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野鸟源H6N2亚型和H11N9亚型AIV分离株的基因特征及遗传进化分析

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
1 绪论第11-20页
   ·课题背景第11页
   ·禽流感病毒的概况第11-13页
     ·禽流感病毒的特征第11-12页
     ·高致病力禽流感第12页
     ·低致病力禽流感病毒第12页
     ·LPAIV向HPAIV的转变第12-13页
   ·AIV致病性的分子基础第13-15页
     ·HA基因第13页
     ·NA基因第13-14页
     ·聚合酶复合体基因第14-15页
     ·NP、M、NS基因第15页
   ·野鸟在A型流感病毒进化与传播中的作用第15-18页
     ·野生鸟类是A型流感病毒的天然储库第15-16页
     ·野生鸟类中禽流感病毒的生态特点第16-17页
     ·野生鸟类中禽流感病毒的生态分布第17-18页
     ·野鸟中的H5N1亚型AIV第18页
   ·本课题研究的目的和意义第18-20页
2 材料和方法第20-26页
     ·实验材料第20-21页
     ·病毒第20页
     ·SPF鸡胚及鸡红细胞第20页
     ·实验试剂第20页
     ·实验仪器第20页
     ·特异性引物第20-21页
   ·实验方法第21-26页
     ·病毒的分离第21页
     ·红细胞凝集试验(HA)第21页
     ·病毒RNA的提取第21-22页
     ·cDNA的合成第22页
     ·全基因组PCR扩增第22-23页
     ·PCR产物的克隆第23-24页
     ·PCR方法鉴定重组质粒第24页
     ·序列测定第24-25页
     ·序列分析和遗传进化分析第25-26页
3 实验结果第26-62页
   ·RT-PCR检测结果第26-30页
   ·全基因组测序结果第30-36页
   ·核苷酸序列同源性比较第36-42页
   ·编码氨基酸序列分析比较第42-45页
     ·裂解位点分析第42页
     ·潜在糖基化位点分析第42页
     ·抗原表位预测第42-43页
     ·AIV分离株基因特征第43-45页
   ·遗传进化关系分析第45-61页
   ·H6和H11亚型禽流感病毒中HA和NA组合情况第61-62页
4 讨论第62-67页
   ·OZL183/06、MHLJ131/06和MSJ113/06病毒株的序列分析第62-63页
   ·抗原性分析第63页
   ·分离株同源性及遗传进化分析第63-65页
   ·H6和H11亚型禽流感病毒中HA和NA组合情况初探第65-67页
5 结论第67-68页
6 参考文献第68-75页
7 攻读学位期间发表的学术论文第75-76页
8 致谢第76-77页

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