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猪盖他病毒检测方法的建立与应用及病毒的分离鉴定和序列分析

致谢第4-10页
英文缩写词表第10-11页
摘要第11-14页
文献综述第14-27页
    1 盖他病毒及其危害第14-23页
        1.1 GETV的发现和分布第14-17页
            1.1.1 GETV的发现历史第14-15页
            1.1.2 GETV的分布第15-17页
        1.2 GETV的基本特征第17-21页
            1.2.1 病毒分类地位第17-18页
            1.2.2 病毒基本特征第18-21页
            1.2.3 遗传与变异第21页
        1.3 GETV的流行病学和致病性第21-23页
            1.3.1 可能的传播媒介和传播途径第21-22页
            1.3.2 感染谱第22页
            1.3.3 已报道的临床病例和致病性研究第22-23页
            1.3.4 致病性研究领域仍待解决的问题第23页
    2 盖他病毒检测方法研究进展第23-27页
        2.1 病毒分离与鉴定第23-24页
        2.2 RT-PCR方法第24页
            2.2.1 单一RT-PCR第24页
            2.2.2 多重RT-PCR第24页
        2.3 血清学方法第24-25页
            2.3.1 病毒中和试验第24-25页
            2.3.2 酶联免疫吸附试验第25页
            2.3.3 血凝抑制试验第25页
            2.3.4 免疫荧光技术第25页
        2.4 其他检测方法第25-26页
        2.5 存在问题第26-27页
试验一 猪盖他病毒RT-PCR方法的建立及其应用第27-36页
    1 材料与方法第27-30页
        1.1 毒株第27页
        1.2 试剂第27页
        1.3 核酸提取第27-29页
            1.3.1 临床病料中总RNA的提取第27-28页
            1.3.2 DNA病毒核酸的提取第28-29页
        1.4 引物设计第29页
        1.5 RT-PCR检测第29页
            1.5.1 反转录第29页
            1.5.2 PCR反应条件的优化第29页
            1.5.3 cDNA模板用量的优化第29页
            1.5.4 PCR退火温度的优化第29页
        1.6 PCR产物纯化第29-30页
        1.7 特异性试验第30页
        1.8 敏感性试验第30页
        1.9 RT-PCR在临床上运用第30页
    2 结果第30-35页
        2.1 GETVRT-PCR扩增出特异序列第30-31页
        2.2 GETVRT-PCR具有良好特异性第31页
        2.3 RT-PCR引物退火温度适性广泛第31-32页
        2.4 GETVRT-PCR具有高度敏感性第32-33页
        2.5 RT-PCR从临床病例样品中检出GETV第33-34页
        2.6 测序结果表明RT-PCR扩增产物为GETV基因序列第34-35页
    3 讨论第35-36页
试验二 GETV、PEDV、TGEV、PoRV和PDCoV五重RT-PCR方法的建立及应用第36-44页
    1 材料与方法第36-38页
        1.1 毒株第36页
        1.2 试剂第36页
        1.3 核酸提取第36页
        1.4 引物设计第36-37页
        1.5 RT-PCR第37页
        1.6 特异性试验第37页
        1.7 敏感性试验第37-38页
        1.8 重复性试验第38页
        1.9 多重RT-PCR在临床上运用第38页
    2 结果第38-42页
        2.1 多重RT-PCR特异性试验第38-40页
        2.2 多重RT-PCR敏感性试验第40-41页
        2.3 多重RT-PCR重复性试验第41页
        2.4 多重RT-PCR在临床上检测结果第41-42页
    3 讨论第42-44页
试验三 猪盖他病毒Cap蛋白的原核表达纯化及多克隆抗体制备第44-51页
    1 材料与方法第44-46页
        1.1 细菌、毒株和实验动物第44页
        1.2 试剂第44-45页
        1.3 引物设计第45页
        1.4 RT-PCR扩增第45页
        1.5 构建原核表达质粒第45页
        1.6 重组质粒的诱导表达第45页
        1.7 纯化融合蛋白第45-46页
        1.8 制备多克隆抗体第46页
        1.9 多克隆抗体鉴定第46页
    2 结果第46-49页
        2.1 RT-PCR扩增产物第46-47页
        2.2 重组质粒的构建和鉴定第47页
        2.3 重组质粒pET28a-Cap的表达第47页
        2.4 融合蛋白纯化第47-49页
        2.5 抗血清的特异性检测第49页
    3 讨论第49-51页
试验四 中国4省猪GETVNSP3及Cap基因检测及序列分析第51-61页
    1 材料与方法第51-54页
        1.1 样品来源第51-52页
        1.2 毒株、菌种和细胞第52-53页
        1.3 主要试剂第53页
        1.4 引物设计与合成第53页
        1.5 GETV核酸检测第53页
        1.6 基因克隆、测序与序列分析第53-54页
    2 结果与分析第54-58页
        2.1 801份样品中37份呈GETVNSP3和Cap基因RT-PCR阳性第54-56页
        2.2 NSP3和Cap基因序列特点第56-58页
    3 讨论第58-61页
试验五 同一猪场疫苗源和猪源GETV分离株的比较分析第61-73页
    1 材料与方法第61-65页
        1.1 市售疫苗和猪源样品第61页
        1.2 毒株第61页
        1.3 试剂第61页
        1.4 引物设计第61-63页
        1.5 RNA提取第63-64页
            1.5.1 市售RNA病毒疫苗和病料RNA核酸的提取第63-64页
            1.5.2 细胞培养物RNA提取第64页
        1.6 病毒分离和鉴定第64页
        1.7 全基因组的克隆及测序第64页
        1.8 全基因组序列分析第64-65页
    2 结果第65-69页
        2.1 RT-PCR从临床病例样品和部分活疫苗中检出GETV第65-66页
        2.2 其他实验室GETVRT-PCR扩增出特异序列第66页
        2.3 猪病料中检测出一份阳性GETV第66-67页
        2.4 成功分离到2株GETV第67页
        2.5 全基因序列特征第67-69页
            2.5.1 成功拼接出全基因序列第67页
            2.5.2 全基因核苷酸序列相似性第67-68页
            2.5.3 全基因推导的氨基酸序列相似性及特征第68-69页
            2.5.4 全基因序列的遗传进化特征第69页
    3 讨论第69-73页
试验六 豫皖两省5株猪源GETV的分离鉴定及全序列分析第73-83页
    1 材料与方法第73-74页
        1.1 阳性样品来源第73页
        1.2 毒株、菌种和细胞第73页
        1.3 主要试剂第73页
        1.4 引物设计与合成第73页
        1.5 病毒分离和鉴定第73-74页
        1.6 基因克隆、测序与序列分析第74页
    2 结果与分析第74-80页
        2.1 从阳性样品中成功分离到5株GETV第74-75页
        2.2 5株GETV细胞培养物RT-PCR鉴定第75页
        2.3 全基因序列特征第75-80页
            2.3.1 成功拼接出全基因序列第75-76页
            2.3.2 全基因核苷酸序列相似性第76页
            2.3.3 全基因推导的氨基酸序列相似性及特征第76-77页
            2.3.4 全基因序列的遗传进化特征第77-80页
    3 讨论第80-83页
全文总结第83-84页
参考文献第84-90页
ABSTRACT第90-94页
附作者读研期间研究成果第95页

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