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粘质沙雷氏菌发酵生产2,3-丁二醇及其代谢调控研究

摘要第1-7页
Abstract第7-17页
第1章 文献综述第17-42页
   ·2,3-丁二醇的性质及用途第17-18页
     ·2,3-丁二醇的性质第17页
     ·2,3-丁二醇的用途第17-18页
       ·重要的化工原料第17页
       ·潜在的替代能源第17-18页
       ·常用的食品添加剂第18页
       ·其它方面的应用第18页
   ·2,3-丁二醇的生产方法第18页
   ·2,3-丁二醇的生产菌株概述第18-25页
     ·2,3-丁二醇的生产菌株第18-19页
     ·微生物生产2,3-丁二醇的生理意义第19页
     ·微生物合成2,3-丁二醇的代谢途径第19-21页
     ·2,3-丁二醇的旋光异构体及其形成机制第21-25页
   ·微生物法制备2,3-丁二醇的过程优化第25-35页
     ·培养基成分研究第25-29页
       ·碳源第25-26页
       ·无机盐和酵母粉对2,3-丁二醇发酵的影响第26-28页
       ·有机酸对2,3-丁二醇的影响第28-29页
     ·2,3-丁二醇发酵过程控制参数第29-32页
       ·温度第29页
       ·pH值第29-30页
       ·溶氧第30-32页
     ·2,3-丁二醇的发酵工艺第32-35页
       ·分批发酵第32页
       ·连续发酵第32-33页
       ·固定化细胞培养第33页
       ·两相萃取发酵第33-34页
       ·分批补料发酵第34页
       ·两菌共培养发酵(co-culture)第34-35页
   ·代谢工程改造第35-37页
     ·2,3-丁二醇合成途径相关基因和调控机制第35-36页
     ·2,3-丁二醇生产菌株的代谢工程改造第36-37页
   ·粘质沙雷氏菌产2,3-丁二醇的研究进展第37-39页
     ·粘质沙雷氏菌产2,3-丁二醇的研究概况第37-38页
     ·粘质沙雷氏菌产2,3-丁二醇的调控机制第38-39页
   ·2,3-丁二醇的分离纯化进展第39页
   ·2,3-丁二醇的生产现状和市场情况第39-40页
   ·论文研究意义和研究内容第40-42页
     ·论文研究意义第40页
     ·研究内容第40-42页
第2章 粘质沙雷氏菌生产2,3-丁二醇培养基研究第42-70页
   ·引言第42页
   ·实验材料第42-44页
     ·菌株第42-43页
     ·实验仪器与实验试剂第43-44页
       ·主要仪器第43页
       ·常用试剂第43-44页
     ·培养基第44页
   ·实验方法第44-47页
     ·摇瓶培养方法第44-45页
     ·种子驯化第45页
     ·温度对菌体生长和发酵的影响第45页
     ·装液量对菌体生长和发酵的影响第45页
     ·pH对菌体生长和发酵的影响第45页
     ·接种量对菌体生长和发酵的影响第45页
     ·碳源对菌体生长和发酵的影响第45-46页
     ·氮源对菌体生长和发酵的影响第46页
     ·不同来源国产蛋白胨和国产酵母粉的筛选第46页
       ·不同来源国产蛋白胨单因素实验第46页
       ·不同来源国产酵母粉单因素实验第46页
     ·有机酸对菌体生长和发酵的影响第46页
       ·柠檬酸对菌体生长和发酵的影响第46页
       ·乙酸对2,3-丁二醇发酵的影响第46页
     ·无机盐对菌体生长和发酵的影响第46页
     ·起始蔗糖浓度对菌体生长和发酵的影响第46-47页
     ·Plackett-Burman Design设计第47页
     ·Response Surface Methodology分析实验第47页
     ·培养基优化后的验证实验第47页
     ·发酵过程维持不同底物浓度对2,3-丁二醇产量的影响第47页
   ·分析方法第47-52页
     ·粘质沙雷氏菌菌体浓度测定方法第47-48页
     ·蔗糖浓度测定原理及方法第48页
     ·产物测定方法第48-50页
       ·发酵液中产物的预处理第48-49页
       ·气相色谱测定乙偶姻和2,3-丁二醇的浓度第49-50页
     ·副产物的测定方法第50-52页
       ·发酵液中副产物的预处理第50页
       ·高效液相色谱测定有机酸等副产物的浓度第50-52页
   ·实验结果与讨论第52-69页
     ·种子驯化第52-53页
     ·温度对菌体生长和发酵的影响第53页
     ·装液量对菌体生长和发酵的影响第53-54页
     ·pH对菌体生长和发酵的影响第54-56页
       ·初始pH值对菌体生长和发酵的影响第54-55页
       ·过程pH值对发酵的影响第55-56页
     ·接种量对菌体生长和发酵的影响第56-57页
     ·碳源对菌体生长和发酵的影响第57-58页
     ·氮源对菌体生长和发酵的影响第58页
     ·不同来源国产蛋白胨和酵母粉的筛选第58-60页
       ·不同来源国产蛋白胨的单因素摇瓶实验第58-59页
       ·不同来源国产酵母粉的单因素摇瓶实验第59-60页
     ·有机酸对菌体生长和发酵的影响第60-63页
       ·柠檬酸对菌体生长和发酵的影响第60-61页
       ·乙酸对菌体生长和发酵的影响第61-63页
     ·无机盐对菌体生长和发酵的影响第63-64页
     ·起始蔗糖浓度对菌体生长和发酵的影响第64页
     ·Plackett-Burman Design设计第64-66页
     ·Response Surface Methodology分析实验第66-68页
     ·优化培养基后发酵过程曲线第68页
     ·发酵过程中维持不同的底物浓度对2,3-丁二醇产量的影响第68-69页
   ·本章小结第69-70页
第3章 发酵工艺优化和补料-分批发酵过程研究第70-81页
   ·引言第70页
   ·实验材料与分析方法第70-71页
     ·菌株第70页
     ·主要仪器和试剂第70页
       ·主要仪器第70页
       ·常用试剂第70页
     ·培养基第70-71页
     ·分析方法第71页
     ·产物得率计算方法第71页
   ·实验方法第71-72页
     ·分批发酵第71页
     ·分批补料发酵第71-72页
       ·脉冲补料发酵第71页
       ·恒速补料发酵第71页
       ·恒底物浓度-呼吸熵(RQ)调控策略第71-72页
       ·pH自控-恒底物浓度-RQ调控策略第72页
   ·实验结果与讨论第72-79页
     ·分批发酵第72-73页
     ·分批补料发酵第73-78页
       ·脉冲补料策略第73-74页
       ·恒速补料策略第74-75页
       ·恒底物浓度-RQ调控第75-77页
       ·pH自控-恒底物浓度-RQ调控策略第77-78页
     ·发酵罐逐级放大实验第78-79页
   ·本章小结第79-81页
第4章 粘质沙雷氏菌表面活性剂缺失工程菌的构建第81-92页
   ·引言第81页
   ·材料和方法第81-86页
     ·菌株、质粒和引物第81-82页
     ·实验所用仪器第82页
     ·试剂第82页
     ·培养基和抗生素第82页
     ·粘质沙雷氏菌H30基因组DNA的提取第82页
     ·swrw基因片断的扩增第82-83页
       ·swrw基因片断PCR反应体系第83页
       ·swrw基因片断扩增条件第83页
     ·质粒DNA的制备第83-84页
     ·swrw基因自杀载体构建第84-85页
       ·限制性内切酶酶切体系第84页
       ·连接反应体系第84页
       ·E.coli S17-1λpir感受态细胞制备第84-85页
       ·连接产物转化第85页
     ·swrw基因突变-双亲本杂交第85页
     ·swrw突变株的鉴定第85-86页
       ·PCR鉴定第85页
       ·swrw突变菌发酵上清液乳化性能测定第85-86页
       ·swrw突变菌发酵上清液泡沫性能测定第86页
     ·swrw突变菌与野生菌发酵比较第86页
     ·swrw突变菌3.7L罐的发酵第86页
   ·实验结果与讨论第86-91页
     ·swrw基因片断的扩增第86页
     ·自杀载体pUTKm-swrw的构建第86-88页
     ·swrw突变体的PCR鉴定第88页
     ·swrw突变菌发酵液的乳化性能测定第88页
     ·swrw突变菌发酵液的泡沫性能测定第88-89页
     ·野生菌和swrw突变株摇瓶发酵比较第89-90页
     ·突变株3.7L发酵罐实验第90-91页
   ·本章小结第91-92页
第5章 粘质沙雷氏菌合成2,3-丁二醇相关基因的鉴定第92-106页
   ·引言第92页
   ·材料与方法第92-97页
     ·菌株、质粒和引物第92-93页
     ·实验所用仪器第93页
     ·实验所用试剂第93页
     ·培养基和抗生素第93页
     ·粘质沙雷氏菌H30基因组DNA提取第93页
     ·2,3-丁二醇代谢途径相关基因序列的获取第93页
       ·α-乙酰乳酸合成酶基因和α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列的获取第93页
       ·2,3-丁二醇脱氢酶基因的获取第93页
     ·乙偶姻操纵子的克隆与分析第93-94页
       ·PCR反应体系第94页
       ·PCR扩增条件第94页
     ·2,3-丁二醇脱氢酶基因的克隆与分析第94-95页
       ·PCR反应体系第94-95页
       ·PCR扩增条件第95页
     ·2,3-丁二醇代谢途径相关基因的表达第95-97页
       ·限制性酶切反应,纯化及连接反应第95-96页
       ·质粒制备第96页
       ·大肠杆菌感受态细胞制备第96页
       ·质粒以及连接产物转化第96页
       ·诱导表达第96-97页
       ·SDS-PAGE电泳第97页
     ·budA、budB和budC基因的生物信息学分析第97页
   ·实验结果与讨论第97-104页
     ·2,3-丁二醇代谢相关基因序列的获取第97-98页
     ·乙偶姻操纵子的克隆第98页
     ·乙偶姻操纵子测序结果分析第98-100页
     ·2,3-丁二醇脱氢酶基因的克隆第100页
     ·2,3-丁二醇脱氢酶基因序列的分析第100-101页
     ·2,3-丁二醇代谢途径相关基因的表达第101-103页
       ·budA、budB和budC基因表达载体的构建第101-102页
       ·重组载体的双酶切验证和测序第102页
       ·budA、budB和budC基因的诱导表达第102-103页
     ·budA、budB和budC基因的生物信息学分析第103-104页
   ·本章小结第104-106页
第6章 2,3-丁二醇合成调控机制研究第106-125页
   ·引言第106页
   ·实验材料与方法第106-112页
     ·菌株、质粒和引物第106-107页
     ·实验所用仪器第107页
     ·实验所用试剂第107页
     ·培养基和抗生素第107页
     ·粘质沙雷氏菌H30基因组DNA提取第107页
     ·调控因子budR突变菌的构建第107-108页
       ·budR基因片断的扩增体系第107-108页
       ·budR基因片断的扩增条件第108页
       ·限制性内切酶酶切体系第108页
       ·连接反应体系第108页
       ·E.coli S17-1λpir感受态细胞制备第108页
       ·连接产物转化第108页
       ·budR基因突变-双亲本杂交第108页
     ·budR突变菌的验证第108-109页
     ·budR缺失对粘质沙雷氏菌生长、产酸和乙偶姻合成的影响第109页
       ·budR缺失对粘质沙雷氏菌生长的影响第109页
       ·budR缺失对粘质沙雷氏菌产酸的影响第109页
       ·budR缺失对粘质沙雷氏菌产乙偶姻的影响第109页
     ·粘质沙雷氏菌H30中2,3-丁二醇脱氢酶独立存在的验证第109页
     ·乙偶姻操纵子的启动子分析第109-111页
       ·budR和启动子区域的扩增第109页
       ·启动子:lacZ融合报告载体的构建第109-111页
     ·budR对启动子区域转录水平的调控第111页
     ·外部环境对乙偶姻操纵子转录水平的影响第111-112页
       ·粘质沙雷氏菌电转感受态细胞制备第111页
       ·电转化方法第111页
       ·pH对乙偶姻操纵子转录水平的影响第111页
       ·溶氧对乙偶姻操纵子转录水平的影响第111页
       ·有机酸对乙偶姻操纵子转录水平的影响第111-112页
     ·β-半乳糖苷酶活性测定第112页
   ·实验结果与讨论第112-123页
     ·budR突变株的构建第112-114页
       ·budR基因片断的扩增第112-113页
       ·自杀性载体pUTKm-budR的构建第113页
       ·budR基因突变和突变菌的验证第113-114页
     ·budR对粘质沙雷氏菌生长、产酸和乙偶姻合成的影响第114-117页
       ·budR对粘质沙雷氏菌生长的影响第114-116页
       ·budR对粘质沙雷氏菌产酸的影响第116页
       ·budR对粘质沙雷氏菌合成乙偶姻的影响第116-117页
     ·粘质沙雷氏菌H30中2,3-丁二醇脱氢酶独立存在的验证第117-119页
     ·budR对操纵子中启动子的影响和环境因素对启动子的影响分析第119-123页
       ·budR和budA启动子的扩增第119页
       ·pUC-pbud载体构建第119-120页
       ·lacZ报告载体构建第120页
       ·budR对启动子区域转录水平的调控第120-121页
       ·外部环境对乙偶姻操纵子转录水平的影响第121-123页
   ·本章小结第123-125页
第7章 粘质沙雷氏菌中2,3-丁二醇脱氢酶过表达体系构建第125-135页
   ·引言第125页
   ·材料与方法第125-129页
     ·菌株、质粒和引物第125页
     ·实验所用仪器第125-126页
     ·实验所用试剂第126页
     ·培养基和抗生素第126页
     ·肺炎克雷伯氏菌基因组DNA提取第126页
     ·BDH表达载体的构建第126-127页
       ·PCR扩增BDH基因第126-127页
       ·BDH与pUC-pbud连接第127页
       ·连接产物转化第127页
       ·重组质粒的验证和测序第127页
     ·重组质粒pPbud-BDH电转粘质沙雷氏菌H30第127页
     ·BDH在粘质沙雷氏菌H30中的表达情况第127页
     ·BDH过表达对粘质沙雷氏菌H30发酵产乙偶姻和2,3-丁二醇的影响第127-128页
     ·2,3-丁二醇脱氢酶活性测定方法第128页
     ·细胞破碎条件第128页
     ·Bradford法测定蛋白含量第128-129页
       ·溶液的配制第128页
       ·检测方法第128-129页
       ·牛血清蛋白标准曲线第129页
     ·BDH重组菌3.7L发酵罐实验第129页
   ·实验结果第129-134页
     ·BDH基因的扩增第129-130页
     ·pPbud-BDH载体的构建第130页
     ·BDH在粘质沙雷氏菌H30中的表达情况分析第130-131页
     ·BDH过表达对粘质沙雷氏菌产乙偶姻和2,3-丁二醇的影响第131-133页
     ·重组菌3.7L发酵罐实验第133-134页
   ·本章小结第134-135页
第8章 总结与展望第135-138页
   ·论文总结第135-136页
   ·展望第136-138页
参考文献第138-150页
致谢第150-151页
博士期间发表的论文与专利第151-152页
附录 英文缩写第152页

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