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初情期大鼠下丘脑DNMTs和MBPs的表达及基因组DNA甲基化谱

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
论文中出现的英文缩写集第12-13页
文献综述 初情期表观遗传调控的研究进展第13-19页
    1 多基因遗传是初情期的基础第13-15页
        1.1 Kiss-1/GPR54系统第13-14页
        1.2 Leptin系统第14页
        1.3 Lin28B/let-7系统第14-15页
    2 表观遗传学对初情期的影响第15-18页
        2.1 DNA甲基化对初情期的影响第15-17页
            2.1.1 DNA甲基化的概念第15-16页
            2.1.2 DNA甲基化转移酶第16页
            2.1.3 DNA甲基化结合蛋白第16页
            2.1.4 DNA甲基化在初情期方面的研究进展第16-17页
        2.2 组蛋白修饰对初情期的影响第17-18页
            2.2.1 组蛋白修饰的概念第17页
            2.2.2 组蛋白修饰在初情期方面的研究进展第17-18页
        2.3 非编码RNA第18页
    3 本研究目的与意义第18-19页
引言第19-20页
1 材料与方法第20-32页
    1.1 主要试剂和仪器第20-21页
        1.1.1 主要试剂第20页
        1.1.2 主要仪器第20页
        1.1.3 试验所需溶液的配置第20-21页
    1.2 试验动物及取样年龄第21页
    1.3 阴门开启的观察第21页
    1.4 阴道脱落细胞学检查第21页
    1.5 组织样品的采集与处理第21页
    1.6 DNMTs、MBPsmRNAs表达的检测第21-24页
        1.6.1 下丘脑总RNA提取第21-22页
        1.6.2 RNA质量检测第22页
        1.6.3 反转录合成cDNA第22-23页
        1.6.4 cDNA质量的鉴定第23页
        1.6.5 PCR引物设计第23-24页
        1.6.6 实时荧光定量PCR第24页
    1.7 下丘脑DNA提取与质检第24-25页
        1.7.1 总DNA提取第24-25页
        1.7.2 总DNA质检第25页
    1.8 总体甲基化水平的检测第25-27页
        1.8.1 检测步骤第25-26页
        1.8.2 计算第26-27页
    1.9 卵巢的组织学观察第27页
    1.10 大鼠下丘脑全基因组DNA甲基化的测序第27-31页
        1.10.1 总DNA的提取及质量检测第27-28页
        1.10.2 文库构建和测序第28页
        1.10.3 生物信息学分析第28-31页
    1.11 统计分析第31-32页
2 结果第32-48页
    2.1 初情期启动第32页
        2.1.1 阴门开启的观察第32页
    2.2 卵巢的组织学观察第32-33页
    2.3 阴道脱落细胞学检查第33-34页
    2.4 下丘脑DNMTs、MBPsmRNAs表达水平在初情期前和初情期的变化第34-36页
        2.4.1 DNMTsmRNA的表达水平第34-35页
        2.4.2 MBPsmRNA的表达水平第35-36页
    2.5 下丘脑DAN总体甲基化水平第36-37页
    2.6 DNA质检结果第37-38页
    2.7 数据分析第38-48页
        2.7.1 测序reads与参考基因组的比对第38页
        2.7.2 启动子和CpG岛覆盖度分析第38-39页
        2.7.3 启动子和CpG岛的甲基化分析第39-42页
        2.7.4 区域甲基化图谱第42-43页
        2.7.5 差异性甲基化区域(DMR)分析第43页
        2.7.6 甲基化差异表达基因第43-44页
        2.7.7 GO基因功能分类显著性富集分析第44-46页
        2.7.8 KEGGPathway显著性富集分析第46-48页
3 讨论第48-52页
    3.1 DNMTsmRNA、MBPsmRNA表达及DNA总体甲基化水平第48-49页
        3.1.1 DNMTsmRNA第48-49页
        3.1.2 MBPsmRNA第49页
    3.2 初情期前和初情期DNA甲基化状态的分析第49-52页
4 结论第52-53页
参考文献第53-62页
致谢第62-63页
附录 A第63-65页
附录 B第65-70页
作者简介第70页

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