雀形目38种鸟类分子系统发育关系的初步研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 1 绪论 | 第7-21页 |
| ·引言 | 第7-8页 |
| ·传统分类学和系统学研究 | 第7页 |
| ·分子系统学研究 | 第7-8页 |
| ·鸟类分子系统学研究现状 | 第8-17页 |
| ·主要研究方法概述 | 第8-16页 |
| ·存在问题及研究前景 | 第16-17页 |
| ·雀形目鸟类分类及分子系统学研究现状 | 第17-20页 |
| ·本研究的内容及目的意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-27页 |
| ·样品采集 | 第21页 |
| ·基因组 DNA的提取及检测 | 第21页 |
| ·基因组 DNA的提取 | 第21页 |
| ·DNA质量检测 | 第21页 |
| ·引物设计、PCR扩增及扩增产物检测 | 第21-23页 |
| ·引物设计 | 第21-22页 |
| ·PCR扩增 | 第22页 |
| ·扩增产物检测 | 第22-23页 |
| ·PCR产物的回收与纯化 | 第23页 |
| ·PCR产物的 T- A克隆 | 第23-25页 |
| ·连接反应 | 第23页 |
| ·转化 | 第23-24页 |
| ·转化子蓝白斑筛选 | 第24页 |
| ·转化子的鉴定 | 第24-25页 |
| ·测序 | 第25页 |
| ·数据处理与分析 | 第25页 |
| ·系统树构建与检验 | 第25-27页 |
| ·邻接(NJ)法 | 第25-26页 |
| ·最小进化(ME)法 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-41页 |
| ·DNA提取结果 | 第27页 |
| ·PCR扩增结果 | 第27-28页 |
| ·测序结果 | 第28页 |
| ·两个基因的序列特征 | 第28-32页 |
| ·碱基组成 | 第28页 |
| ·核苷酸替代 | 第28-31页 |
| ·核苷酸插入和缺失 | 第31页 |
| ·密码子使用偏倚 | 第31-32页 |
| ·遗传距离 | 第32页 |
| ·基因同质性检验 | 第32页 |
| ·所研究雀形目鸟类的系统关系分析 | 第32-40页 |
| ·Cytb基因编码序列构建的系统发育树 | 第33-34页 |
| ·AK5基因非编码序列构建的系统发育树 | 第34页 |
| ·两个基因联合构建的系统发育树 | 第34-40页 |
| ·相对速率检验 | 第40-41页 |
| 4 讨论 | 第41-46页 |
| ·所研究雀形目鸟类的系统发育关系 | 第41-43页 |
| ·科级系统关系 | 第41-43页 |
| ·科下系统关系 | 第43页 |
| ·两个基因的系统发育效用 | 第43-44页 |
| ·雀形目鸟类的单系性 | 第44页 |
| ·类群分歧时间 | 第44页 |
| ·关于系统树构建方法的讨论 | 第44-46页 |
| 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-55页 |
| 附录 | 第55-61页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 独创性声明 | 第63页 |
| 学位论文版权使用授权书 | 第63页 |
