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单核细胞增多性李斯特菌精氨酸和鲱精胺脱亚胺酶的抗酸应激机制及其调控

目录第6-10页
摘要第10-14页
ABSTRACT第14-20页
第一部分第21-60页
    第一章 单核细胞增多性李斯特菌的毒力因子与感染机制第22-41页
        1. 单增李斯特菌概述第22-25页
        2. 单增李斯特菌胞内感染过程第25-26页
        3. 单增李斯特菌的毒力因子第26-36页
            3.1 黏附侵袭因子第26-33页
            3.2 胞内增殖与迁移因子第33-36页
        4. 单增李斯特菌的毒力调控因子第36-41页
            4.1 PrfA调控因子第36-38页
            4.2 SigB调控因子第38-39页
            4.3 双元调控系统第39页
            4.4 毒力调控相关的Small RNAs第39-41页
    第二章 单核细胞增多性李斯特菌的抗酸应激作用第41-60页
        1. 酸耐受性应答反应(Acid tolerance response,ATR)第41-44页
        2. 单增李斯特菌抗酸应激相关系统第44-50页
            2.1 谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylase,GAD)系统第45-48页
            2.2 FoF_1-ATPase第48-49页
            2.3 其他酸应激相关机制或分子第49-50页
        3. 酸应激转录组与蛋白质组学研究第50-52页
        4. 抗酸应激调控机制第52-56页
            4.1 应激调控因子SigB(σ~B)第53-56页
            4.2 双元调控系统LisRK第56页
        5. 本研究目的第56-60页
第二部分第60-188页
    第一章 单增李斯特菌不同菌株抗酸应激能力比较第62-81页
        第一节 单增李斯特菌不同菌株对有机酸和无机酸敏感性差异第62-71页
            摘要第62-63页
            1. 材料与方法第63-65页
                1.1 菌株及培养条件第63页
                1.2 主要试剂和仪器第63页
                1.3 生长曲线测定第63-64页
                1.4 致死性酸环境中存活率比较第64-65页
            2. 结果第65-71页
                2.1 pH 5.5和4.5酸环境中的生长能力比较第65-70页
                2.2 致死性酸应激下的存活能力比较第70-71页
        第二节 单增李斯特菌胞内pH的动态变化研究第71-79页
            摘要第71-73页
            1. 材料与方法第73-74页
                1.1 菌株及培养条件第73页
                1.2 主要试剂和仪器第73页
                1.3 细菌标记第73页
                1.4 细胞内pH(pH_i)标准曲线的建立第73-74页
                1.5 不同酸应激下的pH_i动态变化测定第74页
            2. 结果第74-79页
                2.1 pH_i与Ratio_(490/435)标准曲线第74-75页
                2.2 不同菌株在pH 3.5~5.5应激下的pH_i动态变化第75-79页
        第三节 讨论第79-81页
            1. 单增李斯特菌pH_i测定体系第79页
            2. 单增李斯特菌抗酸应激能力的菌株间差异性第79-80页
            3. 有机酸和无机酸的抑菌效应差异第80-81页
    第二章 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶抗酸应激机制第81-112页
        第一节 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶表达及抗体制备第81-92页
            摘要第81-83页
            1. 材料与方法第83-87页
                1.1 菌株及培养条件第83页
                1.2 质粒和主要试剂第83页
                1.3 生物信息学分析第83-84页
                1.4 重组表达质粒构建第84页
                1.5 重组ADI蛋白表达及多克隆抗体制备第84-87页
            2. 结果第87-92页
                2.1 不同细菌ADI基因和编码蛋白的生物信息学分析第87-90页
                2.2 重组质粒pET30a-ADI的鉴定第90页
                2.3 重组ADI蛋白表达纯化及抗体效价第90-92页
        第二节 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶介导抗酸应激和毒力第92-110页
            摘要第92-93页
            1. 材料与方法第93-104页
                1.1 菌株、细胞及培养条件第93页
                1.2 质粒、主要试剂和仪器第93-94页
                1.3 arcA基因缺失株和回补株的构建第94-97页
                1.4 基因转录和蛋白表达水平变化分析第97-100页
                1.5 生长试验第100页
                1.6 人工胃液和小鼠胃内存活试验第100-101页
                1.7 全菌ADI活性分析第101-102页
                1.8 细菌胞内pH(pH_i)测定第102-103页
                1.9 细胞及小鼠脾脏内增殖试验第103-104页
            2. 结果第104-110页
                2.1 arcA基因缺失株和回补株的鉴定第104-105页
                2.2 酸应激后arcA基因转录和蛋白表达水平均显著上调第105-106页
                2.3 arcA介导细菌在酸性环境中的生长能力第106页
                2.4 arcA介导细菌在人工胃液和小鼠胃内的抗酸应激第106-108页
                2.5 arcA具备精氨酸脱亚胺酶活性第108-109页
                2.6 arcA不介导细菌在RAW264.7内增殖第109页
                2.7 arcA参与细菌在小鼠脾脏内的迁移和增殖第109-110页
        第三节 讨论第110-112页
            1. 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶系统第110页
            2. 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶与抗酸应激第110-111页
            3. 单增李斯特菌精氨酸脱亚胺酶与细菌致病力第111-112页
    第三章 单增李斯特菌鲜精胺脱亚胺酶抗酸应激机制第112-156页
        第一节 单增李斯特菌鲜精胺脱亚胺酶生物信息学分析及表达第112-121页
            摘要第112-114页
            1. 材料与方法第114-116页
                1.1 菌株及培养条件第114页
                1.2 质粒和主要试剂第114页
                1.3 生物信息学分析第114-115页
                1.4 重组表达质粒构建第115页
                1.5 重组AguA1和AguA2蛋白的表达第115-116页
            2. 结果第116-121页
                2.1 不同来源AgDI的生物信息学分析第116-119页
                2.2 重组AguA1和AguA2表达质粒的鉴定第119-120页
                2.3 重组AguA1和AguA2蛋白的表达与纯化第120-121页
        第二节 单增李斯特菌鲜精胺脱亚胺酶的抗酸应激功能第121-127页
            摘要第121-122页
            1. 材料与方法第122-124页
                1.1 菌株及培养条件第122页
                1.2 质粒、主要试剂和仪器第122页
                1.3 基因缺失株与回补株的构建第122-123页
                1.4 基因的转录水平变化第123-124页
                1.5 人工胃液和小鼠胃内存活试验第124页
            2. 结果第124-127页
                2.1 缺失株和回补株的鉴定第124-125页
                2.2 酸应激后aguA1和aguA2基因转录水平均显著上调第125页
                2.3 aguA1而非aguA2介导细菌在人工胃液和小鼠胃内抗酸应激第125-127页
        第三节 单增李斯特菌双拷贝鲱精胺脱亚胺酶的活性差异机制第127-153页
            摘要第127-128页
            1. 材料与方法第128-137页
                1.1 菌株及培养条件第128页
                1.2 质粒和主要试剂第128-129页
                1.3 重组AguA1和AguA2蛋白定点突变及其表达第129-132页
                1.4 AguA1和AguA2的活性比较第132-133页
                1.5 AguA1的酶活动力学分析第133-135页
                1.6 AguA1底物特异性分析第135-136页
                1.7 AguA1酶活性影响因素分析第136-137页
                1.8 AguA1和AguA2突变体蛋白的活性分析第137页
            2. 结果第137-153页
                2.1 AguA1和AguA2突变体蛋白的测序验证第137页
                2.2 AguA1和AguA2突变体蛋白的表达及纯化第137-143页
                2.3 AguA1而非AguA2具备鲱精胺脱亚胺酶活性第143-144页
                2.4 AguA1具备高底物特异性第144-145页
                2.5 AguA1具备最适反应温度和pH第145-146页
                2.6 AguA1的酶活动力学参数第146-147页
                2.7 AguA1活性受金属离子和温度影响第147-148页
                2.8 AguA1和AguA2突变体蛋白的活性分析第148-151页
                2.9 AguA1的催化机理第151-153页
        第四节 讨论第153-156页
            1. 单增李斯特菌具备双拷贝鲱精胺脱亚胺酶第153页
            2. 单增李斯特菌AguA1和AguA2的抗酸应激差异机制第153-156页
    第四章 单增李斯特菌精氨酸抑制因子调控抗酸应激机制第156-188页
        第一节 单增李斯特菌精氨酸抑制因子及相关基因分析和表达第156-167页
            摘要第156-158页
            1. 材料与方法第158-160页
                1.1 菌株及培养条件第158页
                1.2 质粒和主要试剂第158-159页
                1.3 ArgR及其相关基因启动子区分析第159页
                1.4 重组表达质粒构建第159-160页
                1.5 重组蛋白表达纯化及多克隆抗体制备第160页
                1.6 重组ArgR蛋白多聚体分析第160页
            2. 结果第160-167页
                2.1 生物信息学结果第160-164页
                2.2 重组表达质粒的鉴定第164-165页
                2.3 重组ArgR、SigB和ArgG蛋白的表达与纯化第165-167页
        第二节 单增李斯特菌精氨酸抑制因子调控抗酸应激机制第167-183页
            摘要第167-169页
            1. 材料与方法第169-173页
                1.1 菌株及培养条件第169页
                1.2 质粒和主要试剂第169页
                1.3 基因缺失株和回补株的构建第169-170页
                1.4 重组ArgR蛋白的关键氨基酸位点突变及其表达第170-171页
                1.5 凝胶迁移阻滞试验(EMSA)第171-172页
                1.6 gfp3报告载体的构建与分析第172-173页
                1.7 基因转录和蛋白表达水平分析第173页
                1.8 酸应激存活及巨噬细胞增殖第173页
            2. 结果第173-183页
                2.1 缺失株和回补株的鉴定第173-174页
                2.2 ArgR及其突变体蛋白与相关基因启动子的结合第174-176页
                2.3 ArgR对argG、arcA和sigB基因启动子强度的调控第176-178页
                2.4 ArgR调控argC、argG、arcA和sigB基因的转录第178-179页
                2.5 ArgR调控ArgG、ArcA和SigB蛋白的表达第179-181页
                2.6 ArgR影响细菌的酸应激存活能力第181页
                2.7 ArgR影响细菌在RAW264.7内的增殖能力第181-183页
        第三节 讨论第183-188页
            1. 单增李斯特菌ArgR具备该家族调控因子特性第183页
            2. 单增李斯特菌ArgR调控抗酸应激机制第183-188页
全文结论第188-190页
创新点第190-192页
展望第192-194页
参考文献第194-216页
主要名词缩写第216-218页
作者简介第218-220页
攻读博士期间的科研成果第220-222页
致谢第222-223页

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