多序列比对的统计模型及算法
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| ·引言 | 第8-11页 |
| ·比对及免比对概述 | 第11-12页 |
| ·本文所做的工作 | 第12-14页 |
| 第二章 生物序列比对算法研究现状 | 第14-26页 |
| ·多序列比对算法研究进展 | 第14-22页 |
| ·渐进比对算法 | 第14-20页 |
| ·迭代比对算法 | 第20-21页 |
| ·一些其它多序列比对算法 | 第21-22页 |
| ·序列相似度计算方法研究进展 | 第22-25页 |
| ·本章小节 | 第25-26页 |
| 第三章 HMM的数学原理 | 第26-34页 |
| ·HMM的数学描述 | 第26-27页 |
| ·HMM的三个基本问题 | 第27-28页 |
| ·HMM基本问题的解法 | 第28-32页 |
| ·前向-后向算法 | 第28-30页 |
| ·Viterbi算法 | 第30页 |
| ·Baum-Welch算法 | 第30-32页 |
| ·本章小节 | 第32-34页 |
| 第四章 基于HMM及序列间一致性多序列比对算法 | 第34-50页 |
| ·算法的引入 | 第34-36页 |
| ·算法的描述 | 第36-43页 |
| ·后验概率矩阵的计算 | 第37-40页 |
| ·计算每两条序列的相似距离 | 第40-41页 |
| ·概率一致性转换 | 第41-42页 |
| ·向导树的建立 | 第42页 |
| ·渐进比对 | 第42-43页 |
| ·迭代过程 | 第43页 |
| ·算法分析 | 第43-44页 |
| ·实验结果及分析 | 第44-48页 |
| ·实验结果 | 第44-47页 |
| ·性能分析 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-50页 |
| 第五章 基于HMM的免比对算法 | 第50-58页 |
| ·算法的引入 | 第50页 |
| ·算法的描述 | 第50-53页 |
| ·用Markov模型测度序列相似性 | 第50-52页 |
| ·具体计算过程描述 | 第52-53页 |
| ·算法理论可行性分析 | 第53-54页 |
| ·实验结果 | 第54-57页 |
| ·实验方法 | 第54-55页 |
| ·实验结果及分析 | 第55-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 第六章 结束语 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 研究成果 | 第68页 |
