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氨基酸脱氢酶AADH的结构与机理研究

摘要第2-3页
abstract第3页
第一章 前言第7-16页
    1.1 手性胺类化合物的化学合成与生物合成方法第7-10页
    1.2 氨基酸脱氢酶(AADH)的研究进展第10-14页
    1.3 课题的研究意义与方案设计第14-16页
第二章 AADH-WT的表达、纯化、结晶与结构解析第16-33页
    2.1 AADH-WT的表达第16-17页
    2.2 AADH-WT的纯化第17-19页
        2.2.1 细胞破碎第17页
        2.2.2 Ni-NTA亲和层析纯化第17-18页
        2.2.3 凝胶排阻色谱分离第18-19页
        2.2.4 蛋白浓度测定第19页
    2.3 AADH-WT晶体初步筛选第19-20页
    2.4 AADH-WT的晶体优化第20-21页
    2.5 AADH-WT晶体的衍射数据收集与处理第21-23页
        2.5.1 蛋白晶体的冷冻保护剂选择第21-22页
        2.5.2 衍射数据的采集第22-23页
    2.6 AADH-WT结构解析第23-31页
        2.6.1 结构解析的方法简介第23-25页
        2.6.2 反常散射法解析相角信息第25-28页
        2.6.3 AADH-WT结构评价第28-29页
        2.6.4 AADH-WT的整体结构第29-30页
        2.6.5 AADH-WT突变位点的作用第30-31页
    2.7 本章小结第31-33页
第三章 E310G/A314Y的表达、纯化、结晶与结构解析第33-45页
    3.1 E310G/A314Y的表达第33页
    3.2 E310G/A314Y的纯化第33-35页
        3.2.1 细胞破碎第33页
        3.2.2 Ni-NTA亲和层析纯化第33-34页
        3.2.3 凝胶排阻色谱分离第34页
        3.2.4 蛋白浓度测定第34-35页
    3.3 E310G/A314Y晶体初步筛选第35页
    3.4 E310G/A314Y晶体优化第35页
    3.5 E310G/A314Y晶体的衍射数据收集与处理第35-36页
        3.5.1 蛋白晶体的冷冻保护剂的选择第35页
        3.5.2 衍射数据的采集第35-36页
    3.6 E310G/A314Y结构解析第36-39页
        3.6.2 AADHE310G/A314Y的整体结构第37-38页
        3.6.3 突变位点附近的相互作用第38-39页
    3.7 E310G/A314Y-NADP+复合物数据收集与解析第39-44页
        3.7.1 E310G/A314Y-NADP+复合物晶体筛选与优化第39-40页
        3.7.2 E310G/A314Y-NADP+结晶数据收集第40-41页
        3.7.3 E310G/A314Y-NADP+复合物结构解析第41-43页
        3.7.4 E310G/A314Y-NADP+结构评价第43页
        3.7.5 E310G/A314Y-NADP+复合物结构第43-44页
    3.8 本章小结第44-45页
第四章 催化与突变机理研究第45-53页
    4.1 野生型AADH与突变体结构对比第45-46页
    4.2 E310G/A314Y与复合物结构对比第46-47页
    4.3 AADH-WT与NADP+的模拟结合第47-48页
    4.4 AADH-WT的分子对接第48-49页
    4.5 E310G/A314Y的分子对接第49-50页
    4.6 各对接底物与活性中心的距离第50-51页
    4.7 反应的机理第51-52页
    4.8 本章小结第52-53页
第五章 总结与展望第53-55页
参考文献第55-57页
附录A 实验材料与方法第57-63页
    A.1实验仪器第57-58页
    A.2实验材料第58-61页
    A.3实验方法第61-63页
        A.3.1 普通感受态细胞的制备与转化第61-62页
        A.3.2 超级感受态细胞DH5α的制备和转化第62页
        A.3.3 蛋白质的小量表达测试第62-63页
附录B Abbreviation缩略语表第63-65页
致谢第65-66页

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