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基于恒温指数扩增技术高灵敏度检测mRNA及DNA甲基化

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第1章 绪论第12-54页
    1.1 基因突变概述第13-27页
        1.1.1 DNA突变研究进展第13-27页
    1.2 mRNA概述第27-37页
        1.2.1 mRNA的加工第28页
        1.2.2 mRNA的检测第28-37页
    1.3 DNA甲基化概述第37-45页
        1.3.1 用于发现未知的表观遗传变化的检测技术第38-40页
        1.3.2 用于分析特定调节区或基因内的DNA甲基化第40-45页
    1.4 恒温指数扩增技术概述第45-50页
        1.4.1 EXPAR的特点第46-47页
        1.4.2 EXPAR的应用第47-50页
    1.5 本论文的研究内容及创新点第50-54页
第2章 基于GlaI-EXPAR的高灵敏度DNA甲基化分析第54-74页
    2.1 前言第54-56页
    2.2 实验部分第56-59页
        2.2.1 试剂与仪器第56-57页
        2.2.2 从癌细胞HCT116中提取基因组DNA第57-58页
        2.2.3 非甲基化DNA模板和甲基化DNA模板的制备第58-59页
        2.2.4 标准的GlaI-EXPAR反应体系第59页
    2.3 结果与讨论第59-72页
        2.3.1 基于GlaI-EXPAR的方法检测甲基化DNA的原理第59-61页
        2.3.2 基于GlaI-EXPAR检测位点特异性甲基化DNA的可行性分析第61-63页
        2.3.3 GlaI核酸内切酶的量对检测DNA甲基化的影响第63-64页
        2.3.4 Nt.BstNBI切刻内切酶量的优化第64页
        2.3.5 Vent (exo-) DNA聚合酶量的优化第64-65页
        2.3.6 EXPAR反应温度的优化第65-66页
        2.3.7 GlaI-EXPAR测定法检测目标M的性能的分析第66-69页
        2.3.8 检测癌细胞中基因组DNA提取物中的甲基化DNA第69-70页
        2.3.9 GlaI-EXPAR测定法用于甲基化分析的通用性评估第70-72页
    2.4 本章小结第72-74页
第3章 基于竞争杂交核酸探针的RNase H-EXPAR方法检测单碱基突变mRNA第74-90页
    3.1 引言第74-76页
    3.2 实验部分第76-78页
        3.2.1 实验试剂和材料第76-77页
        3.2.2 从癌细胞中提取总RNA第77页
        3.2.3 标准的基于单碱基错配热力学差异的RNase H-EXPAR检测mRNA单碱基突变的反应体系第77-78页
    3.3 结果与讨论第78-88页
        3.3.1 基于单碱基错配的热力学差异的RNase H-EXPAR检测mRNA突变的原理第78-80页
        3.3.2 基于单碱基错配热力学差异的RNase H-EXPAR方法检测单碱基突变mRNA的可行性的分析第80页
        3.3.3 酶切温度对检测mRNA突变的影响第80-82页
        3.3.4 Vent (exo-) DNA聚合酶量的优化第82-83页
        3.3.5 Nt.BstNBI切刻内切酶量的优化第83-84页
        3.3.6 EXPAR反应温度的优化第84-85页
        3.3.7 基于单碱基错配的热力学差异的RNase H-EXPAR检测突变mRNA的性能分析第85-86页
        3.3.8 基于单碱基错配的热力学差异的RNase H-EXPAR检测突变mRNA的特异性分析第86页
        3.3.9 基于竞争性杂交探针的RNase H-EXPAR检测突变mRNA的原理第86-88页
        3.3.10 基于竞争性杂交探针的RNase H-EXPAR检测突变mRNA的特异性分析第88页
    3.4 本章小结第88-90页
结论第90-92页
参考文献第92-117页
致谢第117-118页
科研成果第118页

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