第24-25页
     ·细胞复苏第25-26页
     ·细胞冻存第26页
     ·细胞计数第26-27页
     ·HEK-293A细胞转染第27页
     ·双荧光素酶报告基因检测系统第27-29页
第3章 ZRS点突变的筛选第29-36页
   ·从病人样本中调取ZRS序列并测序分析第29-32页
     ·实验材料第29页
     ·方法,结果及分析第29-32页
       ·从病人血液样本中抽提基因组DNA并进行定量第29页
       ·从提取的基因组中克隆带有ZRS序列的DNA片段第29-31页
       ·4个病患样本中有2个出现了点突变第31-32页
   ·病人样本基因组shh基因外显子序列的测序分析第32-34页
     ·实验材料第32页
     ·方法、结果及分析第32-34页
   ·表型正常人的ZRS序列突变分析第34-35页
     ·实验材料第34页
     ·方法、结果及分析第34-35页
   ·小结第35-36页
第4章 双荧光素酶报告系统检测ZRS突变型和野生型的增强子活性第36-46页
   ·构建pGL3-promoter-ZRS/BLZRS质粒第36-40页
     ·实验材料第36页
     ·方法,结果及分析第36-40页
   ·转染HEK-293A细胞并检测荧光素酶活性第40-45页
     ·实验材料第40页
     ·方法,结果及分析第40-45页
   ·小结第45-46页
第5章 生物素标记ZRS特异性捕获与其作用的蛋白质第46-56页
   ·实验材料第46页
   ·方法,结果及分析第46-56页
     ·制备带有生物标记的DNA探针并验证标记效率第46-48页
     ·获取HEK-293A非变性细胞核蛋白并定量第48-50页
     ·DAPA(DNA蛋白质沉淀捕获)捕获与探针特异结合的蛋白质第50-54页
     ·捕获下的差异蛋白的质谱检测第54页
     ·BLZRS序列的转录因子结合位点预测第54-56页
第6章 结论第56-58页
参考文献第58-63页
附录第63-65页
个人简历第65-66页
致谢第66页

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