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鳅超科鱼类分子系统发育研究

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
第一章 文献综述第13-38页
 1 系统发育系统学第13-17页
  1.1 系统发育系统学的概念和基本原理第13-14页
  1.2 与系统发育系统学相关的概念第14页
  1.3 系统发育系统学的发展第14-15页
  1.4 系统发育系统学中性状的选取和极化第15-17页
   1.4.1 性状的选取第15-16页
   1.4.2 性状的极化第16-17页
 2 分子进化第17-19页
  2.1 分子进化的研究领域及分子进化的动力第17-18页
  2.2 分子数据对系统发育研究的影响第18-19页
 3 分子系统学第19-25页
  3.1 分子标记的选择第19-21页
  3.2 分子系统发育的推断方法第21-23页
  3.3 系统树的统计检验第23-24页
  3.4 分子系统发育的分析软件第24-25页
 4 鳅超科鱼类的分类及系统发育研究进展第25-36页
  4.1 鳅超科的系统位置及类群划分的研究第26-31页
  4.2 鳅超科中鳅科和平鳍鳅科的研究历史第31-32页
  4.3 鳅科及平鳍鳅科亚群的系统学研究第32-36页
   4.3.1 沙鳅亚科第33-34页
   4.3.2 花鳅亚科第34-35页
   4.3.3 条鳅亚科及平鳍鳅科第35-36页
 5 本研究的目的意义第36-38页
第二章 鳅超科鱼类线粒体细胞色素b基因和控制区序列进化研究及其系统发育意义第38-69页
 1 材料与方法第39-53页
  1.1 实验所用标本第39页
  1.2 实验器材第39-48页
  1.3 研究方法第48-52页
   1.3.1 基因组 DNA的提取第48-50页
   1.3.2 PCR扩增第50-51页
   1.3.3 PCR产物回收第51-52页
   1.3.4 基因测序第52页
  1.4 数据分析方法第52-53页
 2 结果第53-64页
  2.1 序列变异情况第53-57页
  2.2 序列变异与目前鳅超科鱼类分类之间的关系第57-58页
  2.3 鳅超科鱼类系统发育关系的分析第58-64页
 3 讨论第64-69页
  3.1 控制区序列的进化机制第64页
  3.2 线粒体 DNA cyt b基因和控制区序列的系统发育意义第64-65页
  3.3 鳅超科的系统分类第65-67页
  3.4 鳅类各类群内部的系统发育关系第67-69页
第三章 基于线粒体cyt b基因的沙鳅科鱼类系统发育关系分析第69-81页
 1 材料和方法第69-73页
  1.1 研究材料第69-71页
  1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增第71-72页
  1.3 PCR产物的纯化和测序第72页
  1.4 数据处理及分析第72-73页
 2 结果第73-79页
  2.1 沙鳅科cyt b基因序列的变异第73页
  2.2 系统发育分析第73-79页
 3 讨论第79-81页
  3.1 沙鳅鱼类的单系性第79页
  3.2 沙鳅科内属的有效性第79-80页
  3.3 沙鳅科内属间系统发育关系第80页
  3.4 下一步的研究第80-81页
第四章 沙鳅科鱼类控制区序列结构分析及其系统发育意义第81-101页
 1 材料和方法第82-84页
  1.1 研究材料第82-83页
  1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增第83页
  1.3 PCR产物的纯化和测序第83-84页
  1.4 数据处理及分析第84页
 2 结果第84-99页
  2.1 沙鳅科鱼类线粒体DNA控制区序列及变异第84-85页
  2.2 终止序列区(ETAS)第85页
  2.3 中央保守区(CD)第85-95页
  2.4 保守序列区(CSB)第95页
  2.5 系统发育关系分析第95-99页
 3 讨论第99-101页
  3.1 沙鳅科控制区特点及用于系统发育研究的可行性第99-100页
  3.2 沙鳅科的系统发育关系第100-101页
第五章 花鳅科鱼类系统发育研究及花鳅属生物地理学初探第101-112页
 1 材料和方法第101-104页
  1.1 研究材料第101-102页
  1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增第102页
  1.3 PCR产物的纯化和测序第102-104页
  1.4 数据处理及分析第104页
 2 结果第104-109页
  2.1 花鳅科鱼类cyt b基因序列的变异第104-105页
  2.2 分子系统发育关系第105-109页
 3 讨论第109-112页
  3.1 花鳅属的单系性及类群划分第109-110页
  3.2 花鳅科的系统发育关系第110页
  3.3 花鳅属鱼类的生物地理学过程第110-112页
第六章 鳅超科鱼类主要类群的演化过程及形态特征的分化第112-121页
 1 材料与方法第113-114页
 2 结果与讨论第114-121页
  2.1 鳅超科鱼类主要类群的分化时间第114-116页
  2.2 鳅超科鱼类形态特征的分化及生态适应第116-121页
参考文献第121-134页
致谢第134-135页
附录第135页

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