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U43及其侧翼序列中snoRNA的鉴定及基因组织和进化分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
目录第8-10页
第一章 综述第10-25页
 第一节 RNA组学第10页
 第二节 SNORNA的分类、结构和功能第10-14页
  1 Box C/D snoRNA第11页
  2 Box H/ACA snoRNA第11-12页
  3 MRP RNA第12-13页
  4 scaRNA第13页
  5 分子伴侣第13页
  6 Orphan snoRNA第13-14页
 第三节 SNORNA结合蛋白第14-15页
 第四节 SNORNA的基因组织形式第15-20页
  1 脊椎动物的基因组织形式第16页
  2 植物基因组织形式第16-18页
  3 酵母基因组织形式第18页
  4 锥体虫基因组织形式第18-19页
  5 果蝇基因组织形式第19页
  6 snoRNA基因的其它组织形式第19-20页
 第五节 SNORNA鉴定方法第20-21页
  1 采用计算机RNA组学方法鉴定snoRNA第20-21页
  2 采用实验RNA组学方法鉴定snoRNA第21页
 第六节 SNORNA命名原则第21-22页
 第七节 SNORNP与遗传疾病第22-23页
  1 普来得-威利综合症第22页
  2 先天性角化不良第22-23页
  3 干骺端发育不良McKusick型第23页
 第八节 本论文的研究目的与意义第23-25页
第二章 材料与方法第25-42页
 第一节 材料第25-26页
  1 使用的数据库第25页
  2 供试菌株与培养基第25页
  3 主要仪器和设备第25-26页
 第二节 方法第26-42页
  1 snoRNA的计算机搜索及基因组织分析第26-27页
  2 酵母基因组DNA的制备第27-29页
  3 酵母总RNA的制备:热酸性酚抽提法第29-30页
  4 甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测总RNA第30-31页
  5 酵母总RNA中的DNA酶解第31-32页
  6 逆转录反应第32-33页
  7 PCR反应第33-34页
  8 PCR产物的鉴定与割胶回收纯化第34-35页
  9 割胶纯化的PCR产物与T-载体连接,构建重组体第35-36页
  10 制备冰冻的感受态细胞第36-37页
  11 重组体的转化第37-38页
  12 目的克隆菌落的筛选(菌落PCR)第38-39页
  13 选择性培养基的制备第39页
  14 质粒DNA的提取第39-40页
  15 测序第40-42页
第三章 结果第42-66页
 第一节 29个新U43基因的发现第42-46页
 第二节 U43的结构特征第46-47页
 第三节 U43侧翼序列中的SNORNA第47-53页
 第四节 U43多样的基因组织形式第53-56页
 第五节 酵母SNR70基因组织形式及表达分析第56-66页
  1 乳酸克鲁维酵母和解脂耶氏酵母总RNA的提取结果第59页
  2 两种酵母总DNA的提取第59-60页
  3 感受态细胞的制备第60-61页
  4 逆转录结果第61-62页
  5 重组体的转化第62页
  6 菌落PCR第62-63页
  7 质粒的提取第63页
  8 测序结果第63-66页
第四章 讨论第66-70页
 第一节 计算机RNA组学是鉴定SNORNA快速、高效的方法第66页
 第二节 U43对应于真核生物、古细菌和细菌都保守的甲基化位点第66-67页
 第三节 U43进化的机制第67-68页
 第四节 U43的共表达趋势和动、植物中U43共表达家族的进化推测第68-70页
研究工作总结第70-72页
参考文献第72-79页
缩略词第79-80页
致谢第80页

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