| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 前言 | 第10-25页 |
| 1.1 转录组学及转录组测序技术 | 第10-13页 |
| 1.1.1 转录组与转录组学 | 第10页 |
| 1.1.2 转录组测序技术研究进展 | 第10-13页 |
| 1.2 全长转录组测序技术及应用 | 第13-16页 |
| 1.2.1 全长转录组测序技术原理 | 第14-15页 |
| 1.2.2 全长转录组测序技术应用 | 第15-16页 |
| 1.3 线粒体转录组作图研究 | 第16-20页 |
| 1.4 蝗虫生物防治与资源利用 | 第20-21页 |
| 1.4.1 蝗虫生物防治研究进展 | 第20-21页 |
| 1.4.2 蝗虫资源利用研究进展 | 第21页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第21-25页 |
| 1.5.1 三种直翅目物种简介 | 第21-23页 |
| 1.5.2 研究目的与意义 | 第23-25页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第25-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.1.1 标本采集与鉴定 | 第25页 |
| 2.1.2 主要实验仪器 | 第25页 |
| 2.1.3 主要实验试剂盒 | 第25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-34页 |
| 2.2.1 实验准备 | 第25-26页 |
| 2.2.2 三种蝗虫实验标本处理 | 第26页 |
| 2.2.3 蝗虫总RNA提取 | 第26-27页 |
| 2.2.4 PacBio RSII cDNA文库构建及测序 | 第27-34页 |
| 第3章 三种蝗虫全长转录组分析 | 第34-88页 |
| 3.1 全长转录组生物信息学分析方法 | 第34-40页 |
| 3.1.1 三代转录组测序数据处理 | 第35-36页 |
| 3.1.2 转录本结构分析 | 第36-38页 |
| 3.1.3 转录本表达量分析 | 第38-39页 |
| 3.1.4 全长转录本差异表达分析 | 第39页 |
| 3.1.5 差异表达转录本功能注释和富集分析 | 第39-40页 |
| 3.2 中华稻蝗全长转录组数据全局分析 | 第40-49页 |
| 3.2.1 总RNA质量检测 | 第40页 |
| 3.2.2 三代测序数据产量统计 | 第40-42页 |
| 3.2.3 lncRNA鉴定与定量分析 | 第42-43页 |
| 3.2.4 蛋白质编码区预测结果统计 | 第43页 |
| 3.2.5 转录本功能注释结果统计 | 第43-48页 |
| 3.2.6 差异表达结果统计 | 第48-49页 |
| 3.3 中华剑角蝗全长转录组全局分析 | 第49-63页 |
| 3.3.1 总RNA质量检测 | 第49页 |
| 3.3.2 三代测序数据统计 | 第49-51页 |
| 3.3.3 lncRNA鉴定与差异分析 | 第51-52页 |
| 3.3.4 蛋白质编码区预测结果统计 | 第52页 |
| 3.3.5 转录本功能注释结果统计 | 第52-57页 |
| 3.3.6 差异表达结果统计 | 第57-63页 |
| 3.4 短额负蝗全长转录组全局分析 | 第63-77页 |
| 3.4.1 总RNA质量检测 | 第63-64页 |
| 3.4.2 三代测序数据统计 | 第64-65页 |
| 3.4.3 lncRNA鉴定与差异分析 | 第65-67页 |
| 3.4.4 蛋白质编码区预测结果统计 | 第67页 |
| 3.4.5 转录本功能注释结果统计 | 第67-71页 |
| 3.4.6 差异表达结果统计 | 第71-77页 |
| 3.5 功能基因挖掘 | 第77-84页 |
| 3.5.1 免疫和生长发育相关基因筛选 | 第77-82页 |
| 3.5.2 营养相关基因筛选 | 第82-84页 |
| 3.6 小结与讨论 | 第84-88页 |
| 第4章 线粒体全长转录组分析 | 第88-98页 |
| 4.1 线粒体全长转录组分析方法 | 第88页 |
| 4.2 中华稻蝗线粒体全长转录组分析结果 | 第88-91页 |
| 4.3 中华剑角蝗线粒体全长转录组分析结果 | 第91-93页 |
| 4.4 短额负蝗线粒体全长转录组分析结果 | 第93-96页 |
| 4.5 小结与讨论 | 第96-98页 |
| 第5章 结论 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-114页 |
| 致谢 | 第114-116页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第116页 |