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基于转录组的枯草杆菌响应细胞外信号机制研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第13-33页
    1.1 枯草杆菌信号传导机制简介第15-20页
        1.1.1 枯草杆菌的细胞外信号传导机制第16-19页
        1.1.2 枯草杆菌细胞内信号传导机制第19-20页
    1.2 枯草杆菌的应急反应第20-23页
        1.2.1 枯草杆菌的特定应急反应第20-22页
        1.2.2 枯草杆菌的通用应急反应第22-23页
    1.3 枯草杆菌的内平衡第23-29页
        1.3.1 枯草杆菌的碳氮平衡第24-26页
        1.3.2 枯草杆菌的氧化还原平衡第26-27页
        1.3.3 枯草杆菌的金属离子平衡第27-29页
    1.4 转录组简介第29-30页
    1.5 本论文的研究目的、研究内容及意义第30-33页
        1.5.1 溶氧控制在发酵中的重要性第30-31页
        1.5.2 抗菌肽与微生物耐药性第31-32页
        1.5.3 本研究的主要内容及意义第32-33页
第2章 枯草杆菌腺苷发酵过程中溶氧与代谢的关系研究第33-57页
    2.1 引言第33页
    2.2 实验原理第33-34页
    2.3 实验材料第34-36页
        2.3.1 实验菌种第34页
        2.3.2 实验材料第34-35页
        2.3.3 所用仪器第35-36页
        2.3.4 培养基配方第36页
    2.4 实验方法第36-38页
        2.4.1 培养方法第36页
        2.4.2 菌浓测定第36页
        2.4.3 葡萄糖含量测定第36页
        2.4.4 高效液相色谱法测量有机酸、核苷酸和氨基酸第36-37页
        2.4.5 枯草杆菌总RNA抽提第37页
        2.4.6 芯片实验第37-38页
    2.5 结果与讨论第38-56页
        2.5.1 溶氧条件与腺苷产量的关系第38页
        2.5.2 12h和18h的差异基因第38-39页
        2.5.3 差异基因的功能富集第39-40页
        2.5.4 T-Profiler分析第40-45页
        2.5.5 碳代谢第45-47页
        2.5.6 氨基酸代谢第47-50页
        2.5.7 嘌呤核苷酸代谢第50-52页
        2.5.8 辅酶合成第52-53页
        2.5.9 呼吸第53-54页
        2.5.10 芽孢生产第54页
        2.5.11 溶氧控制枯草杆菌代谢流的内在机制第54-55页
        2.5.12 腺苷发酵的优化第55-56页
    2.6 本章小结第56-57页
第3章 脂环肽抗生素Fusaricidins对枯草杆菌的作用机制研究第57-79页
    3.1 引言第57-58页
    3.2 实验原理第58页
    3.3 实验材料第58-60页
        3.3.1 实验菌株第58-59页
        3.3.2 实验试剂第59页
        3.3.3 所用仪器第59-60页
    3.4 实验方法第60-61页
        3.4.1 培养方法第60页
        3.4.2 菌浓测定第60页
        3.4.3 细胞膜破损度测定方法第60页
        3.4.4 透射电镜观察第60-61页
        3.4.5 枯草杆菌总RNA抽提第61页
        3.4.6 芯片实验第61页
    3.5 结果与讨论第61-77页
        3.5.1 Fus对枯草杆菌的作用特点第61-63页
        3.5.2 枯草杆菌对Fus的前期转录组响应第63-64页
        3.5.3 枯草杆菌对Fus的后期转录组响应第64-65页
        3.5.4 T-Profiler分析第65-69页
        3.5.5 碳代谢第69-71页
        3.5.6 铁代谢第71-72页
        3.5.7 细胞膜相关基因和解毒蛋白分析第72-74页
        3.5.8 铁对枯草杆菌耐药性的影响第74-76页
        3.5.9 与其他具有抗药性的枯草杆菌的比较第76-77页
    3.6 本章小结第77-79页
第4章 高浓度Fe~(3+)环境中枯草杆菌产生耐药性的原因第79-104页
    4.1 引言第79-80页
    4.2 实验原理第80页
    4.3 实验材料第80-83页
        4.3.1 实验菌株第80-81页
        4.3.2 实验试剂第81-82页
        4.3.3 所用仪器第82-83页
    4.4 实验方法第83-85页
        4.4.1 培养方法第83页
        4.4.2 菌浓测定第83页
        4.4.3 存活率检测实验第83页
        4.4.4 枯草杆菌总RNA抽提第83页
        4.4.5 片实验第83-84页
        4.4.6 细胞膜流动性检测实验第84页
        4.4.7 脂肪酸分析实验及荧光定量PCR实验第84-85页
        4.4.8 PMF分析实验第85页
    4.5 结果与讨论第85-102页
        4.5.1 高浓度铁离子加强枯草杆菌对脂环肽的抗药性第85-87页
        4.5.2 片分析第87-88页
        4.5.3 T-Profiler分析第88-92页
        4.5.4 细胞膜相关基因第92-96页
        4.5.5 代谢途径第96-98页
        4.5.6 Fe~(3+)能维持PMF抑制细菌裂解第98-100页
        4.5.7 可氧化碳源对Pol引起的细菌裂解的抑制第100-102页
        4.5.8 Fe~(3+)维持PMF的机制研究第102页
    4.6 本章小结第102-104页
第5章 总结与展望第104-106页
    5.1 总结与创新第104页
    5.2 展望第104-106页
参考文献第106-120页
附录1第120-173页
附录2第173-174页
致谢第174-175页

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