| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 主要符号对照表 | 第7-8页 |
| 第1章 引言 | 第8-17页 |
| ·问题背景和选题意义 | 第8-10页 |
| ·复杂网络 | 第10-13页 |
| ·小世界网络 | 第10-11页 |
| ·无标度网络 | 第11-12页 |
| ·网络科学 | 第12页 |
| ·PPI网络 | 第12-13页 |
| ·基因芯片 | 第13-14页 |
| ·研究现状 | 第14-16页 |
| ·论文的组织结构 | 第16-17页 |
| 第2章 算法介绍 | 第17-33页 |
| ·简单局部平均的不足 | 第20-23页 |
| ·局部平均的权重选择 | 第23-25页 |
| ·评价边的重要性 | 第25-28页 |
| ·协方差矩阵的估计 | 第28-33页 |
| ·贝叶斯推断 | 第29-30页 |
| ·多维正态分布相关系数的贝叶斯推断 | 第30-32页 |
| ·正则化技术与协方差矩阵的估计 | 第32-33页 |
| 第3章 子网的重新构建 | 第33-47页 |
| ·估计G* | 第33-36页 |
| ·模拟试验 | 第36-47页 |
| ·算法比较 | 第36-37页 |
| ·停止时刻的选择 | 第37-39页 |
| ·关于选择停止时刻的一些讨论 | 第39-43页 |
| ·不依赖边的随机排序假设的停止时刻选择方法 | 第43-47页 |
| 第4章 算法应用: PPI的子网提取 | 第47-55页 |
| ·在GO和KEGG pathway中的富集程度分析 | 第48-55页 |
| 第5章 总结与讨论 | 第55-58页 |
| ·总结 | 第55-56页 |
| ·存在的问题及今后的研究方向 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第62页 |