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NGS技术用于引起奶牛乳房炎的液化沙雷菌的耐药基因的筛选

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
前言第11-18页
    1.1 沙雷菌耐药机制研究进展第11-13页
    1.2 细菌耐药性的研究进展第13-14页
    1.3 二代测序在细菌耐药性分析中的研究进展第14-17页
    1.4 研究的目的和意义第17-18页
材料与方法第18-27页
    2.1 材料第18-19页
        2.1.1 样本第18页
        2.1.2 主要仪器第18页
        2.1.3 试剂第18-19页
    2.2 方法第19-27页
        2.2.1 细菌分离鉴定与药敏试验第19-20页
        2.2.2 沙雷菌全基因组文库构建第20-25页
        2.2.3 ISP模板制备与富集第25-26页
        2.2.4 测序第26-27页
结果第27-39页
    3.1 细菌的分离鉴定与药敏试验第27-29页
        3.1.1 细菌分离与镜检结果第27页
        3.1.2 生化鉴定第27-28页
        3.1.3 药敏试验第28-29页
    3.2 文库构建第29-31页
        3.2.1 检测核酸浓度和纯度结果第29-30页
        3.2.2 文库制备结果第30-31页
    3.3 IonTorrent S5平台测序第31-32页
    3.4 序列拼接结果第32-34页
    3.5 耐药基因筛选结果第34-39页
讨论第39-42页
    4.1 药敏试验结果的讨论第39页
    4.2 核酸浓度及纯度结果的讨论第39页
    4.3 文库制备结果的讨论第39-40页
    4.4 IonTorrent S5平台序列测定及数据分析结果的讨论第40-42页
结论第42-43页
参考文献第43-48页
致谢第48-49页
作者简介第49-50页
附录第50页

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