| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 引言 | 第15-23页 |
| 1.1 中国对虾和凡纳滨对虾简介 | 第15-16页 |
| 1.2 水产动物数量性状遗传参数研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.1 数量性状遗传力 | 第16页 |
| 1.2.2 数量性状研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3 水产动物耐低温相关基因和标记研究进展 | 第18-22页 |
| 1.3.1 高通量测序技术 | 第19-20页 |
| 1.3.2 水产动物耐低温相关标记 | 第20-21页 |
| 1.3.3 水产动物耐低温相关基因 | 第21-22页 |
| 1.4 本研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 40日龄中国对虾幼虾生长和耐低温性状的遗传参数评估 | 第23-32页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第23-26页 |
| 2.1.1 亲本及家系构建 | 第23-24页 |
| 2.1.2 低温胁迫处理 | 第24页 |
| 2.1.3 数据处理 | 第24-26页 |
| 2.2 结果 | 第26-30页 |
| 2.2.1 描述性统计 | 第26-27页 |
| 2.2.2 生长和耐低温性状遗传力估计 | 第27-28页 |
| 2.2.3 生长和耐低温性状相关性 | 第28-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-32页 |
| 2.3.1 遗传力估计 | 第30-31页 |
| 2.3.2 生长和耐低温性状相关性分析 | 第31-32页 |
| 第三章 基于转录组数据筛选40日龄中国对虾低温胁迫下的差异表达基因 | 第32-44页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.1.2 低温胁迫实验 | 第32页 |
| 3.1.3 RNA提取及转录组测序 | 第32-33页 |
| 3.1.4 数据分析 | 第33页 |
| 3.1.5 real time RT-PCR验证中国对虾转录组数据 | 第33-34页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第34-41页 |
| 3.2.1 测序原始数据组装 | 第34-35页 |
| 3.2.2 转录组数据注释 | 第35-36页 |
| 3.2.3 差异表达基因筛选 | 第36-37页 |
| 3.2.4 差异基因GO富集分析 | 第37-38页 |
| 3.2.5 差异基因KEGG富集分析 | 第38-39页 |
| 3.2.6 耐低温性状相关基因 | 第39-40页 |
| 3.2.7 real time RT-PCR验证转录组数据 | 第40-41页 |
| 3.3 讨论 | 第41-44页 |
| 3.3.1 中国对虾耐低温转录组分析 | 第41-42页 |
| 3.3.2 中国对虾耐低温性状相关基因 | 第42-44页 |
| 第四章 基于转录组分析筛选凡纳滨对虾低温胁迫下的差异表达基因 | 第44-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第44-46页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.1.2 低温胁迫实验 | 第44页 |
| 4.1.3 RNA提取及转录组Illumina Hiseq 2500 测序 | 第44页 |
| 4.1.4 转录组数据分析 | 第44-45页 |
| 4.1.5 real time RT-PCR验证凡纳滨对虾转录组数据 | 第45-46页 |
| 4.2 结果 | 第46-53页 |
| 4.2.1 转录组拼接 | 第46页 |
| 4.2.2 转录组序列注释 | 第46-47页 |
| 4.2.3 差异基因表达谱 | 第47-50页 |
| 4.2.4 低温胁迫下凡纳滨对虾差异表达基因GO富集分析 | 第50-51页 |
| 4.2.5 低温胁迫下凡纳滨对虾差异表达基因KEGG富集分析 | 第51-52页 |
| 4.2.6 转录组数据的real time RT-PCR验证 | 第52-53页 |
| 4.3 讨论 | 第53-55页 |
| 4.3.1 凡纳滨对虾低温转录组分析 | 第53-54页 |
| 4.3.2 凡纳滨对虾低温候选基因 | 第54-55页 |
| 第五章 结论 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-67页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
