摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
目录 | 第8-10页 |
第一章 综述 | 第10-25页 |
第一节 RNA组学 | 第10页 |
第二节 SNORNA的分类、结构和功能 | 第10-14页 |
1 Box C/D snoRNA | 第11页 |
2 Box H/ACA snoRNA | 第11-12页 |
3 MRP RNA | 第12-13页 |
4 scaRNA | 第13页 |
5 分子伴侣 | 第13页 |
6 Orphan snoRNA | 第13-14页 |
第三节 SNORNA结合蛋白 | 第14-15页 |
第四节 SNORNA的基因组织形式 | 第15-20页 |
1 脊椎动物的基因组织形式 | 第16页 |
2 植物基因组织形式 | 第16-18页 |
3 酵母基因组织形式 | 第18页 |
4 锥体虫基因组织形式 | 第18-19页 |
5 果蝇基因组织形式 | 第19页 |
6 snoRNA基因的其它组织形式 | 第19-20页 |
第五节 SNORNA鉴定方法 | 第20-21页 |
1 采用计算机RNA组学方法鉴定snoRNA | 第20-21页 |
2 采用实验RNA组学方法鉴定snoRNA | 第21页 |
第六节 SNORNA命名原则 | 第21-22页 |
第七节 SNORNP与遗传疾病 | 第22-23页 |
1 普来得-威利综合症 | 第22页 |
2 先天性角化不良 | 第22-23页 |
3 干骺端发育不良McKusick型 | 第23页 |
第八节 本论文的研究目的与意义 | 第23-25页 |
第二章 材料与方法 | 第25-42页 |
第一节 材料 | 第25-26页 |
1 使用的数据库 | 第25页 |
2 供试菌株与培养基 | 第25页 |
3 主要仪器和设备 | 第25-26页 |
第二节 方法 | 第26-42页 |
1 snoRNA的计算机搜索及基因组织分析 | 第26-27页 |
2 酵母基因组DNA的制备 | 第27-29页 |
3 酵母总RNA的制备:热酸性酚抽提法 | 第29-30页 |
4 甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测总RNA | 第30-31页 |
5 酵母总RNA中的DNA酶解 | 第31-32页 |
6 逆转录反应 | 第32-33页 |
7 PCR反应 | 第33-34页 |
8 PCR产物的鉴定与割胶回收纯化 | 第34-35页 |
9 割胶纯化的PCR产物与T-载体连接,构建重组体 | 第35-36页 |
10 制备冰冻的感受态细胞 | 第36-37页 |
11 重组体的转化 | 第37-38页 |
12 目的克隆菌落的筛选(菌落PCR) | 第38-39页 |
13 选择性培养基的制备 | 第39页 |
14 质粒DNA的提取 | 第39-40页 |
15 测序 | 第40-42页 |
第三章 结果 | 第42-66页 |
第一节 29个新U43基因的发现 | 第42-46页 |
第二节 U43的结构特征 | 第46-47页 |
第三节 U43侧翼序列中的SNORNA | 第47-53页 |
第四节 U43多样的基因组织形式 | 第53-56页 |
第五节 酵母SNR70基因组织形式及表达分析 | 第56-66页 |
1 乳酸克鲁维酵母和解脂耶氏酵母总RNA的提取结果 | 第59页 |
2 两种酵母总DNA的提取 | 第59-60页 |
3 感受态细胞的制备 | 第60-61页 |
4 逆转录结果 | 第61-62页 |
5 重组体的转化 | 第62页 |
6 菌落PCR | 第62-63页 |
7 质粒的提取 | 第63页 |
8 测序结果 | 第63-66页 |
第四章 讨论 | 第66-70页 |
第一节 计算机RNA组学是鉴定SNORNA快速、高效的方法 | 第66页 |
第二节 U43对应于真核生物、古细菌和细菌都保守的甲基化位点 | 第66-67页 |
第三节 U43进化的机制 | 第67-68页 |
第四节 U43的共表达趋势和动、植物中U43共表达家族的进化推测 | 第68-70页 |
研究工作总结 | 第70-72页 |
参考文献 | 第72-79页 |
缩略词 | 第79-80页 |
致谢 | 第80页 |