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高梁CMS相关DNA片段的序列分析及A/B核DNA上的差异研究

致谢第1-8页
中文摘要第8-11页
英文摘要第11-15页
缩写表第15-16页
第一篇 高粱CMS相关DNA片段的序列分析及A/B核DNA上的差异研究第16-95页
 前言第17-18页
 第1部份 材料与方法第18-27页
  1 植物材料第18页
  2 DNA的制备第18-21页
   2.1 总DNA的分离第18-19页
    2.1.1 总DNA的分离程序第19页
    2.1.2 DNA的电泳检测第19页
    2.1.3 紫外分光光度法测定DNA的含量第19页
   2.2 mtDNA的分离第19-20页
   2.3 cpDNA的分离第20-21页
  3 RAPD实验体系第21页
   3.1 引物、试剂及仪器第21页
   3.2 RAPD实验体系的优化第21页
  4 Southern杂交第21-24页
   4.1 目标DNA的回收——普通琼脂糖法第21-22页
   4.2 探针标记第22页
   4.3 DNA的限制性内切酶酶切及电泳第22页
   4.4 碱性条件厂DNA向尼龙膜的毛细管转移第22-23页
   4.5 与探针的杂交第23页
   4.6 杂交信号的检测第23-24页
  5 目标片段的定向克隆第24-26页
   5.1 含酶切位点的引物合成及PCR扩增第24页
   5.2 质粒载体与回收目标片段的双酶切第24-25页
   5.3 连接反应第25页
   5.4 感受态菌的制备及转化第25-26页
    5.4.1 氯化钙法制备DH5α感受态菌第25页
    5.4.2 DH5α感受态菌的转化第25-26页
   5.5 重组质粒的检测第26页
    5.5.1 重组质粒的微量提取第26页
    5.5.2 重组质粒的电泳检测第26页
    5.5.3 菌落杂交第26页
  6 测序第26-27页
  7 序列分析第27页
 第2部分 结果与分析第27-92页
  1 雄性不育系及其相关材料的选用第27-29页
  2 RAPD实验体系的优化第29-32页
   2.1 Mg~(2+)对RAPD—PCR的影响第29页
   2.2 Taqase浓度对RAPD-PCR的影响第29-30页
   2.3 dNTP含量对扩增效果的影响第30-31页
   2.4 模板DNA的量对扩增效果的影响第31页
   2.5 引物含量对扩增效果的影响第31页
   2.6 退火温度及仪器对苦扩增产物的影响第31-32页
   2.7 优化结论第32页
  3 与高粱CMS相关的DNA片段的克隆及测序第32-47页
   3.1 CMS相关的DNA片段的筛选第32-33页
   3.2 CMS相关的DNA片段的克隆第33-40页
    3.2.1 CMS相关的DNA片段的回收第34页
    3.2.2 CMS相关的DNA片段中酶切位点检测第34-37页
    3.2.3 添加酶切位点的PCR扩增第37-38页
    3.2.4 重组克隆的获得第38-39页
    3.2.5 插入片段的检测第39-40页
     电泳检测第39页
     酶切分析第39-40页
     杂交鉴定第40页
   3.3 克隆片段的核质定位及杂交分析第40-47页
    3.3.1 PCR扩增分析第40-42页
    3.3.2 Southern杂交分析第42-47页
     1) 片段SAP—06_(950)的杂交分析第43-45页
      与总DNA、mtDNA和cpDNA的杂交第43页
      与A_1~A_6、9E CMS系的杂交第43-45页
     2) 片段SAAU-02_(700)的杂交分析第45-46页
      与总DNA、mtDNA和cpDNA的杂交第45-46页
      与多酶切的A_1 Tx623 A/B总DNA的杂交第46页
      与A_1~A_6、9E CMS系的杂交第46页
     3) 片段SAY-19_(2300)的杂交分析第46-47页
  4 克隆片段的功能分析第47-70页
   4.1 克隆片段的同源性比对第47-62页
    4.1.1 片段SAP—06_(950)的同源性比对第47-49页
    4.1.2 片段SAAU—02_(700)的同源性比对第49-52页
    4.1.3 片段SA Y—19_(2300)的同源性比对第52-62页
   4.2 与克隆片段同源的基因的功能分析第62-63页
    4.2.1 与片段SAP—06_(950)同源的基因的功能第62页
    4.2.2 与片段SAAU—02_(700)同源的基因的功能第62-63页
    4.2.3 与片段SA Y—19_(2300)同源的基因的功能第63页
   4.3 克隆片段在CMS发生中的可能作用第63-70页
    4.3.1 mtDNA上新的ORF与CMS的发生第63-65页
    4.3.2 cpDNA 中的NAD(P)H脱氢酶与CMS的发生第65-68页
     发生在高粱ndhD基因内的结构变异第66-67页
     ndhD基因与CMS相关性探讨第67-68页
    4.3.3 光合作用中心脱辅基蛋白基因psaA1、psaA2与CMS的发生第68-70页
  5 不育系与保持系在核DNA上存在差异第70-92页
   前言第70页
   5.1 多态性引物的筛选第70-74页
   5.2 多态性片段的核质来源分析第74-81页
    5.2.1 以总DNA为模板扩增得到的片段第74-80页
    5.2.2 仅仅出现在胞质DNA的扩增中的片段第80-81页
   5.3 A/B核DNA与胞质DNA上的差异比较第81-83页
   5.4 寻找A/B核DNA上的差异第83-85页
    5.4.1 分析思路剖析第83-84页
    5.4.2 思路可靠性的证实第84-85页
   5.5 经典遗传学和生殖生物学认为:A/B核DNA上不应有差异第85-86页
   5.6 本实验发现A/B核DNA上存在差异及其证据第86-89页
    5.6.1 育种实践研究表明:A与B核DNA对CMS有着不同的贡献第86-87页
    5.6.2 分子生物学研究表明不育系的核DNA对CMS有作用第87-88页
    5.6.3 生理学方面的证据第88-89页
    5.6.4 Southern杂交图谱——一个有力的间接证据第89页
   5.7 A/B核DNA上的差异是如何产生的第89-90页
   5.8 该发现有何意义第90-92页
    5.8.1 开辟新的研究思路第90-91页
    5.8.2 对经典遗传学和生殖生物学理论的影响第91页
    5.8.3 缩短育种进程——该发现的实际意义第91-92页
 第3部分 结论第92-95页
  1 选取合适的材料十分必要第92页
  2 获得并克隆了三个具有代表性的与CMS相关的片段第92-93页
   2.1 不育系mtDNA上的一新的基因,并与核DNA同源第92-93页
   2.2 编码不育系cpDNA NAD(P)H脱氢酶第4亚基的基因存在序列变异第93页
   2.3 发现不育系与保持系的光系统Ⅰ psaA1,psaA2基因区存在结构差异第93页
  3 首次发现不育系与保持系核DNA上存在差异第93-95页
第二篇 综述:细胞质雄性不育与育性恢复的研究现状及其策略思考第95-114页
 1 CMS的发现第95-98页
 2 CMS在生产上的利用第98-99页
 3 恢复基因的遗传、定位、分子标记和克隆第99-101页
  3.1 遗传和染色体定位第99-100页
  3.2 与恢复基因连锁的分子标记第100-101页
  3.3 恢复基因的克隆第101页
 4 胞质基因与CMS第101-108页
  4.1 线粒体基因与CMS的关系第102-106页
   4.1.1 mtDNA结构水平上的差异第102-104页
   4.1.2 mtRNA转录水平上的差异第104-105页
   4.1.3 蛋白质水平上的差异第105-106页
  4.2 叶绿体基因与CMS的关系第106-108页
   4.2.1 cpDNA结构上的差异第106-107页
   4.2.2 叶绿体蛋白上的差异第107-108页
 5 核基因对雄性不育、育性恢复的影响第108-111页
  5.1 恢复基因改变线粒体CMS基因的结构第108页
  5.2 恢复基因影响线粒体CMS基因的转录本第108-109页
  5.3 恢复基因影响线粒体CMS基因的转录后加工第109-110页
  5.4 恢复基因影响线粒体CMS基因RNA的编辑第110页
  5.5 恢复基因影响线粒体CMS基因的翻译水平第110-111页
 6 CMS研究中存在的问题及对策第111-114页
  6.1 胞质基因不具可比性第111-112页
  6.2 不育系与保持系在核DNA上是否存在差异第112-114页
参考文献第114-125页
附录 攻读博士学位期间论文发表和撰写情况第125页

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