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简单快速制备稳定的CRISPR/Cas9-sgRNA复合物及其应用

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
主要符号表第14-15页
第1章 文献综述第15-26页
    1.1 CRISPR/Cas系统的发现史与其防御机制第15-20页
        1.1.1 CRISPR/Cas系统的发现历史第15-16页
        1.1.2 CRISPR/Cas系统的防御机制第16-18页
        1.1.3 CRISPR/Cas系统的分类第18-19页
        1.1.4 CRISPR/Cas9基因组编辑技术第19-20页
    1.2 Cas9核糖核蛋白复合复合物的应用第20-21页
    1.3 大规模制备Cas9 RNP的目的与意义第21-22页
    1.4 目前已有的DNA装配方法第22-25页
    1.5 建立基于Cas9-sgRNA复合物的克隆装配方法的目的与意义第25-26页
第2章 材料与方法第26-43页
    2.1 材料第26-35页
        2.1.1 本实验所用菌株第26页
        2.1.2 本实验所用质粒第26-27页
        2.1.3 本实验所用试剂第27页
        2.1.4 本实验所用培养基配方第27-28页
        2.1.5 本实验所用溶液配方第28-30页
        2.1.6 本实验所用引物及模版第30-35页
        2.1.7 本实验所用仪器与设备第35页
    2.2 方法第35-43页
        2.2.1 PCR反应第35-36页
        2.2.2 琼脂糖凝胶电泳检测DNA第36-37页
        2.2.3 omega试剂盒回收目的DNA第37页
        2.2.4 碱裂解法质粒DNA的提取第37-38页
        2.2.5 omega试剂盒提取质粒DNA第38页
        2.2.6 SDS-PAGE蛋白电泳第38-40页
        2.2.7 T5核酸外切酶介导的克隆装配第40页
        2.2.8 Cas9蛋白的表达纯化第40-41页
        2.2.9 Bradford法测定蛋白浓度第41页
        2.2.10 体外转录合成sgRNA第41-43页
第3章 结果与分析第43-65页
    3.1 SpCas9蛋白的表达和纯化、浓度的测定及其活性的检测第43-46页
        3.1.1 SpCas9蛋白在大肠杆菌的异源表达第43页
        3.1.2 SpCas9蛋白的纯化第43-44页
        3.1.3 SpCas9蛋白浓度的测定第44页
        3.1.4 SpCas9活性的检测第44-46页
    3.2 双质粒分别表达SpCas9和sgRNA第46-49页
        3.2.1 构建pUC57K-sgccr5质粒的构建第46-48页
        3.2.2 Cas9表达质粒与sgRNA表达质粒共转化大肠杆菌,表达并纯化第48-49页
    3.3 单质粒共表达SpCas9和sgRNA第49-50页
        3.3.1 共表达SpCas9和sgRNA质粒的构建第49页
        3.3.2 Ptac-cas9-T7sgRNA转化大肠杆菌表达并纯化复合物第49-50页
    3.4 SpCas9 RNP性质的探究第50-52页
        3.4.1 Cas9 RNP酶活的定义第50-51页
        3.4.2 SpCas9 RNP的稳定性第51-52页
        3.4.3 SpCas9 RNP酶切位点的测序第52页
    3.5 SpCas9 RNP用于常规的分子克隆实验第52-55页
        3.5.1 靶向pcDNA3.1和pET28a多克隆位点复合物表达质粒的构建第53-54页
        3.5.2 RNP对pcDNA3.1和pET28a多克隆位点的酶切,及其末端测序第54-55页
    3.6 建立基于SpCas9 RNP的装配方法第55-65页
        3.6.1 单个RNP介导的3片段克隆装配第55-58页
        3.6.2 4个SpCas9 RNPs介导的多片段循环装配第58-65页
第4章 讨论与展望第65-67页
参考文献第67-72页
致谢第72页

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