摘要 | 第1-10页 |
Abstract | 第10-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-38页 |
1 系统发育系统学 | 第13-17页 |
1.1 系统发育系统学的概念和基本原理 | 第13-14页 |
1.2 与系统发育系统学相关的概念 | 第14页 |
1.3 系统发育系统学的发展 | 第14-15页 |
1.4 系统发育系统学中性状的选取和极化 | 第15-17页 |
1.4.1 性状的选取 | 第15-16页 |
1.4.2 性状的极化 | 第16-17页 |
2 分子进化 | 第17-19页 |
2.1 分子进化的研究领域及分子进化的动力 | 第17-18页 |
2.2 分子数据对系统发育研究的影响 | 第18-19页 |
3 分子系统学 | 第19-25页 |
3.1 分子标记的选择 | 第19-21页 |
3.2 分子系统发育的推断方法 | 第21-23页 |
3.3 系统树的统计检验 | 第23-24页 |
3.4 分子系统发育的分析软件 | 第24-25页 |
4 鳅超科鱼类的分类及系统发育研究进展 | 第25-36页 |
4.1 鳅超科的系统位置及类群划分的研究 | 第26-31页 |
4.2 鳅超科中鳅科和平鳍鳅科的研究历史 | 第31-32页 |
4.3 鳅科及平鳍鳅科亚群的系统学研究 | 第32-36页 |
4.3.1 沙鳅亚科 | 第33-34页 |
4.3.2 花鳅亚科 | 第34-35页 |
4.3.3 条鳅亚科及平鳍鳅科 | 第35-36页 |
5 本研究的目的意义 | 第36-38页 |
第二章 鳅超科鱼类线粒体细胞色素b基因和控制区序列进化研究及其系统发育意义 | 第38-69页 |
1 材料与方法 | 第39-53页 |
1.1 实验所用标本 | 第39页 |
1.2 实验器材 | 第39-48页 |
1.3 研究方法 | 第48-52页 |
1.3.1 基因组 DNA的提取 | 第48-50页 |
1.3.2 PCR扩增 | 第50-51页 |
1.3.3 PCR产物回收 | 第51-52页 |
1.3.4 基因测序 | 第52页 |
1.4 数据分析方法 | 第52-53页 |
2 结果 | 第53-64页 |
2.1 序列变异情况 | 第53-57页 |
2.2 序列变异与目前鳅超科鱼类分类之间的关系 | 第57-58页 |
2.3 鳅超科鱼类系统发育关系的分析 | 第58-64页 |
3 讨论 | 第64-69页 |
3.1 控制区序列的进化机制 | 第64页 |
3.2 线粒体 DNA cyt b基因和控制区序列的系统发育意义 | 第64-65页 |
3.3 鳅超科的系统分类 | 第65-67页 |
3.4 鳅类各类群内部的系统发育关系 | 第67-69页 |
第三章 基于线粒体cyt b基因的沙鳅科鱼类系统发育关系分析 | 第69-81页 |
1 材料和方法 | 第69-73页 |
1.1 研究材料 | 第69-71页 |
1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增 | 第71-72页 |
1.3 PCR产物的纯化和测序 | 第72页 |
1.4 数据处理及分析 | 第72-73页 |
2 结果 | 第73-79页 |
2.1 沙鳅科cyt b基因序列的变异 | 第73页 |
2.2 系统发育分析 | 第73-79页 |
3 讨论 | 第79-81页 |
3.1 沙鳅鱼类的单系性 | 第79页 |
3.2 沙鳅科内属的有效性 | 第79-80页 |
3.3 沙鳅科内属间系统发育关系 | 第80页 |
3.4 下一步的研究 | 第80-81页 |
第四章 沙鳅科鱼类控制区序列结构分析及其系统发育意义 | 第81-101页 |
1 材料和方法 | 第82-84页 |
1.1 研究材料 | 第82-83页 |
1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增 | 第83页 |
1.3 PCR产物的纯化和测序 | 第83-84页 |
1.4 数据处理及分析 | 第84页 |
2 结果 | 第84-99页 |
2.1 沙鳅科鱼类线粒体DNA控制区序列及变异 | 第84-85页 |
2.2 终止序列区(ETAS) | 第85页 |
2.3 中央保守区(CD) | 第85-95页 |
2.4 保守序列区(CSB) | 第95页 |
2.5 系统发育关系分析 | 第95-99页 |
3 讨论 | 第99-101页 |
3.1 沙鳅科控制区特点及用于系统发育研究的可行性 | 第99-100页 |
3.2 沙鳅科的系统发育关系 | 第100-101页 |
第五章 花鳅科鱼类系统发育研究及花鳅属生物地理学初探 | 第101-112页 |
1 材料和方法 | 第101-104页 |
1.1 研究材料 | 第101-102页 |
1.2 基因组 DNA的提取、PCR扩增 | 第102页 |
1.3 PCR产物的纯化和测序 | 第102-104页 |
1.4 数据处理及分析 | 第104页 |
2 结果 | 第104-109页 |
2.1 花鳅科鱼类cyt b基因序列的变异 | 第104-105页 |
2.2 分子系统发育关系 | 第105-109页 |
3 讨论 | 第109-112页 |
3.1 花鳅属的单系性及类群划分 | 第109-110页 |
3.2 花鳅科的系统发育关系 | 第110页 |
3.3 花鳅属鱼类的生物地理学过程 | 第110-112页 |
第六章 鳅超科鱼类主要类群的演化过程及形态特征的分化 | 第112-121页 |
1 材料与方法 | 第113-114页 |
2 结果与讨论 | 第114-121页 |
2.1 鳅超科鱼类主要类群的分化时间 | 第114-116页 |
2.2 鳅超科鱼类形态特征的分化及生态适应 | 第116-121页 |
参考文献 | 第121-134页 |
致谢 | 第134-135页 |
附录 | 第135页 |