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十字花科黑腐病菌Ⅲ型分泌系统hrp基因致病功能分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 前言第11-36页
    1.1 植物病原菌简介第11-16页
        1.1.1 植物病原菌的分类第11-15页
            1.1.1.1 罗尔斯通氏菌属(Ralstonia)第12页
            1.1.1.2 土壤杆菌属(Agrobacterium)第12-13页
            1.1.1.3 欧文氏菌属(Erwinia)第13页
            1.1.1.4 假单胞菌属(Pseudomonas)第13-14页
            1.1.1.5 黄单胞菌属(Xanthomonas)第14页
            1.1.1.6 木质部小菌属(Xylella)第14-15页
        1.1.2 十字花科黑腐病菌表型特征及相关分类第15页
        1.1.3 十字花科黑腐病菌8004遗传学研究概况第15-16页
    1.2 植物与病原菌分子机理研究第16-21页
        1.2.1 植物病原菌致病相关因子第16-19页
            1.2.1.1 胞外多糖(extracellular polysaccharides,EPS)第17页
            1.2.1.2 脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)第17页
            1.2.1.3 胞外酶(Extracellular enzymes)第17-18页
            1.2.1.4 植物毒素(phytotoxin)第18页
            1.2.1.5 Ⅲ型效应物(T3SS effectors,T3SEs)第18-19页
        1.2.2 植物病原菌致病相关基因第19-21页
            1.2.2.1 hrp基因第19-20页
            1.2.2.2 avr/R基因第20-21页
            1.2.2.3 dsp基因第21页
    1.3 植物病原菌分泌机制第21-23页
        1.3.1 Ⅰ 型分泌系统(Type Ⅰ Sectetion System,T1SS)第22页
        1.3.2 Ⅱ 型分泌系统(Type Ⅱ Sectetion System,T2SS)第22页
        1.3.3 Ⅲ 型分泌系统(Type Ⅲ Sectetion System,T3SS)第22页
        1.3.4 Ⅳ 型分泌系统(Type Ⅳ Sectetion System,T4SS)第22-23页
        1.3.5 Ⅴ 型分泌系统(Type Ⅴ Sectetion System,T5SS)第23页
        1.3.6 Ⅵ 型分泌系统(Type Ⅵ Sectetion System,T6SS)第23页
    1.4 Ⅲ型分泌系统及其分子机制第23-26页
        1.4.1 T3SS的组成第24-25页
        1.4.2 T3SS的分泌机制第25页
        1.4.3 T3SS与致病性的关系第25-26页
    1.5 hrp基因概况第26-35页
        1.5.1 hrp的组成及功能第26-27页
        1.5.2 hrp调控机理第27-28页
        1.5.3 hrp基因的相关研究进展第28-30页
        1.5.4 hrp研究概况第30-35页
            1.5.4.1 Xcc 8004 hrp基因的组成第30-31页
            1.5.4.2 Xcc 8004 hrp基因功能研究进展第31-35页
    1.6 本研究的内容和意义第35-36页
        1.6.1 研究内容第35页
        1.6.2 研究意义第35-36页
第二章 材料与方法第36-60页
    2.1 实验材料第36-45页
        2.1.1 菌株与质粒第36-42页
        2.1.2 培养基与培养条件第42-43页
            2.1.2.1 大肠杆菌(E.coli)第42页
            2.1.2.2 黄单胞菌第42-43页
        2.1.3 菌种保藏第43页
        2.1.4 抗生素及其他试剂第43-45页
        2.1.5 其他实验材料第45页
    2.2 实验方法第45-60页
        2.2.1 细菌核酸的制备第45-48页
            2.2.1.1 质粒的提取(碱裂解法)第45-46页
            2.2.1.2 总DNA的提取第46页
            2.2.1.3 细菌总RNA的提取第46-47页
                2.2.1.3.1 总RNA的提取第46-47页
                2.2.1.3.2 总RNA中的DNA消化反应第47页
            2.2.1.4 cDNA的合成第47-48页
        2.2.2 琼脂糖凝胶电泳第48页
        2.2.3 引物设计第48页
        2.2.4 PCR扩增DNA片段第48-49页
            2.2.4.1 PCR反应第48-49页
            2.2.4.2 RT-PCR第49页
        2.2.5 DNA操作第49-50页
            2.2.5.1 DNA酶切第49-50页
            2.2.5.2 DNA连接第50页
            2.2.5.3 DNA纯化与回收第50页
        2.2.6 感受态细胞的制备与转化第50-52页
            2.2.6.1 电击法转化大肠杆菌第50-51页
            2.2.6.2 Cacl_2法转化大肠杆菌第51-52页
        2.2.7 DNA测序第52页
        2.2.8 三亲本接合第52-53页
        2.2.9 植株实验第53-55页
            2.2.9.1 致病性检测第53-54页
            2.2.9.2 定性HR第54页
            2.2.9.3 定量HR第54-55页
        2.2.10 细菌在寄主中的生长繁殖第55-56页
        2.2.11 缺失突变体的构建第56-57页
            2.2.11.1 缺失突变体所用载体及原理第56-57页
                2.2.11.1.1 所用载体第56-57页
                2.2.11.1.2 原理第57页
        2.2.12 构建缺失突变体技术路线第57-58页
        2.2.13 构建互补菌株技术路线第58-60页
第三章 结果与分析第60-87页
    3.1 Xcc 8004各hrp基因缺失突变体的构建第60-70页
        3.1.1 DM3005缺失突变体的构建第60-70页
    3.2 突变体的反式功能互补第70-79页
        3.2.1 c3005互补菌株的构建第70页
        3.2.2 其余hrp基因互补菌株的构建第70-79页
    3.3 植株实验结果第79-82页
        3.3.1 各hrp基因突变体及互补菌株在寄主萝卜上的致病性结果第79-80页
        3.3.2 各hrp基因突变体及互补菌株在寄主甘蓝上的致病性结果第80-81页
        3.3.3 各hrp基因突变体及互补菌株HR结果第81-82页
    3.4 Xcc 8004各hrp基因的转录与调控第82-83页
    3.5 XC3014基因对不同效应物转运的影响第83-85页
        3.5.1 XC2081和XC3014双缺失突变体的构建第83-84页
        3.5.2 已鉴定的9个效应物基因导入DM20813014的HR反应检测第84-85页
    3.6 质粒丢失实验结果第85-87页
第四章 总结与讨论第87-91页
    4.1 总结第87页
    4.2 关于hrp基因的功能研究第87-88页
    4.3 关于互补问题第88页
    4.4 关于hrp基因表达调控第88-89页
    4.5 关于hpaP基因第89页
    4.6 关于XC3024基因第89-90页
    4.7 展望第90-91页
参考文献第91-105页
附录第105-110页
致谢第110-111页
攻读硕士学位期间发表论文情况第111页

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