| 符号说明 | 第1-10页 |
| 中文摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 第1章 复杂性状遗传分析策略和方法研究进展 | 第16-59页 |
| ·摘要 | 第16页 |
| ·前言 | 第16页 |
| ·复杂性状的基本概念及研究背景 | 第16-18页 |
| ·复杂性状基因图谱构建 | 第18-30页 |
| ·单标记分析方法 | 第19-20页 |
| ·区间作图方法 | 第20-22页 |
| ·复合区间作图方法 | 第22-25页 |
| ·多区间作图方法 | 第25-26页 |
| ·贝叶斯作图方法 | 第26-27页 |
| ·基于连锁不平衡的作图方法 | 第27-28页 |
| ·eQTL 作图方法 | 第28-29页 |
| ·其他作图方法 | 第29-30页 |
| ·新遗传资源的开发与应用 | 第30-34页 |
| ·染色体片段代换系群体、高代回交群体和近等基因系群体 | 第31-32页 |
| ·高代互交系群体 | 第32-33页 |
| ·重组近交系群体及其衍生群体 | 第33页 |
| ·Yin-Yang 杂交和重组自交分离测验方法 | 第33-34页 |
| ·复杂性状基因的遗传鉴定 | 第34-36页 |
| ·细胞质遗传及核质互作研究进展 | 第36-42页 |
| ·细胞质遗传及其特点 | 第36-37页 |
| ·叶绿体基因组研究 | 第37-39页 |
| ·线粒体基因组研究 | 第39-40页 |
| ·核质互作研究进展 | 第40-42页 |
| ·复杂性状遗传基础研究的主要挑战和展望 | 第42-45页 |
| ·从表型考察到遗传分析的细节思考 | 第42页 |
| ·从QTL 到QTG 的高通量分析 | 第42-43页 |
| ·关于上位性及基因网络调控的研究 | 第43-44页 |
| ·从QTL 分析到分子育种 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-59页 |
| 第2章 基于正反交遗传设计的核质互作QTL 定位方法 | 第59-75页 |
| ·摘要 | 第59页 |
| ·前言 | 第59-61页 |
| ·原理与方法 | 第61-66页 |
| ·遗传交配设计 | 第61页 |
| ·核质互作的统计遗传模型 | 第61-63页 |
| ·参数的极大似然估计 | 第63-64页 |
| ·似然比检验 | 第64-66页 |
| ·模拟研究 | 第66-71页 |
| ·模拟设置 | 第66-67页 |
| ·考察指标 | 第67-68页 |
| ·模拟结果 | 第68-71页 |
| ·讨论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-75页 |
| 第3章 基于核质互作QTL 分析的强优势玉米杂交种苏玉16 号的遗传解析 | 第75-111页 |
| ·摘要 | 第75页 |
| ·前言 | 第75-76页 |
| ·材料与方法 | 第76-78页 |
| ·试验材料及试验设计 | 第76页 |
| ·农艺性状调查 | 第76-77页 |
| ·DNA 提取与全基因组标记分析 | 第77-78页 |
| ·数据分析 | 第78页 |
| ·连锁图谱构建 | 第78-82页 |
| ·亲本多态性分析 | 第78页 |
| ·多态性标记在F_2 群体上的分离情况 | 第78-80页 |
| ·连锁图谱构建 | 第80-82页 |
| ·亲本与群体表型数据分析 | 第82-88页 |
| ·亲本间主要农艺性状分析 | 第82-84页 |
| ·F_2 和F_(2:3) 群体的农艺性状表型分布 | 第84-86页 |
| ·F_2 和F_(2:3) 群体的农艺性状相关分析 | 第86-87页 |
| ·F_2 和F_(2:3) 群体的农艺性状正反交间差异分析 | 第87-88页 |
| ·玉米杂交种苏玉16 号重要农艺性状QTL 分析 | 第88-102页 |
| ·玉米抽穗期和散粉期性状QTL 分析 | 第88-91页 |
| ·玉米株高、穗位高和茎粗性状QTL 分析 | 第91-92页 |
| ·玉米雄穗一级分支数和雄穗长性状QTL 分析 | 第92-98页 |
| ·玉米穗部及产量性状QTL 分析 | 第98-102页 |
| ·核质互作QTL 定位总结 | 第102页 |
| ·讨论 | 第102-110页 |
| ·核质上位性研究的重要意义 | 第102-105页 |
| ·关于玉米遗传图谱构建 | 第105-106页 |
| ·关于标记偏分离 | 第106-107页 |
| ·关于核质QTL 定位 | 第107-110页 |
| 参考文献 | 第110-111页 |
| 第4章 核质互作QTL 定位模拟和分析程序 | 第111-132页 |
| ·程序简介 | 第111页 |
| ·通用函数定义 | 第111-115页 |
| ·基于染色体水平的模拟研究程序 | 第115-121页 |
| ·混合BC 群体的模拟研究程序 | 第115-116页 |
| ·混合F_2 群体的模拟研究程序 | 第116-119页 |
| ·混合DH 群体的模拟研究程序 | 第119-120页 |
| ·混合RIL 群体的模拟研究程序 | 第120-121页 |
| ·基于全基因组水平的混合F_2 群体模拟研究程序 | 第121-128页 |
| ·全基因组染色体及标记间距模拟 | 第121-122页 |
| ·QTL 信息数据模拟 | 第122页 |
| ·全基因组核质互作QTL 定位程序 | 第122-128页 |
| ·正反F_2 群体实际数据分析程序 | 第128-132页 |
| ·正反F_2 群体实际数据分析准备文件 | 第128-129页 |
| ·正反F_2 群体实际数据分析程序 | 第129-132页 |
| 参考文献 | 第132-133页 |
| 存在问题与下一步研究设想 | 第133-134页 |
| 附录1 玉米基因组DNA 提取方法 | 第134-135页 |
| 附录2 聚丙烯酰胺凝胶配制 | 第135-136页 |
| 附录3 聚丙烯酰胺凝胶电泳方案 | 第136-137页 |
| 附录4 本研究中使用的缓冲液等试剂的配制 | 第137-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 硕博连读期间发表论文及参加学术活动情况 | 第140-142页 |
