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基于逆转录环介导等温扩增技术的高灵敏度HIV-1 RNA检测

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
英文缩略词索引第13-15页
第一章 绪论第15-29页
   ·艾滋病及 HIV 概述第15-18页
     ·艾滋病简述第15页
     ·HIV 简述第15页
     ·HIV 形态结构与基因结构第15-16页
     ·HIV 致病机制第16-17页
     ·HIV 生物学特性第17-18页
     ·HIV 分型及分布第18页
   ·HIV 检测技术第18-21页
     ·抗体检测第19页
     ·抗原检测第19页
     ·核酸检测第19-20页
     ·常用检测方法比较第20-21页
     ·检测技术的发展趋势第21页
   ·环介导等温扩增技术第21-27页
     ·快速核酸检测的必要性第21-22页
     ·逆转录环节导等温扩增技术简介第22页
     ·逆转录环节导等温扩增法的引物第22-23页
     ·逆转录环节导等温扩增法的扩增原理第23-24页
     ·逆转录环节导等温扩增法的结果判定第24-25页
     ·逆转录环介导等温扩增法的优点第25-27页
     ·逆转录环节导等温扩增法在病毒检测方面的应用第27页
   ·本研究的意义及内容第27-29页
     ·本研究的意义第27-28页
     ·主要研究内容第28-29页
第二章 RT-LAMP 引物的设计第29-36页
   ·引言第29-30页
   ·实验材料与仪器第30页
   ·实验方法第30-31页
     ·确定研究基因并下载核酸序列第30-31页
     ·Vector NTI 基因序列比对并选择保守区第31页
     ·Primer Explorer V4 引物设计第31页
     ·引物评估第31页
   ·实验结果与讨论第31-35页
     ·HIV-1 gag 基因序列比对第31-32页
     ·Primer Explorer V4 引物设计第32-33页
     ·引物评估与选择第33-35页
   ·本章小结第35-36页
第三章 基于 HNB 颜色判定的可视化 RT-LAMP 对 HIV-1RNA 快速检测第36-49页
   ·引言第36-37页
   ·实验材料与仪器耗材第37-39页
     ·病毒标准品及临床样本第37-38页
     ·主要试剂第38页
     ·仪器和耗材第38-39页
     ·引物第39页
     ·软件第39页
   ·实验方法第39-42页
     ·目的基因质粒构建第39页
     ·RNA 的制备第39-40页
     ·RT-LAMP 引物设计与合成第40页
     ·RT-LAMP 反应体系及条件的建立第40-41页
     ·RT-LAMP 检测 HIV-1 的灵敏度第41页
     ·RT-LAMP 检测 HIV-1 的特异性第41页
     ·qRT-PCR 和 RT-LAMP 检测临床样本第41-42页
   ·实验结果与讨论第42-46页
     ·RT-LAMP 反应体系及条件的建立第42-43页
     ·RT-LAMP 检测 HIV-1 的灵敏度第43-44页
     ·RT-LAMP 检测 HIV-1 的特异性第44-45页
     ·RT-LAMP 和 qRT-PCR 检测临床样本的结果对比第45-46页
   ·本章小结第46-49页
第四章 基于 RT-LAMP 的 HIV-1 RNA 定量检测第49-63页
   ·引言第49-50页
   ·实验材料与仪器耗材第50-51页
     ·病毒标准品及临床样本第50页
     ·主要试剂第50-51页
     ·仪器和耗材第51页
     ·引物第51页
     ·软件第51页
   ·实验方法第51-54页
     ·RNA 的制备第51-52页
     ·定量 RT-LAMP 反应体系及条件的建立第52-53页
     ·定量 RT-LAMP 标准曲线第53页
     ·定量 RT-LAMP 最低检测限第53页
     ·定量 RT-LAMP 再现性实验第53页
     ·定量 RT-LAMP 特异性第53页
     ·定量 RT-LAMP 与 qRT-PCR 的一致性评估第53-54页
   ·实验结果与讨论第54-60页
     ·定量 RT-LAMP 标准曲线第54-55页
     ·定量 RT-LAMP 最低检测限第55-56页
     ·定量 RT-LAMP 再现性第56-58页
     ·定量 RT-LAMP 特异性第58页
     ·IU 与 copy number 的换算第58-59页
     ·定量 RT-LAMP 与 qRT-PCR 的一致性评估第59-60页
   ·本章小结第60-63页
结论与展望第63-66页
参考文献第66-74页
附录 最佳引物 OLIGO 评估第74-82页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第82-83页
致谢第83-85页
附件第85页

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