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棉花中一个新的Parvulin类型肽酰脯氨酰顺反异构酶的功能分析

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-13页
1 前言第13-31页
   ·蛋白质折叠第13-15页
     ·蛋白质折叠研究的概况与意义第13-14页
     ·蛋白质的体内折叠第14-15页
   ·肽酰脯氨酰顺反异构酶第15-24页
     ·肽酰脯氨酰顺反异构酶概述第15-16页
     ·脯氨酰顺反异构酶家族第16-17页
     ·蛋白质折叠中肽酰脯氨酰顺反异构酶的作用第17-18页
     ·PPI 的酶学机理第18-20页
     ·脯氨酰顺反异构酶既是折叠酶又是分子伴侣第20-22页
       ·分子伴侣的定义第21页
       ·分子伴侣概述第21页
       ·分子伴侣家族的分类和性质第21-22页
       ·研究蛋白质分子伴侣功能的理想模型第22页
       ·分子伴侣研究当中的一些思考第22页
     ·脯氨酰顺反异构酶的其它功能第22-24页
   ·肽酰脯氨酰顺反异构酶在植物中的研究第24-25页
     ·植物中 parvulins 类型 PPI 的研究进展第24页
     ·植物中 parvulins 的功能第24-25页
   ·研究蛋白质活性位点的方法第25-28页
     ·蛋白质的化学修饰概述第25-26页
     ·蛋白质侧链基团各种氨基酸残基的修饰反应第26-27页
     ·蛋白质的定点突变第27-28页
   ·分子对接模拟酶与底物的结合方式第28-30页
     ·分子对接第28页
     ·受体结构分子的准备第28-29页
     ·分子对接运算第29-30页
   ·本研究的目的意义第30-31页
2 材料与方法第31-44页
   ·实验材料第31-32页
     ·cDNA 文库第31页
     ·菌株和质粒第31页
     ·工具酶和生化试剂第31页
     ·主要实验仪器第31页
     ·引物第31-32页
   ·主要试剂的配制第32-35页
     ·实验相关溶液的配制第32-34页
       ·碱裂解法提取质粒相关溶液的配制第32-33页
       ·蛋白含量测定相关溶液的配制第33页
       ·SDS-PAGE 缓冲液的配制第33-34页
       ·DTNB 法测定半胱氨酸含量相关溶液的配制第34页
       ·感受态制备相关试剂的配制第34页
     ·培养基的配制第34-35页
   ·实验方法第35-44页
     ·GhPPI 基因的扩增、克隆及序列测定第35-39页
       ·引物设计第35页
       ·GhPPI 基因的 PCR 扩增第35-36页
       ·GhPPI 基因 PCR 扩增产物的回收第36页
       ·回收产物与 pMD18-T simple 载体连接第36页
       ·感受态大肠杆菌 DH5α的制备第36-37页
       ·连接产物的转化第37页
       ·阳性克隆的筛选第37-39页
       ·DNA 序列测定第39页
     ·棉花 GhPPI 的活性分析第39-42页
       ·原核表达载体的构建第39-41页
       ·E.coli BL21 原核表达的诱导第41页
       ·聚丙烯凝胶电泳(SDS-PAGE)第41-42页
     ·原核表达 GhPPI 的纯化第42-43页
       ·粗酶液的制取第42页
       ·亲和层析纯化第42-43页
       ·GhPPI 蛋白质的修饰第43页
       ·GhPPI 蛋白纯度的鉴定及分子量测定第43页
     ·兔肌肌酸激酶酶活性测定第43-44页
       ·兔肌肌酸激酶的分离纯化第43页
       ·蛋白质含量的测定第43-44页
3 结果与分析第44-65页
   ·氨基酸序列同源性分析表明 AY972810 属于 PPI 中的 parvulins 家族第44-45页
     ·棉花 GhPPI 的碱基及其编码的氨基酸序列第44页
     ·氨基酸序列同源性分析第44-45页
   ·同源蛋白聚类分析表明 GhPPI 与 AtPin2、LjPar2 进化距离比较近第45-48页
   ·GhPPI 原核表达产物的 PPI 酶活性测定第48-53页
     ·棉花 GhPPI 基因的扩增及序列测定第48-49页
       ·棉花 GhPPI 基因的 PCR 扩增第48页
       ·重组质粒的 PCR 鉴定第48-49页
       ·重组质粒的酶切鉴定及序列测定第49页
     ·棉花盐胁迫筛选基因的原核表达、纯化及 PPI 活性测定第49-53页
       ·GhPPI 原核表达载体的构建和鉴定第49-50页
       ·GhPPI 的原核表达第50页
       ·GhPPI 蛋白的纯化第50-51页
       ·GhPPI 的 PPI 活性分析第51-53页
   ·棉花 GhPPI 活性位点及其必需氨基酸的预测第53-56页
     ·同源建模预测 GhPPI 的活性必需氨基酸第53-54页
     ·分子对接的方法推测 GhPPI 的活性必需氨基酸第54-56页
   ·化学修饰和定点突变的方法确定 GhPPI 的活性必需氨基酸第56-61页
     ·化学修饰法初步确定 GhPPI 的活性必需氨基酸第56-57页
     ·定点突变法确定 GhPPI 的活性必需氨基酸第57-61页
       ·GhPPI 突变质粒的获得第57-59页
       ·GhPPI 突变体的原核表达及纯化第59-60页
       ·突变 GhPPI 的活性测定第60-61页
       ·突变 GhPPI 的内源荧光光谱第61页
   ·棉花 GhPPI 在体外具有分子伴侣活性第61-65页
     ·兔肌肌酸激酶的分离纯化第62页
     ·棉花 GhPPI 的分子伴侣活性第62-63页
     ·突变 GhPPI 的分子伴侣活性第63-65页
4 讨论第65-69页
5 结论第69-70页
参考文献第70-79页
致谢第79-80页
攻读学位期间发表论文情况第80页

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