生物序列比对算法的研究与实现
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| ·背景 | 第8-14页 |
| ·生物信息学 | 第8-10页 |
| ·生物序列比对 | 第10-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-15页 |
| ·生物序列比对的研究目的和意义 | 第15-16页 |
| ·本文的内容安排 | 第16-17页 |
| 第2章 序列比对技术 | 第17-30页 |
| ·引言 | 第17页 |
| ·双序列比对问题 | 第17-25页 |
| ·双序列比对问题描述 | 第17-19页 |
| ·双序列全局比对算法 | 第19-21页 |
| ·双序列局部比对算法 | 第21-25页 |
| ·多序列比对问题 | 第25-29页 |
| ·多序列比对问题描述 | 第25-26页 |
| ·渐进多序列比对算法 | 第26-28页 |
| ·迭代多序列比对算法 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 基于后缀树的双序列比对算法 | 第30-44页 |
| ·SPLSA算法思想 | 第30-31页 |
| ·SPLSA算法设计 | 第31-41页 |
| ·后缀树建立 | 第31-34页 |
| ·寻找公共子串 | 第34-37页 |
| ·连接公共子串 | 第37-41页 |
| ·性能分析 | 第41页 |
| ·算法实验 | 第41-43页 |
| ·实验设计 | 第41-42页 |
| ·结果分析 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第4章 生物序列比对系统的实现 | 第44-54页 |
| ·引言 | 第44页 |
| ·多序列比对clustalW算法 | 第44-45页 |
| ·系统实现的功能 | 第45-48页 |
| ·数据处理流程 | 第48-49页 |
| ·系统功能模块 | 第49-53页 |
| ·数据的存取访问模块 | 第50-51页 |
| ·数据处理模块 | 第51页 |
| ·序列比对的交互模块 | 第51-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
