| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 英文缩略词表 | 第12-13页 |
| 第1章 引言 | 第13-29页 |
| ·研究背景 | 第13-15页 |
| ·国内外研究进展 | 第15-16页 |
| ·椎间盘疾病病因的研究进展 | 第15-16页 |
| ·腰椎间盘退变性疾病可能的分子机制的研究进展 | 第16页 |
| ·芯片挖掘技术 | 第16-19页 |
| ·基因芯片的产生背景 | 第16-17页 |
| ·基因芯片技术的基本原理 | 第17-18页 |
| ·基因芯片数据的分析 | 第18-19页 |
| ·差异共表达基因（DCG） | 第19页 |
| ·GEO 数据库 | 第19-21页 |
| ·文本挖掘技术 | 第21-23页 |
| ·分子之间的关系 | 第23-24页 |
| ·生物学通路的定义及通路相关的数据库 | 第24-25页 |
| ·疾病与表型 | 第25-26页 |
| ·人类基因与小鼠基因的同源性关系 | 第26-27页 |
| ·研究目的及意义 | 第27-29页 |
| 第2章 芯片数据差异表达分析 | 第29-41页 |
| ·实验目的 | 第29页 |
| ·材料与方法 | 第29-33页 |
| ·基因芯片表达谱数据的获取 | 第29-30页 |
| ·差异表达基因的预处理及筛选 | 第30页 |
| ·生物学通路数据分析 | 第30-31页 |
| ·蛋白质与蛋白质相互作用分析 | 第31-32页 |
| ·GSE23130 芯片数据聚类分析 | 第32-33页 |
| ·结果 | 第33-36页 |
| ·椎间盘退化相关的差异表达基因 | 第33页 |
| ·差异表达基因的功能富集分析结果 | 第33-34页 |
| ·蛋白质与蛋白质相互作用 | 第34-36页 |
| ·椎间盘组织的聚类分析 | 第36页 |
| ·讨论 | 第36-39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 第3章 芯片数据差异共表达分析 | 第41-49页 |
| ·实验目的 | 第41页 |
| ·材料与方法 | 第41-44页 |
| ·基因芯片表达谱数据的获取 | 第42页 |
| ·差异共表达基因数据的预处理及筛选 | 第42-43页 |
| ·生物学通路数据的获取与分析 | 第43页 |
| ·转录因子与转录因子靶基因数据 | 第43-44页 |
| ·实验结果 | 第44-46页 |
| ·DCGs 和 DCLs 的筛选结果 | 第44页 |
| ·识别相关的生物学通路 | 第44-45页 |
| ·基因调控作用分析 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第4章 文本挖掘分析 | 第49-67页 |
| ·实验目的 | 第49页 |
| ·材料与方法 | 第49-54页 |
| ·数据的获取 | 第49-50页 |
| ·数据的预处理：除噪 | 第50-52页 |
| ·人、小鼠及 HPRD 间数据的比较 | 第52页 |
| ·疾病、表型和基因间关系的建立 | 第52页 |
| ·人类腰椎间盘退变性疾病相关基因的分子相关关系网络的构建 | 第52-53页 |
| ·网络模块的划分 | 第53-54页 |
| ·KEGG 通路富集分析 | 第54页 |
| ·结果 | 第54-62页 |
| ·文本挖掘数据统计结果 | 第54-55页 |
| ·人和小鼠的网络与 HPRD 数据比较结果 | 第55-56页 |
| ·腰椎间盘退变性疾病相关表型和基因 | 第56-57页 |
| ·突变基因的生物学过程分析结果 | 第57-58页 |
| ·疾病相关基因的互作组网络 | 第58-59页 |
| ·分子互作网络功能富集分析 | 第59-60页 |
| ·网络模块分析 | 第60-62页 |
| ·讨论 | 第62-65页 |
| ·本章小结 | 第65-67页 |
| 第5章 结论 | 第67-69页 |
| 创新点自评 | 第69-71页 |
| 本文的创新点 | 第69页 |
| 以往研究不足 | 第69-70页 |
| 本文的亮点 | 第70-71页 |
| 主要参考文献 | 第71-79页 |
| 附录 | 第79-87页 |
| 作者简介及科研成果 | 第87-88页 |