摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-19页 |
1.1 代谢组学 | 第10-13页 |
1.1.1 代谢组学的概念 | 第10-11页 |
1.1.2 代谢组学的特点 | 第11页 |
1.1.3 代谢组学的研究策略 | 第11-12页 |
1.1.4 代谢组学的样本种类与收集 | 第12-13页 |
1.1.5 代谢组学的应用 | 第13页 |
1.2 化学信息学在代谢组学中的应用 | 第13-14页 |
1.3 代谢综合征(metabolic syndrome,MetS) | 第14-17页 |
1.3.1 代谢综合征简介 | 第14-15页 |
1.3.2 代谢综合征的诊断标准 | 第15页 |
1.3.3 代谢综合征的流行病学 | 第15-16页 |
1.3.4 代谢综合征的病理生理机制 | 第16-17页 |
1.4 本论文的研究内容 | 第17-19页 |
第二章 系统地评估样本从收集到储存过程中各因素对血清代谢指纹图谱的影响 | 第19-28页 |
2.1 引言 | 第19页 |
2.2 实验部分 | 第19-21页 |
2.2.1 仪器与试剂 | 第19-20页 |
2.2.2 样本收集和预处理 | 第20页 |
2.2.3 气相色谱-质谱(GC-MS)条件 | 第20页 |
2.2.4 数据分析 | 第20-21页 |
2.3 结果与讨论 | 第21-27页 |
2.3.1 重复性考察 | 第21-22页 |
2.3.2 样本收集过程中对代谢轮廓的影响 | 第22-24页 |
2.3.3 离心时间对代谢轮廓的影响 | 第24页 |
2.3.4 储存条件对代谢轮廓的影响 | 第24-25页 |
2.3.5 重复冷冻解冻循环对代谢轮廓的影响 | 第25-26页 |
2.3.6 讨论和结果 | 第26-27页 |
2.4 本章小结 | 第27-28页 |
第三章 基于质谱的两种研究手段全面分析大鼠血清血浆的代谢指纹图谱 | 第28-44页 |
3.1 引言 | 第28-29页 |
3.2 实验部分 | 第29-31页 |
3.2.1 仪器与试剂 | 第29页 |
3.2.2 样本收集 | 第29-30页 |
3.2.3 质量控制(Quality Control,QC)样本的制备 | 第30页 |
3.2.4 血清血浆样本的制备 | 第30页 |
3.2.5 盐空白样本的制备 | 第30页 |
3.2.6 GC-MS中样本的衍生 | 第30-31页 |
3.2.7 LC-QTOF-MS中样本的重组 | 第31页 |
3.3 仪器分析和数据预处理 | 第31-32页 |
3.3.1 GC-MS分析 | 第31页 |
3.3.2 LC-QTOF-MS分析 | 第31-32页 |
3.3.3 数据预处理和统计学分析 | 第32页 |
3.4 结果与讨论 | 第32-43页 |
3.4.1 基于GC-MS比较大鼠血清血浆的代谢指纹图谱 | 第32-37页 |
3.4.2 基于LC-QTOF-MS比较大鼠血清血浆的代谢指纹图谱 | 第37-43页 |
3.5 本章小结 | 第43-44页 |
第四章 基于GC-MS的代谢组学和随机森林方法研究代谢综合征 | 第44-56页 |
4.1 引言 | 第44-46页 |
4.2 实验部分 | 第46-48页 |
4.2.1 仪器与试剂 | 第46页 |
4.2.2 样本收集 | 第46页 |
4.2.3 样本的预处理 | 第46页 |
4.2.4 质控(Quality Control,QC)样本的制备 | 第46-47页 |
4.2.5 GC-MS条件 | 第47页 |
4.2.6 MZmine数据预处理 | 第47页 |
4.2.7 随机森林(Random forest,RF) | 第47-48页 |
4.3 结果与讨论 | 第48-55页 |
4.3.1 主成分分析 | 第48-52页 |
4.3.2 生物标记物的发现 | 第52-55页 |
4.4 本章小结 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-65页 |
攻读学位期间主要研究成果 | 第65-66页 |
致谢 | 第66页 |