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两株对BmNPV侵染差异的家蚕细胞系的全基因组表达谱分析

摘要第1-8页
Abstract第8-12页
第一章 文献综述第12-24页
   ·家蚕细胞系的建立与特性第12页
   ·家蚕细胞系的应用第12-14页
   ·家蚕核型多角体病毒概述第14-17页
     ·家蚕核型多角体病毒分类和生活周期第14-15页
     ·家蚕核型多角体病毒的危害和防治第15-17页
   ·基因芯片概述第17-18页
     ·基因芯片基本概念和原理第17页
     ·基因芯片国内外研究进展第17-18页
     ·基因芯片的应用第18页
   ·家蚕全基因组基因表达谱研究进展第18-24页
第二章 引言第24-26页
   ·研究背景和意义第24页
   ·主要研究内容第24-25页
   ·技术路线第25-26页
第三章 两种细胞与卵巢组织的基因表达谱特征及其差异第26-50页
   ·实验材料第26-28页
     ·材料第26页
     ·主要试剂及耗材第26页
     ·主要溶液及配方第26-27页
     ·主要仪器设备第27-28页
     ·生物信息学分析工具和相关软件第28页
   ·实验方法第28-33页
     ·家蚕细胞的培养和传代第28-29页
     ·家蚕卵巢组织的收集第29页
     ·家蚕细胞总RNA的提取第29页
     ·家蚕细胞总RNA的纯化第29-30页
     ·家蚕细胞总RNA的检测第30页
     ·家蚕卵巢组织总RNA的提取第30-31页
     ·家蚕卵巢组织总RNA的纯化和检测第31页
     ·对样品RNA进行荧光标记第31页
     ·芯片杂交和清洗第31页
     ·芯片扫描第31-32页
     ·芯片图像的采集与数据分析第32-33页
     ·表达基因筛选第33页
     ·差异表达基因筛选第33页
     ·差异基因的GO和Pathway分析第33页
   ·结果与分析第33-48页
     ·RNA的质量检测第33-34页
     ·芯片杂交结果第34页
     ·芯片图像的处理与数据采集结果第34-35页
     ·差异基因的筛选结果第35-37页
     ·GO分析第37-46页
     ·Pathway分析第46-48页
   ·讨论第48-50页
     ·BmN细胞、BmN-SWU1细胞与卵巢组织之间的基因表达差异第48-49页
     ·BmN细胞、BmN-SWU1细胞与卵巢组织之间的Pathway差异第49-50页
第四章 两种细胞感染病毒前后的基因表达谱特征及其差异第50-64页
   ·实验材料第50页
     ·材料第50页
     ·主要试剂及耗材第50页
     ·主要溶液及配方第50页
     ·主要仪器设备第50页
     ·生物信息学分析工具和相关软件第50页
   ·实验方法第50-52页
     ·家蚕细胞的培养和传代第50页
     ·病毒的扩增第50-51页
     ·病毒母液的滴度测定第51页
     ·细胞的病毒感染第51页
     ·家蚕细胞总RNA的提取、纯化和检测第51页
     ·样品RNA的荧光标记第51页
     ·芯片杂交、清洗和扫描第51页
     ·芯片图像的采集与数据分析第51-52页
     ·表达基因筛选和差异表达基因筛选第52页
     ·差异基因的GO和Pathway分析第52页
   ·结果与分析第52-59页
     ·RNA的质量检测第52-53页
     ·芯片图像的处理与数据采集结果第53-55页
     ·差异基因的筛选结果第55-56页
     ·GO分析第56-58页
     ·Pathway分析第58-59页
   ·讨论第59-64页
     ·BmN细胞与BmN-SWU1细胞感染BmNPV前后的基因表达差异第59-61页
     ·BmN细胞与BmN-SWU1细胞感染BmNPV前后的Pathway差异第61-64页
第五章 部分差异基因的验证第64-76页
   ·实验材料第64-65页
     ·材料第64页
     ·主要试剂及耗材第64页
     ·主要溶液及配方第64页
     ·主要仪器设备第64页
     ·生物信息学分析工具和相关软件第64-65页
   ·实验方法第65-66页
     ·细胞的病毒感染第65页
     ·总RNA的提取、纯化和检测第65页
     ·RNA的体外反转第65页
     ·cDNA的检测第65-66页
     ·引物设计第66页
     ·实时荧光定量检测第66页
   ·结果与分析第66-71页
     ·RNA的质量检测结果第66-67页
     ·cDNA的检测结果第67-68页
     ·实时相对荧光定量PCR检测相关抗性基因第68-71页
   ·讨论第71-76页
     ·实时相对荧光定量PCR技术第71-72页
     ·差异基因的时间特异性第72页
     ·鉴证的差异基因的功能第72-76页
第六章 小结第76-78页
参考文献第78-84页
附录第84-86页
在校期间发表的论文第86-88页
致谢第88页

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